Настройки

Укажите год
-

Небесная энциклопедия

Космические корабли и станции, автоматические КА и методы их проектирования, бортовые комплексы управления, системы и средства жизнеобеспечения, особенности технологии производства ракетно-космических систем

Подробнее
-

Мониторинг СМИ

Мониторинг СМИ и социальных сетей. Сканирование интернета, новостных сайтов, специализированных контентных площадок на базе мессенджеров. Гибкие настройки фильтров и первоначальных источников.

Подробнее

Форма поиска

Поддерживает ввод нескольких поисковых фраз (по одной на строку). При поиске обеспечивает поддержку морфологии русского и английского языка
Ведите корректный номера.
Ведите корректный номера.
Ведите корректный номера.
Ведите корректный номера.
Укажите год
Укажите год
Применить Всего найдено 258729. Отображено 200.
17-01-2023 дата публикации

ОДНОВРЕМЕННОЕ РЕДАКТИРОВАНИЕ ГЕНОВ И ИНДУКЦИЯ ГАПЛОИДОВ

Номер: RU2788349C2
Автор: КЕЛЛИХЕР Тимоти (US), ЦЮЭ Цюдэн (US)
Принадлежит: ЗИНГЕНТА ПАРТИСИПЕЙШНС АГ (CH)

Изобретение относится к области биохимии, в частности к способу редактирования геномной ДНК растения. Изобретение позволяет эффективно трансформировать линии гаплоидов с тем, чтобы она кодировала клеточный механизм, способный редактировать гены. 17 з.п. ф-лы, 11 табл., 24 ил., 11 пр.

Подробнее
Номер записи: 1
29-09-2023 дата публикации

Набор STR-маркеров Y-хромосомы для определения этно-территориального происхождения индивида по образцу его ДНК

Номер: RU2804433C2
Автор: Степанов Вадим Анатольевич (RU), Харьков Владимир Николаевич (RU), Колесников Никита Александрович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» (RU), Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук (ИОГен РАН) (RU)

Изобретение относится к биотехнологии, молекулярной генетике и может быть использовано для выявления генотипов для идентификации личности и определения этнической принадлежности человека по образцу его ДНК с помощью системы микросателлитных ДНК-маркеров Y-хромосомы. Представлен набор генетических маркеров. Набор содержит синтетические олигонуклеотидные праймеры, представляющие собой нуклеотидные последовательности SEQ ID NO: 1-70 и определяющие 38 коротких тандемных повторов, локализованных на нерекомбинирующем участке Y-хромосомы (DYS19, DYS385a, DYS385b, DYS389I, DYS389II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS437, DYS438, DYS439, DYS442, DYS445, DYS448, DYS449, DYS456, DYS458, DYS460, DYS481, DYS504, DYS505, DYS518, DYS525, DYS533, DYS537, DYS552, DYS570, DYS576, DYS635, DYS 643, YCAIIa, YCAIIb, GATA-H4.1, Y-GATA-A10, GGAAT1B07, DYF387a, DYF387b). Предложен способ выявления генотипов для идентификации личности в российской популяции с использованием вышеуказанных праймеров. Выбранные микросателлитные ...

Подробнее
Номер записи: 2
31-10-2023 дата публикации

СПОСОБ ПРОГНОЗА МЕТАСТАЗИРОВАНИЯ ОПУХОЛЕЙ РАКА ЖЕЛУДКА

Номер: RU2806432C2
Автор: Кипкеева Фатимат Магомедовна (RU), Карпухин Александр Васильевич (RU), Музаффарова Татьяна Александровна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова» (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Описан способ прогноза метастазирования опухолей рака желудка, включающий стадии получения образцов тканей опухоли рака желудка и нормальной слизистой ткани желудка, выполнение обратной транскрипции микроРНК из группы miR-34a, miR-146a, miR-335 и miR-590 и мРНК группы генов VEGFR1, VEGFR2, NRP1, определение уровней экспрессии вышеперечисленных микроНРК и мРНК, сравнение уровней экспрессии вышеперечисленных микроРНК и мРНК относительно нормальной слизистой ткани желудка и произведение определения прогноза риска метастазирования опухоли рака желудка. Технический результат изобретения заключается в расширении возможностей прогнозирования отдаленных метастазов рака желудка и повышении достоверности этого прогнозирования за счет исследования экспрессии микроРНК и генов. 7 з.п. ф-лы, 2 ил., 6 табл., 6 пр.

Подробнее
Номер записи: 3
10-11-2002 дата публикации

ЛЮЦИФЕРАЗЫ

Номер: RU2192467C2
Автор: СКВИРЕЛЛ Дэвид Джеймс (GB), МЮРРЕЙ Джеймс Огустус Генри (GB), ВАЙТ Питер Джон (GB), ЛОУЭ Кристофер Робин (GB)
Принадлежит: МИНИСТР ОБОРОНЫ ОБЪЕДИНЕННОГО КОРОЛЕВСТВА ВЕЛИКОБРИТАНИИ И СЕВЕРНОЙ ИРЛАНДИИ (GB)

Изобретение относится к области биохимии и генетической инженерии и может быть использовано в люминометрических анализах для измерения уровней АТФ. Путем замены остатка глутаминовой кислоты в консервативной области 354-361 аминокислотной последовательности люциферазы Photinus pyralis или в соответствующей области фермента, обладающего более чем 60%-ной гомологией последовательности с люциферазой Photinus pyralis, любым другим аминокислотным остатком, кроме глицина, пролина и аспартата, получены белки с люциферазной активностью и повышенной по сравнению с природным ферментом термостабильностью. Предпочтительными являются модифицированные формы люцифераз, дополнительно содержащие в положении, соответствующем 215 аминокислотному остатку последовательности люциферазы Photinus pyralis, остаток гидрофобной аминокислоты. Предложены последовательности ДНК, которые при экспрессии в хозяйской клетке обеспечивают получение указанных модифицированных форм люцифераз, пригодных для использования при ...

Подробнее
Номер записи: 4
18-07-2023 дата публикации

Способ получения молекулярных аутосомных STR-маркеров человека для идентификации неизвестного индивида, набор олигонуклеотидов для его осуществления, способ идентификации неизвестного индивида

Номер: RU2800087C2
Автор: Кузнецова Ирина Львовна (RU), Кунижева Светлана Станиславовна (RU), Андреева Татьяна Владимировна (RU), Тяжелова Татьяна Владимировна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук (ИОГен РАН) (RU)

Изобретение относится к области молекулярной биологии, биотехнологии, судебной медицины и криминалистики, генетическим исследованиям в области идентификации человека. Представлен способ получения молекулярных аутосомных STR-маркеров человека для идентификации неизвестного индивида и набор синтетических олигонуклеотидных праймеров для проведения мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР). Набор для генотипирования включает композицию, образованную 34 парами синтетических оригинальных олигонуклеотидных праймеров для локусов в геноме человека, включающих выбранные 34 аутосомных STR-маркера, что позволяет проводить мультиплексную ПЦР с последовательностями праймеров SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 68. Синтетические олигонуклеотидные праймеры подобраны таким образом, чтобы успешно амплифицировать выбранные локусы в ходе одной мультиплексной реакции и последующего секвенирования методом «массового параллельного секвенирования» (NGS). Представлен способ идентификации неизвестного индивида. Изобретение ...

Подробнее
Номер записи: 5
10-08-2002 дата публикации

СПОСОБ ВЫПОЛНЕНИЯ МАНИПУЛЯЦИИ С ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬЮ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ, УСТРОЙСТВО ДЛЯ ПРОВЕДЕНИЯ МАНИПУЛЯЦИЙ НА ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ, ПРОТОЧНЫЙ СОСУД, ТВЕРДЫЙ НОСИТЕЛЬ ДЛЯ ИММОБИЛИЗАЦИИ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ, ТВЕРДЫЙ НОСИТЕЛЬ, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ НОСИТЕЛЯ ДЛЯ ИММОБИЛИЗАЦИИ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ

Номер: RU2186852C2
Автор: МИНТЕР Стефен (GB)
Принадлежит: ТЕПНЕЛ МЕДИКАЛ ЛИМИТЕД (GB)

Способ применим, в частности для анализа медицинских проб. Способ проведения манипуляции последовательностью нуклеиновой кислоты предусматривает обеспечение системы твердого носителя, с которым связан одноцепочечный олигонуклеотид, комплементарный специфической последовательности на нуклеиновой кислоте-мишени, более длинной, чем данный олигонуклеотид, добавление источника одноцепочечной нуклеиновой кислоты-мишени к системе твердого носителя, гибридизацию нуклеиновой кислоты-мишени с олигонуклеотидом и проведение манипуляции на гибридизованной нуклеиновой кислоте-мишени. Манипуляция может представлять собой, например, копирование или амплификацию последовательности нуклеиновой кислоты-мишени. В предпочтительном варианте обеспечен носитель в проточном сосуде, который облегчает промывание носителя для удаления примесей и оставления "чистой" пробы нуклеиновой кислоты-мишени, на которой может быть проведена манипуляция. Предпочтительно носитель имеет силоксановый матрикс, с которым связан олигонуклеотид ...

Подробнее
Номер записи: 6
17-04-2020 дата публикации

ОЦЕНКА АКТИВНОСТИ КЛЕТОЧНЫХ СИГНАЛЬНЫХ ПУТЕЙ С ПРИМЕНЕНИЕМ ВЕРОЯТНОСТНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ ЦЕЛЕВЫХ ГЕНОВ

Номер: RU2719194C2
Автор: АЛВЕС ДЕ ИНДА Марсия (NL), ВАН ДЕ СТОЛЬПЕ Аня (NL), ДУЛЛА Кальяна Чакравартхи (NL), ХОФФМАНН Ральф (NL), ВАН ОЙЕН Хендрик Ян (NL), ВЕРХАГ Вильхельмус Франсискус Йоханнес (NL)
Принадлежит: КОНИНКЛЕЙКЕ ФИЛИПС Н.В. (NL)

Настоящая группа изобретений относится к биоинформатике. Предложен способ определения активности клеточного сигнального пути на основе уровней экспрессии по меньшей мере трех целевых генов, а также устройство для осуществления такого способа. Данная группа изобретений может найти применение в диагностике различных заболеваний. 2 н. и 8 з.п. ф-лы, 42 ил., 12 табл., 16 пр.

Подробнее
Номер записи: 7
20-12-2004 дата публикации

ГОМОГЕННЫЙ АНАЛИЗ ДУПЛЕКСНОЙ ИЛИ ТРИПЛЕКСНОЙ ГИБРИДИЗАЦИИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МНОЖЕСТВЕННЫХ ИЗМЕРЕНИЙ ПРИ ВАРЬИРУЕМЫХ УСЛОВИЯХ

Номер: RU2242518C2
Автор: ПИКАР Пьер (CA), ЭРИКСОН Глен Х. (GB), ДЭКСИС Джэсмин И. (CA)
Принадлежит: ИНДЖИНИЕС КОРПОРЕЙШН (BB)

Изобретение относится к способам секвенирования и анализа нуклеиновых кислот. Предложен способ анализа последовательность-специфической гибридизации. Способ предусматривает взаимодействие мишени, содержащей последовательность нуклеиновой кислоты, и зонда, содержащего последовательность нуклеиновой кислоты или аналог нуклеиновой кислоты. Далее к указанной тест-пробе прикладывают первый стимул и детектируют сигнал от стимулированной тест-пробы. Полученный сигнал коррелирует с аффинностью связывания между мишенью и зондом. Затем проводят калибрование первого сигнала относительно первого контрольного сигнала и на его основании определяют степень соответствия между мишенью и зондом. Далее прикладывают второй стимул к тест-пробе и детектируют его сигнал. Второй сигнал также коррелирует с аффинностью связывания мишени и зонда. Затем калибруют второй сигнал относительно второго контрольного сигнала и на его основании определяют степень соответствия мишени и зонда. Далее проводят количественное ...

Подробнее
Номер записи: 8
18-01-2017 дата публикации

ЛЕЧЕНИЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ, СВЯЗАННЫХ С ПИРРОЛИН-5 КАРБОКСИЛАТРЕДУКТАЗОЙ 1(PYCR1), ПУТЕМ ИНГИБИРОВАНИЯ ПРИРОДНОГО АНТИСМЫСЛОВОГО ТРАНСКРИПТА К PYCR1

Номер: RU2608496C2
Автор: ХОРКОВА ШЕРМАН Ольга (US), КОЛЛАРД Джозеф (US)
Принадлежит: КУРНА, ИНК. (US)

Изобретение относится к биохимии. Описан способ повышения экспрессии полинуклеотида пирролин-5-карбоксилатредуктазы 1(PYCR1) в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro, включающий: приведение указанных клеток или тканей в контакт с олигонуклеотидом, в частности с олигонуклеотидом малой интерферирующей РНК (миРНК), составляющим в длину от 20 до 30 нуклеотидов, который специфически гибридизуется с и нацелен на участок природного антисмыслового PYCR1. Представлен синтетический олигонуклеотид, составляющий 20-30 нуклеотидов в длину, содержащий необязательные модификации, причем указанные модификации выбраны из: по меньшей мере одного модифицированного фрагмента сахара; по меньшей мере одной модифицированной межнуклеотидной связи; по меньшей мере одного модифицированного нуклеотида; и их комбинаций; причем указанный олигонуклеотид специфичен для и специфически гибридизуется с природным антисмысловым полинуклеотидом PYCR1 и повышает экспрессию полинуклеотида PYCR1, имеющего последовательность ...

Подробнее
Номер записи: 9
03-04-2024 дата публикации

СПОСОБЫ И КОМПОЗИЦИИ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ЛИГАНДОВ НА МАТРИЦАХ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ИНДЕКСОВ И ШТРИХКОДОВ

Номер: RU2816708C2
Автор: БЕРТИ, Лоренцо (US), СЕГЕЙЛ, Даррен (US), ЛЕОНГ, Сью Хонг (US), БЛЭК, Фиона Э. (US), ФИШЕР, Джеффри (US), БРОДИН, Джеффри Деннис (US)
Принадлежит: ИЛЛЮМИНА, ИНК. (US)

Изобретение относится к биотехнологии. Описан способ обнаружения множества лигандов-мишеней в матрице, включающий: (а) получение субстрата, имеющего матрицу гранул, распределенных на поверхности указанного субстрата, причем указанная матрица гранул содержит первую и вторую субпопуляцию гранул, включающее: (i) получение первой и второй субпопуляций гранул, причем каждая гранула содержит: зонд захвата, который способен специфично связываться с лигандом-мишенью, первый полинуклеотид, который содержит штрихкод и сайт связывания праймера на 3′-конце относительно указанного штрихкода, при этом указанный штрихкод указывает на зонд захвата, и второй полинуклеотид, содержащий индекс и сайт связывания праймера индекса на 3′-конце относительно индекса, причем каждый индекс первой субпопуляции гранул отличается от каждого индекса второй субпопуляции гранул, (ii) обеспечение специфичного связывания первых лигандов-мишеней с указанными зондами захвата указанной первой субпопуляции гранул в первом реакционном ...

Подробнее
Номер записи: 10
20-10-2005 дата публикации

СПОСОБ ОТБОРА ЖИВОТНЫХ ПО ПРИЗНАКАМ, НАСЛЕДУЕМЫМ ПО МЕХАНИЗМУ РОДИТЕЛЬСКОГО ИМПРИНТИНГА

Номер: RU2262229C2
Автор: АНДЕРССОН Лейф (SE), НЕЗЕР Карин Даниель Андре (BE), СПИНСЕМАЙЛЛЕ Герт (BE), ЖОРЖ Мишель (BE)
Принадлежит: МЕЛИКА ХБ (SE), ЮНИВЕРСИТИ ОФ ЛЬЕЖ (BE), СЕГЕРСГЕНТЕК Н.В. (BE)

Изобретение относится к области биотехнологии. Способ предусматривает анализ образца генетического материала, взятого от свиньи, на присутствие локуса количественных признаков (QTL), локализованного в хромосоме 2 Sus scrofa, в положении 2р1.7, как было установлено при картировании. Отбирают свиней, имеющих нужные генотипические свойства. Способ позволяет повысить эффективность селекции. 3 с. и 19 з.п. ф-лы, 10 ил., 2 табл.

Подробнее
Номер записи: 11
17-01-2020 дата публикации

СПОСОБ КОЛИЧЕСТВЕННОГО МОНИТОРИНГА ЭНДОСПОР В ВОДНОЙ СРЕДЕ БУМАЖНЫХ ИЛИ КАРТОННЫХ ФАБРИК

Номер: RU2711412C2
Автор: КОЛАРИ Марко (FI), ЛАУРАЕУС Марко (FI), РИИХИНЕН Калле (FI), АХОЛА Юхана (FI)
Принадлежит: КЕМИРА ОЙЙ (FI)

Изобретение относится к биотехнологии. Предложен способ количественного мониторинга бактериальных эндоспор в водной среде бумажных и картонных фабрик. Способ включает отбор двух водных проб промышленной водной среды; в первой пробе разрушают вегетативные формы бактерий путем нагрева не менее чем 60°С, добавляют интеркалирующий агент, инкубируют в темноте в течение 1-30 мин, определяют уровень эндоспор с использованием количественной полимеразной цепной реакции. Проводят сравнение уровня эндоспор из первой пробы с количеством вегетативных бактериальных клеток во второй пробе. Результаты используют для корректировки режима введения биоцидов для контроля эндоспор. Способ обеспечивает контроль микробиологического состояния процессов в бумажном или картонном производстве. 9 з.п. ф-лы, 3 табл., 3 пр.

Подробнее
Номер записи: 12
21-09-2020 дата публикации

КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ДЛЯ КОЛИЧЕСТВЕННОГО ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ В ОБРАЗЦЕ

Номер: RU2732589C2
Автор: ШЭФФЕР Дэниэл (US), ДЖУДИС Стивен А. (US)
Принадлежит: ИНВАЙРОЛОДЖИКС ИНК. (US)

Изобретение относится к области биотехнологии, в частности представлены композиции и способы выявления и количественного определения целевого олигонуклеотида в образце в режиме реального времени. Эти способы совместимы с целевыми олигонуклеотидами, амплифицируемыми с помощью NEAR-реакции. 3 н. и 12 з.п. ф-лы, 10 ил., 3 пр.

Подробнее
Номер записи: 13
18-09-2024 дата публикации

СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ГИДРОГЕЛЯ С ТЕРМООТЩЕПЛЯЕМЫМИ НУКЛЕИНОВЫМИ КИСЛОТАМИ

Номер: RU2826936C2
Автор: Чудинов Александр Васильевич (RU), Шершов Валерий Евгеньевич (RU), Василисков Вадим Александрович (RU), Заседателев Александр Сергеевич (RU), Лапа Сергей Анатольевич (RU), Кузнецова Виктория Евгеньевна (RU), Иконникова Анна Юрьевна (RU), Наседкина Татьяна Васильевна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук (ИМБ РАН) (RU)

Настоящее изобретение относится к способу получения гидрогеля с иммобилизованными нуклеиновыми кислотами, включающему: а) изготовление твердой полимерной подложки из полиэтилентерефталата с фотоактивной поверхностью; б) получение ячеек кросс-сшитой модифицированной агарозы: гидрогелиевых ячеек, связанных ковалентными связями с полимерной подложкой, где модификацию агарозы проводят хлоруксусной кислотой в щелочных условиях с последующим введением фрагмента метакриловой кислоты с помощью ангидрида метакриловой кислоты, а затем проводят обработку бромуксусной кислотой и триэтиламином с последующим образованием связанного с агарозой полигликолевого линкера с концевой карбоксильной группой; в) иммобилизация в гидрогелиевые ячейки нуклеиновых кислот. Настоящее изобретение обеспечивает разработку более эффективного способа изготовления полимерной подложки с фотоактивной поверхностью и введения в природный полимер, агарозу, химических групп, придающих агарозе новые дополнительные свойства, с сохранением ...

Подробнее
Номер записи: 14
24-03-2020 дата публикации

СПОСОБ, КОМПОЗИЦИЯ И НАБОР ДЛЯ СТАБИЛИЗАЦИИ ДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ В БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБРАЗЦАХ

Номер: RU2717644C2
Автор: ДУКАНИН Евгений Владимирович (CA), ПОЦЦА Линдсай (CA), БИРНБОИМ Химан Чаим (CA), МЕРИНО ЭРНАНДЕС Карлос Альберто (CA)
Принадлежит: ДиЭнЭй Генотек Инк. (CA)

Группа изобретений относится к биотехнологии, в частности к области стабилизации дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) человека и микроорганизмов, присутствующей в сложных биологических образцах, таких как фекалии. Предложены способ, водная композиция и набор для стабилизации ДНК, содержащейся в фекалиях или образце, загрязненном фекалиями, при температуре окружающей среды. Указанный биологический образец приводят в контакт с водной композицией, содержащей хелатирующее средство, выбранное из этилендиаминтетрауксусной кислоты (EDTA) или 1,2-циклогександиаминтетрауксусной кислоты (CDTA), в концентрации от приблизительно 150 мМ до приблизительно 600 мМ и имеющей рН от 9,5 до 11,5. Полученную смесь гомогенизируют и хранят при температуре окружающей среды. Группа изобретений обеспечивает быстрый и эффективный захват и стабилизацию ДНК и «мгновенную фиксацию» профилей суммарной ДНК в биологических образцах при температуре окружающей среды в течение длительных периодов времени. 3 н. и 47 з.п. ф-лы ...

Подробнее
Номер записи: 15
01-10-2019 дата публикации

Способ проведения ПЦР в реальном времени для генотипирования крупного рогатого скота по аллелям А и В гена CSN3

Номер: RU2701648C2
Автор: Ржанова Ирина Владимировна (RU), Юльметьева Юлиана Рустэмовна (RU), Шакиров Шамиль Касымович (RU), Вафин Рамиль Ришадович (RU), Тюлькин Сергей Владимирович (RU), Муратова Александра Владимировна (RU), Зиннатова Фарида Фатиховна (RU)
Принадлежит: Вафин Рамиль Ришадович (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии и генетики сельскохозяйственных животных. Предложен способ проведения ПЦР в реальном времени для генотипирования крупного рогатого скота по аллелям А и В гена CSN3, в котором используют 5'-флуоресцентно-меченый прямой А-аллель-специфический праймер CSN3-A: 5'-FAM-ACTGTAGCTACTCTAGACGA-3', 5'-флуоресцентно-меченый прямой B-аллель-специфический праймер CSN3-B: 5'-VIC-ACTGTAGCTACTCTAGATGC-3', обратный общий праймер CSN3-R: 5'-GCTCTCAATAACTTCTGGAGAA-3', анти-праймер CSN3-S, меченый гасителем флуоресценции с 3'-конца олигонуклеотида: 5'-TCTAGAGTAGCTACAGT-3'-BHQ1. Изобретение позволяет эффективно осуществить генотипирование крупного рогатого скота по гену CSN3 на основе ПЦР в реальном времени в формате гибридизационно-флуоресцентной детекции. 2 ил., 1 табл.

Подробнее
Номер записи: 16
18-01-2017 дата публикации

ЛЕЧЕНИЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ, СВЯЗАННЫХ С NANOG, ПУТЕМ ИНГИБИРОВАНИЯ ПРИРОДНОГО АНТИСМЫСЛОВОГО ТРАНСКРИПТА NANOG

Номер: RU2608493C2
Автор: ХОРКОВА ШЕРМАН Ольга (US), КОЛЛАРД Джозеф (US)
Принадлежит: КУРНА, ИНК. (US)

Изобретение относится к биохимии. Описаны способы повышения экспрессии полинуклеотида NANOG с помощью олигонуклеотидов длиной от 19 до 30 нуклеотидов. Описаны соответствующие олигонуклеотиды и композиция, содержащая их. Также описан способ предотвращения или лечения заболевания, ассоциированного с по меньшей мере одним полинуклеотидом NANOG и/или по меньшей мере одним продуктом, кодируемым указанным полинуклеотидом, включающий: введение пациенту терапевтически эффективной дозы по меньшей мере одного описанного олигонуклеотида. 9 н. и 26 з.п. ф-лы, 1 ил., 1 табл., 2 пр.

Подробнее
Номер записи: 17
02-02-2017 дата публикации

Модифицированный вариант гена LacZ из E. coli, кодирующий стабилизированный вариант белка, для использования в качестве транскрипционного репортера в Yarrowia lipolytica

Номер: RU2609646C2
Автор: Кудыкина Юлия Константиновна (RU), Дерябина Юлия Ивановна (RU), Секова Варвара Юрьевна (RU), Трубникова Елена Владимировна (RU), Эпова Екатерина Юрьевна (RU), Зылькова Марина Валерьевна (RU), Исакова Елена Павловна (RU), Белоус Александр Сергеевич (RU), Диссанаяке Джаявира Гаспералалаге Лашодя Виндана Диссанаяке (RU), Гусева Марина Александровна (RU), Баловнева Мария Владимировна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Курский государственный университет" (ФГБОУ ВПО "КГУ") (RU)

Настоящее изобретение относится к биохимии, в частности к способу модификации гена LacZ из. Для осуществления способа фрагмент ДНК, содержащий кодирующую область гена LacZ, нарабатывают с помощью полимеразной цепной реакции с использованием олигонуклеотидного праймера, позволяющего ввести дополнительный кодон GGA, кодирующий глицин, непосредственно после инициаторного кодона ATG. Настоящий способ позволяет адаптировать указанный ген для его экспрессии в клетках. 2 ил., 2 табл.

Подробнее
Номер записи: 18
15-02-2021 дата публикации

РЕПРЕЗЕНТАТИВНАЯ ДИАГНОСТИКА

Номер: RU2743169C2
Автор: БАРХОУМИ, Аоун (US), СТАНИСЛАВ, Стейси (US), УОЛК, Эрик (US), АЛЕКСАНДЕР, Нельсон (US), ЛИТ, Кэтрин (US), РОБЕРТС, Эстебан (US), ГАЛЛЕГОС, Лиза (US), ДЭЙ, Мелинда (US), РАЖКОВИЧ, Саманта (US)
Принадлежит: ВЕНТАНА МЕДИКАЛ СИСТЕМЗ, ИНК. (US)

Изобретение относится к диагностике, а именно к способу приготовления образца опухолевой ткани. Способ приготовления образца опухолевой ткани для определения фенотипического профиля образца опухолевой ткани, который включает: гомогенизацию образца опухолевой ткани; реконструирование гомогенизированного образца с получением гомогената, причем указанный гомогенат содержит по существу гомогенные клеточные структуры, где соотношение клеточных структур в подгруппе гомогената по существу аналогично или равно соотношению клеточных структур в образце ткани; анализ клеточных структур гомогената; определение фенотипического профиля опухолевой ткани. Вышеописанный способ позволяет повысить обнаружение мутаций из раковых тканей по сравнению с гистологическими срезами, взятыми из FFPE блоков той же самой ткани. 55 ил., 24 табл., 12 пр.

Подробнее
Номер записи: 19
01-11-2021 дата публикации

Участки генов и гены, ассоциированные с повышенной урожайностью у растений

Номер: RU2758718C2
Автор: БЕНСЕН Роберт Джон (US), УОРНЕР Тодд Ли (US), ЭРСЁЗ Эльхан Султан (US), МАГВАЙР Майкл Малон (US), ВЕБЕР Эллисон Линн (US)
Принадлежит: ЗИНГЕНТА ПАРТИСИПЕЙШНС АГ (CH)

Изобретение относится к области биохимии, в частности к способу идентификации растения маиса, характеризующегося повышенной урожайностью. Изобретение позволяет эффективно увеличить урожайность растения маиса. 7 з.п. ф-лы, 12 табл., 6 ил., 3 пр.

Подробнее
Номер записи: 20
09-09-2019 дата публикации

СПОСОБ И УСТРОЙСТВО ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ФРАКЦИИ ВНЕКЛЕТОЧНЫХ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ В БИОЛОГИЧЕСКОМ ОБРАЗЦЕ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ

Номер: RU2699728C2
Автор: ЮЙАНЬ Юйин (CN), ЦЗЯН Фумань (CN), ВАН Вэй (CN), ИНЬ Е (CN)
Принадлежит: БиДжиАй ДЖЕНОМИКС КО., ЛТД. (CN)

Изобретение относится к биотехнологии. Предложен способ определения фракции внеклеточной нуклеиновой кислоты в биологическом образце. Способ включает: (1) секвенирование нуклеиновых кислот биологического образца, содержащего свободные нуклеиновые кислоты, для получения результатов секвенирования для множества данных секвенирования; (2) определение на основе результатов секвенирования количества молекул нуклеиновой кислоты с длиной, попадающей в пределы заданного диапазона, определяя отношение свободных нуклеиновых кислот в биологическом образце. 6 н. и 13 з.п. ф-лы, 16 ил., 8 табл., 3 пр.

Подробнее
Номер записи: 21
17-06-2019 дата публикации

СПОСОБ ГЕРМЕТИЗАЦИИ ВЕЩЕСТВА

Номер: RU2691694C2
Автор: ЯМАУТИ Лиза (JP), НОДЗИ Хироюки (JP)
Принадлежит: ЯПОНСКОЕ АГЕНТСТВО ПО НАУКЕ И ТЕХНИКЕ (JP)

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложен способ герметизации вещества в выполненном на субстрате множестве ячеек. Способ включает введение содержащего вещество гидрофильного растворителя на субстрат, введение гидрофобного растворителя с удельным весом больше удельного веса гидрофильного растворителя на гидрофильный растворитель, где по меньшей мере один из гидрофильного растворителя и гидрофобного растворителя содержит поверхностно-активное вещество. Причём на субстрате выполнено множество способных хранить только одну частицу вещества и отделенных одна от другой боковой стенкой ячеек, вещества представляют собой микробусину, нуклеиновую кислоту, белок, вирус, клетка или липидный мембранный комплекс. Изобретение обеспечивает эффективную герметизацию большего числа веществ. 4 з.п. ф-лы, 2 ил., 2 табл.

Подробнее
Номер записи: 22
11-07-2022 дата публикации

Способ амплификации нуклеиновых кислот тяжелой и легкой цепи человеческих иммуноглобулинов для создания рекомбинантных антител, композиции праймеров (варианты)

Номер: RU2775914C2
Автор: Фирстова Виктория Валерьевна (RU), Силкина Марина Владимировна (RU), Рябко Алена Константиновна (RU), Шкуратова Мария Андреевна (RU), Марьин Максим Александрович (RU), Зенинская Наталья Алексеевна (RU), Шемякин Игорь Георгиевич (RU), Карцева Алена Сергеевна (RU), Романенко Яна Олеговна (RU)
Принадлежит: Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии, в частности к способу амплификации нуклеиновых кислот тяжелой и легкой цепи человеческих иммуноглобулинов. Изобретение позволяет снижать вероятность ложноотрицательной амплификации, повышая вероятность успешной амплификации кДНК антител с редко встречающимися аллелями V генных сегментов. 16 ил., 6 пр.

Подробнее
Номер записи: 23
06-06-2022 дата публикации

УСТРОЙСТВО ДЛЯ ОБРАБОТКИ РЕАКЦИИ

Номер: RU2773528C2
Автор: ТАКЭУТИ Хидэмицу (JP), КАВАГУТИ Осаму (JP), ФУКУДЗАВА Такаси (JP)
Принадлежит: НИППОН ШИТ ГЛАС КАМПАНИ, ЛИМИТЕД (JP)

Устройство 100 для проведения реакции, включающее в себя: сосуд 10 для проведения реакции, включающий в себя канал 12, первое входное воздушное коммуникационное отверстие 24 и второе входное воздушное коммуникационное отверстие 26; систему 102 управления температурой, которая обеспечивает область 38 с низкой температурой и область 36 с высокой температурой в канале 12; и систему 120 подачи жидкости, которая перемещает образец 50 внутри канала 12. Система 120 подачи жидкости включает в себя: насос 121, имеющий выпускное отверстие 121a; первый воздушный канал 129, который соединяет выпускное отверстие 121a и первое входное воздушное коммуникационное отверстие 24; второй воздушный канал 130, который соединяет выпускное отверстие 121a и второе входное воздушное коммуникационное отверстие 26; первый трехходовой клапан 123, способный переключаться между состоянием, в котором первое входное воздушное коммуникационное отверстие 24 сообщается с выпускным отверстием 121a, и состоянием, в котором ...

Подробнее
Номер записи: 24
24-09-2020 дата публикации

СПОСОБ МОЛЕКУЛЯРНОГО МАРКИРОВАНИЯ, ОСНОВАННЫЙ НА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСАХ, ПРЕДНАЗНАЧЕННЫЙ ДЛЯ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ПАСПОРТИЗАЦИИ СЕЛЕКЦИОННЫХ ДОСТИЖЕНИЙ РАСТЕНИЙ РОДА RUBUS

Номер: RU2732922C2
Автор: Лебедев Вадим Георгиевич (RU), Видягина Елена Олеговна (RU), Шестибратов Константин Александрович (RU), Субботина Наталья Михайловна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Пущинский государственный естественно-научный институт" (ПущГЕНИ) (RU)

Изобретение относится к области биохимии, в частности к способу идентификации сортов малины, ежевики и малино-ежевичных гибридов на основе микросателлитных (SSR) маркеров. Изобретение позволяет эффективно идентифицировать сорта малины. 1 з.п. ф-лы, 5 ил., 1 табл., 3 пр.

Подробнее
Номер записи: 25
24-03-2020 дата публикации

ПРАЙМЕРЫ И ЗОНДЫ ДЛЯ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS

Номер: RU2717655C2
Автор: ЧАКРАВОРТИ Сумитеш (US), АЛЛАНД Дэвид (US)
Принадлежит: РУТГЕРС, ЗЕ СТЕЙТ ЮНИВЕРСИТИ ОФ НЬЮ-ДЖЕРСИ (US)

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложен зонд, состоящий из выделенной нуклеиновой кислоты, для обнаружения, обладающей лекарственной устойчивостью, содержащий последовательность зонда, которая по меньшей мере на 85% идентична последовательности, выбранной из перечисленных в Таблице 2, а также соответствующие набор и способ обнаружения, обладающей лекарственной устойчивостью. Изобретение может быть использовано в медицине. 3 н. и 18 з.п. ф-лы, 3 ил., 5 табл., 7 пр.

Подробнее
Номер записи: 26
11-09-2017 дата публикации

СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ЗАБОЛЕВАНИЯ, СОПРОВОЖДАЮЩЕГОСЯ ПОВЫШЕННОЙ ГИБЕЛЬЮ КЛЕТОК, И НАБОР ДЛЯ ЕГО ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ

Номер: RU2630648C2
Автор: Мельников Анатолий Александрович (RU)
Принадлежит: ОБЩЕСТВО С ОГРАНИЧЕННОЙ ОТВЕТСТВЕННОСТЬЮ "БИОМАРКЕР-РУ" (RU)

Настоящее изобретение относится к биохимии, в частности к способу диагностики заболеваний, сопровождающихся повышенной гибелью клеток, и набору для его осуществления. Для осуществления указанного способа получают образец плазмы крови у человека, затем проводят изотермическую амплификацию нуклеиновых кислот плазмы крови. Далее осуществляют очистку нуклеиновых кислот из реакционной смеси и проводят количественный анализ нуклеиновых кислот методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Определяют коэффициент К в пробах. Далее сравнивают коэффициент К с референсным значением и диагностируют заболевание, сопровождающееся повышенной гибелью клеток, при значении коэффициента К менее референсного значения. Настоящее изобретение позволяет проводить малоинвазивную диагностику заболеваний, сопровождающихся повышенной гибелью клеток, с высокой чувствительностью, на любых стадиях заболевания, в том числе на ранних стадиях, при которых клинические симптомы отсутствуют. 2 н. и 50 з.п.

Подробнее
Номер записи: 27
17-11-2017 дата публикации

ОТБОР БОЛЬНЫХ РАКОМ ДЛЯ ВВЕДЕНИЯ ИНГИБИТОРОВ СИГНАЛЬНОГО ПУТИ Wnt НА ОСНОВАНИИ СТАТУСА МУТАЦИИ RNF43

Номер: RU2636000C2
Автор: НГ Николас (US), ЦУН Фэн (US), ЛЮ Цзюнь (US), ХАО Хуайсян (US), ХСИЕХ Хсин-и (US), ЦЗЯН Сяомо (US)
Принадлежит: НОВАРТИС АГ (CH), АйАрЭм ЭлЭлСи (BM)

Изобретение относится к области биохимии. Описана группа изобретений, включающая способ прогнозирования чувствительности роста опухолевых клеток к подавлению ингибитором Wnt, набор для анализа, предназначенный для отбора больного раком, у которого согласно прогнозу может быть достигнут или не достигнут благоприятный результат от терапевтического введения ингибитора Wnt. Способ прогнозирования включает в себя стадии: определения в полученном у субъекта образце опухолевых клеток уровня биомаркера; сравнения уровня биомаркера в образце опухолевых клеток с контрольным уровнем биомаркера; отбора субъекта, у которого согласно прогнозу должен быть достигнут благоприятный результат от терапевтического введения ингибитора Wnt. Изобретение расширяет арсенал способов прогнозирования роста опухолевых клеток. 2 н. и 23 з.п. ф-лы, 8 ил., 10 табл., 4 пр.

Подробнее
Номер записи: 28
27-07-2010 дата публикации

ОПРЕДЕЛЕНИЕ ХРОМОСОМНЫХ АНОМАЛИЙ В КЛЕТКАХ, ПОЛУЧЕННЫХ ИЗ ФОЛЛИКУЛЯРНОЙ ЖИДКОСТИ

Номер: RU2395584C2
Автор: ПАТКИ Амит (IN), ШЕВАЛЕ Лата (IN), САКСЕНА Шаиладжа Гада (IN)
Принадлежит: РЕЛАЙАНС ЛАЙФ САЙЕНСИЗ ПВТ ЛТД (IN)

Изобретение относится к биотехнологии. Описан способ идентификации аномалии репродуктивной системы, представляющей собой анеуплоидию, включающий в себя получение соматических клеток из фолликулярной жидкости у человека и выполнение генетического анализа указанных клеток, где идентификация по меньшей мере одной хромосомной аномалии в части клеток указывает на слабовыраженный гонадный мозаицизм. Представлен способ анализа повышенного риска бесплодия, вызванного анеуплоидией, у млекопитающего, предпочтительно, человека, включающий в себя получение соматических клеток из фолликулярной жидкости животного и выполнение генетического анализа клеток, где идентификация по меньшей мере слабовыраженного гонадного мозаицизма в части клеток указывает на наличие повышенного риска бесплодия. Изобретение позволяет идентифицировать и диагностировать хромосомные аномалии, например, слабо выраженный мозаицизм. 2 н. и 18 з.п. ф-лы, 10 ил., 7 табл.

Подробнее
Номер записи: 29
13-12-2018 дата публикации

НОВЫЕ ЛЮЦИФЕРАЗЫ И СПОСОБЫ ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ

Номер: RU2674894C2
Автор: Ямпольский Илья Викторович (RU)
Принадлежит: Общество с ограниченной ответственностью "Планта" (RU)

Группа изобретений относится к биохимии. Предложена нуклеиновая кислота, кодирующая люциферазу или ее функциональный фрагмент и выбранная из группы, состоящей из нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, характеризующийся аминокислотной последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32 или 34, нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, имеющий последовательность, которая по крайней мере на 65% идентична аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32 или 34, и нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, в состав которого входит консенсусная последовательность SEQ ID NO: 35. Предложены также люцифераза или ее функциональный фрагмент, кодируемые указанной нуклеиновой кислотой. Также предложены экспрессионная кассета, клетка-хозяин, трансгенный организм, содержащие указанные молекулы нуклеиновых кислот. Кроме того, предложены набор для мечения организмов и способ мечения ...

Подробнее
Номер записи: 30
08-02-2018 дата публикации

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ГЕНА АРИЛОКСИАЛКАНОАТДИОКСИГЕНАЗЫ (AAD-12) В РАСТЕНИЯХ

Номер: RU2644249C2
Автор: ГРИНВАЛЬД Эндрю (US), ЧАННАБАСАВАРАДХЯ Чандра-шекара А. (US)
Принадлежит: ДАУ АГРОСАЙЕНСИЗ ЭлЭлСи (US)

Изобретение относится к области биохимии, в частности к способу обнаружения присутствия гена aad-12 в трансгенном растении сои, содержащем событие pDAB4472-1606. Также раскрыт набор для использования в указанном способе обнаружения присутствия или отсутствия гена aad-12 в геноме растения сои. Изобретение позволяет обнаружить присутствие гена aad-12 в трансгенном растении сои, содержащем событие pDAB4472-1606. 2 н. и 1 з.п. ф-лы, 2 ил., 2 табл., 1 пр.

Подробнее
Номер записи: 31
14-11-2022 дата публикации

ТАГМЕНТАЦИЯ С ПРИМЕНЕНИЕМ ИММОБИЛИЗОВАННЫХ ТРАНСПОСОМ С ЛИНКЕРАМИ

Номер: RU2783536C2
Автор: ЛИ, Цзянь-Сень (US), ШЕН, Кевин (US), СНОУ, Саманта (US), СЛАТТЕР, Эндрю (GB), ДЕСАНТИС, Грейс (US), МОРРЕЛЛ, Натали (GB), ГРОСС, Стивен М. (US)
Принадлежит: ИЛЛЮМИНА ИНК. (US), ИЛЛЮМИНА КЕМБРИДЖ ЛИМИТЕД (GB)

Изобретение относится к области биотехнологии. Описана группа изобретений, включающая комплекс транспосомы для тагментации, композицию для тагментации, модифицированный олигонуклеотид для тагментации, способ получения библиотеки меченых фрагментов нуклеиновых кислот из двухцепочечной целевой нуклеиновой кислоты, способ получения связанного с твердой подложкой комплекса транспосомы, способ получения образца для секвенирования. В одном из вариантов реализации комплекс транспосомы для тагментации содержит транспозазу, первый и второй транспозоны ДНК и расщепляемый линкер. Изобретение расширяет арсенал средств для тагментации. 6 н. и 29 з.п. ф-лы, 12 ил., 7 табл., 9 пр.

Подробнее
Номер записи: 32
14-01-2022 дата публикации

СПОСОБ И СОСТАВ ДЛЯ СТАБИЛИЗАЦИИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ, СВОБОДНЫХ ОТ КЛЕТОК, И КЛЕТОК

Номер: RU2764245C2
Автор: КЭМПЕР, Мартин (DE), КИНИЦ, Тим (DE)
Принадлежит: ЗАРШТЕДТ АГ УНД КО. КГ (DE)

Изобретение относится к композиции для применения в качестве стабилизатора и к способу стабилизации биологических образцов, в частности, цельной крови, в частности, стабилизации содержания и целостности нуклеиновых кислот. Композиция содержит в водном растворе или состоит из по меньшей мере одного буферного вещества, которое забуферивает до значения pH 7 или ниже, предпочтительно от 3,5 до 7,0, по меньшей мере одного хелатирующего вещества для двухвалентных катионов и уротропина, необязательно ПЭГ. 5 н. и 18 з.п. ф-лы, 2 ил., 4 пр.

Подробнее
Номер записи: 33
14-04-2021 дата публикации

ЛЕЧЕНИЕ СВЯЗАННЫХ С ГЕНОМ-СУПРЕССОРОМ ОПУХОЛЕЙ ЗАБОЛЕВАНИЙ ПОСРЕДСТВОМ ИНГИБИРОВАНИЯ ПРИРОДНОГО ТРАНСКРИПТА В АНТИСМЫСЛОВОЙ ОРИЕНТАЦИИ ОТНОСИТЕЛЬНО ЭТОГО ГЕНА

Номер: RU2746478C2
Автор: ХОРЬКОВА ШЕРМАН Ольга (US), КОЛЛАРД Джозеф (US)
Принадлежит: КьюРНА, Инк. (US)

Изобретение относится к области биотехнологии. Описана группа изобретений, включающая способ повышения экспрессии полинуклеотида гена-супрессора опухолей в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro, где полинуклеотид гена-супрессора опухолей кодирует Р53 или Р73, синтетический модифицированный олигонуклеотид для повышения экспрессии полинуклеотида гена-супрессора опухолей in vivo, композицию для повышения экспрессии полинуклеотида гена-супрессора опухолей в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro и способ профилактики или лечения заболевания, связанного с по меньшей мере одним полинуклеотидом гена-супрессора опухолей и/или по меньшей мере одним кодируемым им продуктом, где указанный полинуклеотид гена-супрессора опухолей кодирует Р53 или Р73. Изобретение расширяет арсенал средств для повышения экспрессии полинуклеотида гена-супрессора опухолей в клетках, кодирующего Р53 или Р73. 4 н. и 10 з.п. ф-лы, 13 ил., 1 табл., 2 пр.

Подробнее
Номер записи: 34
07-12-2022 дата публикации

СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ ТОКСИГЕННЫХ Pasteurella multocida МЕТОДОМ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ

Номер: RU2785435C1
Автор: Поболелова Юлия Илдаровна (RU), Яцентюк Светлана Петровна (RU), Козлова Александра Дмитриевна (RU), Красникова Мария Сергеевна (RU), Малик Нина Ивановна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное учреждение "Всероссийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов" (ФГБУ "ВГНКИ") (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии, ветеринарной микробиологии и генетической инженерии и может применяться для детекции токсигенных Pasteurella multocida в различном биологическом материале. Способ включает подготовку образца, выделение ДНК, проведение полимеразной цепной реакции c гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени с использованием набора олигонуклеотидов для совместной амплификации генов kmt1 и toxAPasteurella multocida, содержащего прямые - Pm_F 5'-TGCCACTTGAAATGGGAAATG-3'; toxA_F 5'-CAGTGAAAGCACGGCTGA-3' и обратные -Pm_R 5'-AATAACGTCCAATCAGTTGCG-3'; toxA_R 5'-CATAAGCAGGAAGTTCCCAGT-3' праймеры и флуоресцентно-меченые зонды Pm_Z 5'-R6G-TGTGAGTGGGCTTGTCGGTAGTCT-BHQ-3'; toxA_Z 5’-Cy5-TCAGCGCCTTTTCGCGGATATGCTG-BHQ-3’, и реакционной смеси. Результаты амплификации оценивают с помощью программного обеспечения амплификатора, при этом результаты интерпретируют на основании наличия или отсутствия пересечения кривой флуоресценции с установленной на уровне ...

Подробнее
Номер записи: 35
15-03-2022 дата публикации

Способ выявления и идентификации коронавирусов у крупного рогатого скота

Номер: RU2766344C1
Автор: Котенева Светлана Владимировна (RU), Нефедченко Алексей Васильевич (RU), Глотова Татьяна Ивановна (RU), Глотов Александр Гаврилович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Сибирский федеральный научный центр агробиотехнологий Российской академии наук (СФНЦА РАН) (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложены синтетические олигонуклеотидные праймеры и зонды и способ выявления и идентификации биологических вариантов коронавирусов крупного рогатого скота с помощью синтетических олигонуклеотидных праймеров и зондов на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием гибридизационно-флуоресцентной детекции в режиме реального времени. Предложенный способ включает выделение РНК, проведение обратной транскрипции, исследование каждой пробы проводят методом мультиплексной ПЦР для одновременного выявления двух вариантов вируса BCoV и HCoV-OC43 по гену протеина нуклеокапсида N. Способ обладает высокой чувствительностью, специфичностью и эффективностью при выявлении и идентификации BCoV и HCoV-OC43 в пробах биологического материала от животных. 2 н.п. ф-лы, 1 табл., 1 ил.

Подробнее
Номер записи: 36
12-01-2022 дата публикации

Система CRISPR-Cas14 для выявления РНК вируса SARS-CoV-2 в ультранизких концентрациях

Номер: RU2764020C1
Автор: Преловская Анна Николаевна (RU), Тюменцева Марина Алексеевна (RU), Тюменцев Александр Игоревич (RU), Акимкин Василий Геннадьевич (RU)
Принадлежит: Федеральное бюджетное учреждение науки «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора) (RU)

Группа изобретений относится к области генной инженерии и биотехнологии, а именно к направляющим РНК, рибонуклеопротеиновым комплексам системы CRISPR/Cas, содержащим направляющие РНК, и наборам, содержащим рибонуклеопротеиновые комплексы системы CRISPR/Cas и специфические олигонуклеотиды для предварительной амплификации высококонсервативного участка генома вируса SARS-CoV-2. Изобретения позволяют эффективно выявлять РНК вируса SARS-CoV-2 после проведения специфической амплификации фрагмента генома этого вируса. Изобретения обеспечивают выявление единичных копий РНК вируса SARS-CoV-2. 4 н. и 3 з. п. ф-лы, 16 ил., 5 табл., 5 пр.

Подробнее
Номер записи: 37
01-07-2022 дата публикации

Способ диагностики наследственных мутаций в генах SDHx при каротидных параганглиомах

Номер: RU2775457C1
Автор: Бахтогаримов Ильдар Рамилевич (RU), Старкова Анна Михайловна (RU), Вершинина Юлия Сергеевна (RU), Кудрявцева Анна Викторовна (RU), Краснов Георгий Сергеевич (RU), Савватеева Мария Владимировна (RU), Снежкина Анастасия Владимировна (RU), Головюк Александр Леонидович (RU), Гладыш Наталья Станиславовна (RU), Калинин Дмитрий Валерьевич (RU), Павлов Владислав Сергеевич (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук (ИМБ РАН) (RU)

Изобретение относится к области медицины, а именно к молекулярно-генетическому тестированию. Для диагностики наследственных мутаций в генах SDHx при каротидных параганглиомах проводят иммуногистохимический анализ экспрессии субъединицы SDHB сукцинатдегидрогеназы. Выявление на гистологических препаратах гранулярного цитоплазматического окрашивания опухолевых клеток той же интенсивности по сравнению с окрашиванием эндотелиальных клеток оценивается как положительное. Полное отсутствие цитоплазматического окрашивания по сравнению с интенсивным окрашиванием эндотелиальных клеток оценивается как отрицательное. Равномерное цитоплазматическое окрашивание без определенной зернистости, контрастирующее с сильным зернистым окрашиванием эндотелиальных клеток, оценивается как слабое диффузное. При этом отрицательное или слабое диффузное окрашивание субъединицы SDHB указывает на наличие наследственной мутации в одном из генов SDHx. Способ позволяет диагностировать наследственные каротидные параганглиомы ...

Подробнее
Номер записи: 38
28-07-2020 дата публикации

Номер: RU2017137788A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 39
14-07-2020 дата публикации

Номер: RU2017108757A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 40
29-05-2020 дата публикации

Номер: RU2018113709A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 41
27-01-2020 дата публикации

Номер: RU2018127490A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 42
17-07-2019 дата публикации

Номер: RU2017126968A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 43
02-10-2019 дата публикации

Номер: RU2017135434A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 44
04-03-2019 дата публикации

Номер: RU2017130853A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 45
30-05-2019 дата публикации

Номер: RU2017140978A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 46
20-05-2019 дата публикации

Номер: RU2017113727A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 47
20-10-2020 дата публикации

Номер: RU2018124978A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 48
02-03-2020 дата публикации

Номер: RU2018118967A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 49
11-03-2020 дата публикации

Номер: RU2018118958A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 50
15-10-2018 дата публикации

Номер: RU2017112958A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 51
05-10-2018 дата публикации

Номер: RU2017111097A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 52
12-04-2021 дата публикации

Номер: RU2019103657A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 53
07-04-2021 дата публикации

Номер: RU2019131360A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 54
24-07-2019 дата публикации

Номер: RU2017114675A3
Автор:
Принадлежит:

Подробнее
Номер записи: 55
14-07-2022 дата публикации

Способ выявления ДНК бактерии Mycobacterium tuberculosis с помощью изотермической петлевой амплификации

Номер: RU2776163C1
Автор: Кечин Андрей Андреевич (RU), Филипенко Максим Леонидович (RU), Оскорбин Игорь Петрович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук (ИХБФМ СО РАН) (RU)

Предлагаемое изобретение относится к области биотехнологии и, в частности, к генетической инженерии. Описан способ выявления ДНК бактерии Mycobacterium tuberculosis с помощью изотермической петлевой амплификации. Выделяют ДНК из анализируемой пробы. Проводят изотермическую петлевую амплификацию с помощью олигонуклеотидных праймеров с последующей детекцией результатов амплификации. При этом проводят амплификацию фрагмента ДНК, комплементарного фрагменту мобильного генетического элемента IS6110 геномной ДНК бактерии Mycobacterium tuberculosis праймерами: IS61-c11b CGGAGAATTCCGGTGAGTCCGAGACTCT, IS61-c12b GCCAAAGCTTACCGCCCCGGCATGTCCG, IS6-F3 GTTCTTGGAAAGGATGGGGT, IS6-B3 ATCGACCTGCGCCTGG, IS6-FIP GGATCTCTGCGACCATCCGCTCATCGAGGAGGTACCCG, IS6-BIP CAGCACGATTCGGAGTGGGCACCACTTACGCACCGTCTC, IS6-LF CGCCCGCTCACGCAGC, IS6-LB CGATCAGTGAGGTCGCCC. Кроме того, амплификацию осуществляют, используя большой фрагмент Gss-полимеразы и интеркалирующий флуоресцентный краситель. Детекцию ДНК бактерии Mycobacterium ...

Подробнее
Номер записи: 56
23-03-2022 дата публикации

Способ детекции генотипа Mycobacterium tuberculosis Beijing 1071-32-кластер в формате реального времени

Номер: RU2768021C1
Автор: Герасимова Алена Андреевна (RU), Мокроусов Игорь Владиславович (RU), Огарков Олег Борисович (RU), Ярусова Ирина Владимировна (RU), Бадлеева Мария Владимировна (RU), Вязовая Анна Александровна (RU), Соловьева Наталья Сергеевна (RU), Синьков Вячеслав Владимирович (RU), Пасечник Оксана Александровна (RU), Хромова Полина Андреевна (RU), Жданова Светлана Николаевна (RU), Журавлев Вячеслав Юрьевич (RU)
Принадлежит: Федеральное бюджетное учреждение науки "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера) (RU), Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека" (ФГБНУ НЦ ПЗСРЧ) (RU), федеральное государственное бюджетное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "СПб НИИФ" Минздрава России) (RU)

Изобретение относится к биотехнологии, медицине, а именно к фтизиатрии, и может быть использовано для лабораторного определения микобактерий туберкулеза, относящихся к генотипу Beijing 1071-32-кластер. Выявляют специфическую для микобактерий туберкулеза генотипа Beijing 1071-32-кластер однонуклеотидную замену C>Т в гене Rv0144 в позиции 222 с помощью ПЦР в формате реального времени с использованием специфических флуоресцентно-меченных зондов для дискриминации дикого и мутантного аллелей Rv0144 222С/Т. По каналу флуоресценции FAM (510 нм) регистрируется накопление продукта амплификации фрагмента ДНК, специфического для Beijing 1071-32-кластер, по каналу HEX (555 нм) - фрагмента ДНК, специфического для штамма любого другого генотипа М. tuberculosis. При наличии в образце ДНК штамма Beijing 1071-32-кластер между 20-35 циклами ПЦР происходит экспоненциальный рост сигнала флуоресценции по каналу детекции FAM и при этом отсутствует сигнал флуоресценции по контрольному каналу детекции HEX. Изобретение ...

Подробнее
Номер записи: 57
10-01-2017 дата публикации

Олигонуклеотидные праймеры и флюоресцентный зонд с внутренним гасителем, комплементарные участку гена Р30 (CP204L) вируса африканской чумы свиней, для использования в полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Номер: RU2606253C1
Автор: Малоголовкин Александр Сергеевич (RU), Цыбанов Содном Жамьянович (RU), Титов Илья Андреевич (RU), Кудряшов Дмитрий Андреевич (RU), Бурмакина Галина Сергеевна (RU)
Принадлежит: Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Россельхозакадемии (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к синтетическим олигонуклеотидным зондам и праймерам для выявления ДНК вируса африканской чумы свиней. Предложенные синтетические олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно меченый зонд с внутренним гасителем комплементарны консервативной области гена Р30 (CP204L) вируса африканской чумы свиней и имеют следующий нуклеотидный состав:Предложенное изобретение может быть использовано в генодиагностике инфекционных болезней свиней и ветеринарной вирусологии. 4 табл., 2 пр.

Подробнее
Номер записи: 58
08-09-2021 дата публикации

ОПРЕДЕЛЕНИЕ ФЕНОТИПА НА ОСНОВЕ НЕПОЛНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДАННЫХ

Номер: RU2754884C2
Автор: Никогосов Дмитрий (RU), Данилов Кирилл Алексеевич (RU)
Принадлежит: АТЛАС БИОМЕД ГРУП ЛИМИТЕД (GB)

Предложенная группа изобретений относится к области медицины. Предложен компьютерно-реализуемый способ определения фенотипа пользователя в условиях отсутствия полной генетической информации, выполняемый при помощи по крайней мере одного процессора. Предложена система для определения фенотипа пользователя в условиях отсутствия полной генетической информации с помощью вышеуказанного компьютерно-реализуемого способа. Предложен машиночитаемый носитель данных, который выполнен с возможностью считывания посредством устройства обработки данных и хранящий подлежащие исполнению инструкции для определения фенотипа пользователя в вышеуказанной системе. Предложенная группа изобретений обеспечивает точное определение фенотипа пользователя на основе его неполных генетических данных. 3 н. и 17 з.п. ф-лы, 10 ил., 11 табл., 2 пр.

Подробнее
Номер записи: 59
01-08-2022 дата публикации

Способ преимплантационного генетического тестирования буллезного эпидермолиза

Номер: RU2777086C1
Автор: Исаев Артур Александрович (RU), Мусатова Елизавета Валерьевна (RU), Софронова Яна Владиславовна (RU), Померанцева Екатерина Алексеевна (RU), Жикривецкая Светлана Олеговна (RU), Кушнир Арина Леонидовна (RU)
Принадлежит: Акционерное общество "Центр Генетики и Репродуктивной Медицины "ГЕНЕТИКО" (RU)

Изобретение относится к биотехнологии. Описан способ диагностики моногенного заболевания буллезный эпидермолиз в условиях преимплантационного генетического тестирования (ПГТ). Для этого проводят диагностику патогенных вариантов g.48592390-48592384delGGTGCCA в гене COL7A1 для использования в рамках ПГТ моногенного заболевания буллезный эпидермолиз с возможностью прямой и косвенной диагностики. В рамках способа были показаны высокая специфичность и эффективность, а также универсальность в отношении биообразцов различного типа: единичные клетки, продукт полногеномной амплификации, тотальная ДНК, выделенная из разных тканей. 1 пр.

Подробнее
Номер записи: 60
25-05-2022 дата публикации

ПОРТАТИВНОЕ ЭЛЕКТРОНАГРЕВАТЕЛЬНОЕ УСТРОЙСТВО ДЛЯ ПРОВЕДЕНИЯ ПЕТЛЕВОЙ ИЗОТЕРМИЧЕСКОЙ АМПЛИФИКАЦИИ И ПРИМЕНЕНИЕ ЭТОГО УСТРОЙСТВА

Номер: RU2772743C1
Автор: Позднякова Наталья Вячеславовна (RU), Шевченко Владислав Вячеславович (RU)
Принадлежит: Позднякова Наталья Вячеславовна (RU), Шевченко Владислав Вячеславович (RU)

Изобретение относится к области биохимии, а именно к портативному устройству для проведения петлевой изотермической амплификации и его применению. Портативное устройство содержит корпус из двух частей, верхняя из которых плотно усажена в нижнюю. Устройство содержит вставку в виде двух резиновых цилиндров конусоидальной формы для крепления пробирок, рабочую камеру с датчиком температуры, верхнюю крышку, электронную плату, нижнюю крышку, разъем для электропитания и тены. Плата содержит блок терморегулятора, блок преобразователя, блок контроллера, блок разъема питания, два блока светодиодов синий и красный. 2 н.п. ф-лы, 3 ил.

Подробнее
Номер записи: 61
20-10-1999 дата публикации

СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ МОДУЛИРУЮЩЕГО ДЕЙСТВИЯ ВЕЩЕСТВА НА ЗАВИСИМЫЙ ОТ РЕЦЕПТОРА ИНТЕРЛЕЙКИНА-5 ПУТЬ ПЕРЕДАЧИ СИГНАЛОВ В ЧЕЛОВЕЧЕСКОЙ КЛЕТКЕ ИЛИ КЛЕТКЕ ЖИВОТНОГО

Номер: RU2139936C1
Автор: Ульрике Вайер (DE), Ян Г.Янг (AU), Армин Петер Чернилофски (AT)
Принадлежит: Берингер Ингельгейм Интернациональ ГмбХ (DE)

Изобретение относится к биотехнологии и может быть использовано для выявления веществ с фармакологическим действием. Действие вещества на зависимый от рецептора интерлейкина-5 путь передачи сигналов в человеческой клетке или клетке животного определяют путем инкубирования клеток, трансформированных рекомбинантной ДНК, содержащей репортерный ген и регуляторную последовательность, и экспрессирующих функциональный рецептор интерлейкина-5, с исследуемым веществом и последующего определения концентрации продукта репортерного гена. Избирательность действия исследуемого вещества в отношении зависимого от рецептора нитерлейкина-5 пути передачи сигналов определяют путем инкубирования вещества в идентичных условиях с контрольными клетками, экспрессирующими контрольный рецептор, отличный от рецептора интерлейкина-5, и трансформированными рекомбинантной ДНК, содержащей рецепторный ген и регуляторную последовательность, реагирующую на изменение концентрации вторичного переносчика зависимого от контрольного ...

Подробнее
Номер записи: 62
14-11-2023 дата публикации

Способ выявления химерного транскрипта DNAJB1-PRKACA в клинических образцах ткани пациентов с фиброламеллярной карциномой печени методом полимеразной цепной реакции в реальном времени

Номер: RU2807306C1
Автор: Горев Артем Дмитриевич (RU), Шавочкина Дарья Андреевна (RU), Лазаревич Наталия Леонидовна (RU), Хесина Полина Андреевна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Блохина" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина" Минздрава России) (RU)

Изобретение относится к областям биотехнологии и медицины. Описан способ выявления химерного транскрипта DNAJB1-PRKACA в клинических образцах тканей пациентов с фиброламеллярной карциномой печени методом полимеразной цепной реакции в реальном времени, отличающийся использованием специфических олигонуклеотидных последовательностей - праймеров - SEQ ID NO: 1, NO: 2; SEQ ID NO: 4, NO: 5, дополненный специально адаптированными флуоресцентными зондами SEQ ID NO: 3, ID NO: 6. Изобретение позволяет дифференцировать фиброламеллярные карциномы от других типов опухолей печени для выбора оптимальной тактики лечения специфического заболевания, а также обеспечивает повышение точности диагностики за счет применения оригинальных олигонуклеотидных последовательностей и оптимизированных условий реакций. 2 ил., 7 пр.

Подробнее
Номер записи: 63
22-08-2023 дата публикации

Набор реагентов для определения рибонуклеиновых кислот при диагностике лимфопролиферативных заболеваний

Номер: RU2802064C1
Автор: Горбенко Алексей Сергеевич (RU), Бахтина Варвара Ивановна (RU), Ольховский Игорь Алексеевич (RU), Столяр Марина Александровна (RU)
Принадлежит: Общество с ограниченной ответственностью "БиоМатрикс" (RU)

Изобретение относится к области медицины, а именно к клинической лабораторной диагностике лимфоцитарной лимфомы/хронического лимфоцитарного лейкоза (ХЛЛ) с использованием молекулярно-генетических методов одновременного определения уровня экспрессии рибонуклеиновых кислот разного класса: микроРНК и матричных РНК в мультиплексной полимеразной цепной реакции в режиме «реального времени». Изобретение представляет собой набор, содержащий реагенты для выделения РНК, реагенты для проведения обратной транскрипции, включающий специфические петлевые праймеры к микроРНК, реагенты для проведения ПЦР, включающие оптимально подобранные реакционные смеси для определения экспрессии мРНК генов ABL1 и мРНК ROR1, а также микроРНК miR-39, miR-155 и miR-15а, ДНК-полимеразу Thermus aquaticus, положительный контрольный образец, отрицательный контрольный образец, а также контрольный маркер оценки эффективности выделения микроРНК. Отличительной особенностью набора является использование оригинальных комбинаций ...

Подробнее
Номер записи: 64
11-12-2023 дата публикации

CAPS-маркер для отбора гибридов ячменя, не накапливающих проантоцианидины в зерне

Номер: RU2809369C1
Автор: Шоева Олеся Юрьевна (RU), Тоцкий Игорь Васильевич (RU), Кукоева Татьяна Владимировна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение Федеральный исследовательский центр "Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук" (ИЦиГ СО РАН) (RU)

Изобретение относится к области биохимии, в частности к CAPS-маркеру для отбора гибридов ячменя, не накапливающих проантоцианидины в зерне. Изобретение позволяет эффективно отбирать растения ячменя, зерно которых не накапливает проантоцианидиновые соединения. 4 ил., 2 пр.

Подробнее
Номер записи: 65
23-09-2024 дата публикации

Способ диагностики тяжести ишемически-гипоксических поражений ЦНС на основе установления целостности геномных ДНК

Номер: RU2827183C1
Автор: Трофимов Владимир Александрович (RU), Панькина Кира Юрьевна (RU)
Принадлежит: Панькина Кира Юрьевна (RU)

Изобретение относится к области молекулярной биологии. Описан способ диагностики тяжести ишемически-гипоксических поражений ЦНС на основе установления целостности геномных ДНК, включающий забор крови в пробирки, центрифугирование пробирок с кровью, выделение ДНК, проведение ПЦР с помощью набора реагентов, включающего ПЦР-буфер, Taq-ДНК-полимеразу, дезоксинуклеозидтрифосфаты дАТФ, дГТФ, дЦТФ, дТТФ в концентрациях 0,12 мМ и MgCl2 в концентрации 3 мМ, деионизированную воду, 4 пары олигонуклеотидных праймеров и 4 флуоресцентных зонда. Технический результат заявленного способа заключается в повышении эффективности и ускорении диагностики тяжести ишемического инсульта за счет определения наличия кодирующих последовательностей высокоэкспрессивных генов белков клеток тканей головного мозга в плазме крови, сравнивая их количество с нормой с первых часов и в течение суток после начала заболевания. 3 пр.

Подробнее
Номер записи: 66
03-10-2024 дата публикации

Способ выявления вируса Guanarito методом, основанным на применении дезоксирибозима 10-23

Номер: RU2827922C1
Автор: Долгова Анна Сергеевна (RU), Кириченко Анастасия Дмитриевна (RU), Дедков Владимир Георгиевич (RU), Брюшкова Екатерина Александровна (RU)
Принадлежит: Федеральное бюджетное учреждение науки "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека" (ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера) (RU)

Изобретение относится к биотехнологии и медицине. Предложен способ выявления вируса Guanarito методом, основанным на применении дезоксирибозима 10-23. Проводят экстракцию РНК из биологических образцов с последующим проведением детекции целевых фрагментов РНК генома Guanarito вируса с использованием олигонуклеотидных последовательностей биосенсора на основе дезоксирибозима 10-23 и флуоресцентно-меченого зонда, комплементарных специфическому фрагменту L сегмента вируса Guanarito. Способ позволяет осуществить достоверную диагностику РНК вируса Guanarito. 2 ил., 1 табл., 1 пр.

Подробнее
Номер записи: 67
27-04-2023 дата публикации

Олигонуклеотиды для определения мутации S:P681R SARS-CoV-2

Номер: RU2795019C1
Автор: Голубева Анна Геннадьевна (RU), Саламайкина Светлана Андреевна (RU), Черкашина Анна Сергеевна (RU), Есьман Анна Сергеевна (RU), Акимкин Василий Геннадьевич (RU), Миронов Константин Олегович (RU)
Принадлежит: Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора) (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии, в частности к определению мутации S:P681R SARS-CoV-2 методом полимеразной цепной реакции, проводимой в режиме реального времени. Представлен набор праймеров и зонда для определения мутации S:P681R SARS-CoV-2, включающий прямой праймер 681RF, обратный праймер 681RR, флуоресцентный зонд S681RZ, которые представлены уникальными последовательностями SEQ ID NO: 1-3 соответственно. При этом для создания прямого и обратного праймеров, флуоресцентного зонда используют фрагменты референсных геномов SARS-CoV-2 дикого типа, Delta (В.1.617.2), Карра (В.1.617.1), (В.1.617.3). Синтезированные олигонуклеотиды SEQ ID NO NO: 1-3 не дают перекрестных реакций с другими протестированными образцами, амплифицируют заданный участок со 100% специфичностью и позволяют определять наличие или отсутствие в образцах биологического материала значимой мишени S:P681R. Изобретение может применяться для идентификации геновариантов SARS-CoV-2 при эпидемиологических исследованиях ...

Подробнее
Номер записи: 68
05-07-2023 дата публикации

СИНТЕТИЧЕСКИЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ПРАЙМЕРЫ И СПОСОБ ВЫСОКОЧУВСТВИТЕЛЬНОГО ЭКСПРЕСС-ВЫЯВЛЕНИЯ ДНК ВИРУСА АФРИКАНСКОЙ ЧУМЫ СВИНЕЙ МЕТОДОМ ПЕТЛЕВОЙ ИЗОТЕРМИЧЕСКОЙ АМПЛИФИКАЦИИ В ПРИСУТСТВИИ ДНК ВНУТРЕННЕГО КОНТРОЛЬНОГО ОБРАЗЦА

Номер: RU2799410C1
Автор: Гнездилова Лариса Александровна (RU), Селина Марина Викторовна (RU), Давыдова Екатерина Евгеньевна (RU), Борунова Саидфатима Мировна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии - МВА имени К.И. Скрябина" (ФГБОУ ВО МГАВМиБ - МВА имени К.И. Скрябина) (RU)

Изобретение относится к области молекулярной диагностики. Описаны набор олигонуклеотидных праймеров и зонды для выявления ДНК вируса африканской чумы свиней (АЧС) и ДНК бактериофага лямбда как внутреннего контрольного образца исследования. Также предложен способ выявления ДНК вируса АЧС из биологического материала с использованием набора олигонуклеотидных праймеров и зондов с помощью петлевой изотермической амплификации (LAMP) в присутствии внутреннего контрольного образца ДНК бактериофага лямбда. Технический результат заключается в разработке высокочувствительного, специфичного и быстрого метода выявления вируса африканской чумы свиней. 2 н. и 1 з.п. ф-лы, 2 ил., 6 табл., 3 пр.

Подробнее
Номер записи: 69
22-08-2023 дата публикации

Набор специфических олигодезоксирибонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда к фрагменту гена ORF1 (Non structural Protein 1) РНК (кДНК) калицивируса кошек Feline calicivirus (FCV) для детекции калицивируса кошек Feline calicivirus (FCV).

Номер: RU2802065C1
Автор: Гришечкин Александр Евгеньевич (RU), Исаев Сергей Александрович (RU), Каменский Иван Григорьевич (RU)
Принадлежит: Исаев Сергей Александрович (RU)

Изобретение относится к биотехнологии и ветеринарии. Предложен набор высокоспецифических праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для выявления генетического материала (РНК, кДНК) калицивируса кошек Feline calicivirus (FCV) для детекции калицивируса кошек Feline calicivirus (FCV). Представленный набор олигодезоксирибонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченого ДНК-зонда содержит пару олигонуклеотидов, обладающих активностью прямого и обратного праймеров в полимеразной цепной реакции, а также один флуоресцентно-меченый ДНК-зонд. Представленное изобретение позволяет проводить более достоверное и надежное выявление генетического материала (РНК, кДНК) калицивируса кошек Feline calicivirus (FCV). 3 ил., 3 табл.

Подробнее
Номер записи: 70
04-09-2024 дата публикации

СПОСОБ ДНК-ИДЕНТИФИКАЦИИ И ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ПАСПОРТИЗАЦИИ СОРТОВ РАЙГРАСА ПАСТБИЩНОГО И ОДНОЛЕТНЕГО НА ОСНОВЕ СИСТЕМ SSR- и SCoT-МАРКИРОВАНИЯ

Номер: RU2826148C1
Автор: Шамустакимова Анастасия Олеговна (RU), Антонов Алексей Алексеевич (RU), Душкин Владимир Александрович (RU), Мавлютов Юлиан Муратович (RU), Клименко Ирина Александровна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный научный центр кормопроизводства и агроэкологии имени В.Р. Вильямса" (RU)

Изобретение относится к области молекулярной биологии и генетики растений. Описан способ ДНК-идентификации и генетической паспортизации сортов райграса пастбищного и однолетнего на основе систем SSR- и SCoT-маркирования. Способ включает использование мультилокусных SCoT-маркеров, маркирующих ДНК, ассоциированную с кодирующими участками генома, для оценки генетического полиморфизма, детекцию продуктов ПЦР путем предварительного электрофореза в агарозном геле и составление молекулярно-генетических формул по результатам выявленного аллельного разнообразия. При этом выделение ДНК осуществляют модифицированным SDS-методом, в котором в качестве коагулянта белков используют 5 М ацетат аммония, ДНК-экстракцию осуществляют без этапов дополнительной очистки и промывания растворов этанолом, из пророщенных семян, взятых в количестве не менее тридцати от каждого сорта, сортоспецифичные ДНК-спектры получают с использованием двух систем маркирования: 7 микросателлитных SSR-локусов и 9 SCoT-маркеров, выявляют ...

Подробнее
Номер записи: 71
07-12-2023 дата публикации

Способ опосредованного определения титра инфекционной активности альфа-коронавируса собак производственного штамма РИЧ в сырье для вакцины методом ОТ-ПЦР в режиме реального времени

Номер: RU2809224C1
Автор: Комарова Анна Александровна (RU), Галкина Татьяна Сергеевна (RU), Доронин Максим Игоревич (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Описан способ опосредованного определения титра инфекционной активности альфа-коронавируса собак производственного штамма РИЧ в сырье для вакцины методом ОТ-ПЦР в режиме реального времени. Способ включает стадии составления калибровочной панели положительных контрольных образцов альфа-коронавируса собак производственного штамма РИЧ, экстрагирования РНК из вируссодержащего сырья для вакцины и контролей, составления реакционной смеси для проведения обратной транскрипции и ПЦР в режиме реального времени с олигонуклеотидами, проведение обратной транскрипции. Следующими стадиями являются учет флуоресцентного сигнала каждого образца с помощью флуориметра, определение величины порогового цикла амплификации, установление зависимости порогового цикла амплификации и титра инфекционной активности штамма в сырье для вакцины, а также определение значения титра инфекционной активности штамма. Технический результат заключается в разработке высокочувствительного ...

Подробнее
Номер записи: 72
07-12-2023 дата публикации

СПОСОБ ИДЕНТИФИКАЦИИ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ В МНОГОКОПИЙНОМ ЛОКУСЕ ГЕНОМА МЕТОДОМ ПЕТЛЕВОЙ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ С ПОСЛЕДУЮЩЕЙ ГИБРИДИЗАЦИЕЙ НА БИОЛОГИЧЕСКОМ МИКРОЧИПЕ

Номер: RU2809184C1
Автор: Дементьева Екатерина Игоревна (RU), Шаскольский Борис Леонидович (RU), Грядунов Дмитрий Александрович (RU), Кандинов Илья Денисович (RU), Винокурова Александра Сергеевна (RU), Горшкова Софья Андреевна (RU), Кравцов Дмитрий Витальевич (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук (ИМБ РАН) (RU)

Изобретение относится к области молекулярной биологии. Описан способ идентификации однонуклеотидных полиморфизмов в многокопийном локусе генома методом петлевой полимеразной цепной реакции с последующей гибридизацией на биологическом микрочипе. Способ включает несколько этапов амплификации, которые проводятся в одном реакционном объеме при разной температуре отжига праймеров, а также обеспечение биологического микрочипа с иммобилизованными олигонуклеотидными зондами, гибридизацию амплифицированных флуоресцентно-меченых продуктов на биологическом микрочипе, регистрацию и интерпретацию результатов гибридизации. Технический результат осуществления способа заключается в возможности проводить этапы амплификации в едином реакционном объеме, что избавляет от необходимости проведения нескольких последовательных стадий ПЦР с переносом продуктов реакции из одного объема в следующий. 2 з.п. ф-лы, 5 ил., 2 табл.

Подробнее
Номер записи: 73
05-07-2023 дата публикации

Набор олигодезоксирибонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда к фрагменту ДНК гена 16S рибосомальной РНК рода Ureaplasma семейства Mycoplasmataceae порядка Mycoplasmatales (Ureaplasma spp.) класса Mollicutes для детекции патогенных уреаплазм кошек и собак

Номер: RU2799416C1
Автор:
Принадлежит: Исаев Сергей Александрович (RU)

Изобретение относится к биотехнологии и ветеринарии. Представлен набор праймеров к фрагменту гена 16S рибосомальной РНК семейства рода Ureaplasma семейства Mycoplasmataceae порядка Mycoplasmatales класса Mollicutes (Ureaplasma spp.) для детекции патогенных уреаплазм кошек и собак в клинических образцах, секционных пробах, культуральных жидкостях и прочих биопрепаратах с целью постановки диагноза, коррекции лечения, эпидемиологического расследования, а также для решения научно-исследовательских задач свойств патогенных уреаплазм кошек и собак. Изобретение позволяет идентифицировать в реальном времени ДНК фрагмента гена 16S рибосомальной РНК рода Ureaplasma семейства Mycoplasmataceae порядка Mycoplasmatales класса Mollicutes (Ureaplasma spp.), обладающего более высокой гомологией к циркулирующим в настоящее время патогенным уреаплазмам кошек и собак, что повышает достоверность и надежность анализов. 3 табл., 3 ил.

Подробнее
Номер записи: 74
16-09-2024 дата публикации

Способ генотипирования однонуклеотидного варианта rs12169782 (G>A) гена TTC28-AS1 человека методом полимеразно-цепной реакции в режиме реального времени

Номер: RU2826721C1
Автор: Азарова Юлия Эдуардовна (RU), Полоников Алексей Валерьевич (RU), Постникова Мария Игоревна (RU), Клёсова Елена Юрьевна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Курский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Описан способ генотипирования однонуклеотидного варианта rs12169782 (G>A) гена TTC28-AS1 человека методом полимеразно-цепной реакции в режиме реального времени, предполагающий применение подобранных олигонуклеотидных праймеров и зондов. Технический результат заключается в разработке оперативного и удобного способа генотипирования однонуклеотидного варианта rs12169782 (G>A) гена TTC28-AS1 человека методом полимеразно-цепной реакции в режиме реального времени. 2 ил., 3 пр.

Подробнее
Номер записи: 75
25-06-2024 дата публикации

СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РИСКА ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ И/ИЛИ ЯИЧНИКОВ У ПАЦИЕНТОВ ПОСЛЕ ТРАНСПЛАНТАЦИИ ПОЧКИ

Номер: RU2821583C1
Автор: Хубутия Могели Шалвович (RU), Бабкина Анна Васильевна (RU)
Принадлежит: Государственное бюджетное учреждение здравоохранения города Москвы «Научно-исследовательский институт скорой помощи им. Н.В. Склифосовского Департамента здравоохранения города Москвы» (ГБУЗ "НИИ СП ИМ. Н.В. СКЛИФОСОВСКОГО ДЗМ") (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Описан способ прогнозирования риска злокачественных заболеваний молочной железы и яичников у пациентов после трансплантации почки. Способ включает забор венозной крови у пациента не ранее чем через 60 дней после трансплантации почки, выделение ДНК из полученного образца, подготовку библиотек ДНК, секвенирование ДНК. В случае выявления у пациентов после трансплантации почки варианта мутации гена BRIP1 в гетерозиготном состоянии во 2-м экзоне из 20, приводящего к замене аминокислоты лизин на аспарагин в положении 14 - p.Lys14Asn, мутация типа миссенс, прогнозируют высокий риск злокачественных заболеваний молочной железы или яичников. Техническим результатом является выявление у пациентов после трансплантации почки предрасположенности к раку молочной железы и раку яичников. 3 з.п. ф-лы, 2 пр.

Подробнее
Номер записи: 76
20-11-2016 дата публикации

СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТЕРАПИИ ПЕРОРАЛЬНЫМ САХАРОСНИЖАЮЩИМ ПРЕПАРАТОМ МЕТФОРМИНОМ У БОЛЬНЫХ САХАРНЫМ ДИАБЕТОМ 2 ТИПА

Номер: RU2602663C1
Автор: Ворохобина Наталья Владимировна (RU), Баранов Виталий Леонидович (RU), Загородникова Ксения Александровна (RU), Абулула Мария (MA)
Принадлежит: федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова Минздрава России) (RU)

Изобретение относится к области медицины, и касается способа прогнозирования эффективности монотерапии пероральным сахароснижающим препаратом метформином у больных сахарным диабетом 2 типа. Сущность способа заключается в том, что у больных сахарным диабетом 2 типа выделяют ДНК из периферической венозной крови с последующим проведением полимеразной цепной реакции (ПЦР) и проведением анализа на выявление полиморфизма А>С rs 622342 гена ОСТ1. При выявлении генотипа АА в участке rs 622342 гена ОСТ1 прогнозируют эффективность монотерапии метформином в качестве сахароснижающего препарата у больных сахарным диабетом 2 типа, а при выявления генотипа АС или СС в участке rs 622342 гена ОСТ1 прогнозируют неэффективность монотерапии метформином в качестве сахароснижающего препарата у данной категории больных. Испоотзование способа позволяет повысить точность и специфичность прогнозирования эффективности монотерапии пероральным сахароснижающим препаратом метформином у больных сахарным диабетом 2 типа ...

Подробнее
Номер записи: 77
10-11-2016 дата публикации

СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ПРОФИЛАКТИКИ АЛЬБЕНДАЗОЛОМ ПОСЛЕОПЕРАЦИОННОГО РЕЦИДИВА ЦИСТНОГО ЭХИНОКОККОЗА

Номер: RU2601902C1
Автор: Лукманова Гульнур Ишмурзовна (RU), Нартайлаков Мажит Ахметович (RU), Лукманов Мурад Ильгизович (RU)
Принадлежит: Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "БАШКИРСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ" Министерства здравоохранения Российской Федерации (RU)

Изобретение относится к медицине, а именно к хирургии, и касается способа прогнозирования эффективности профилактики альбендазолом послеоперационного рецидива цистного эхинококкоза. Сущность способа заключается в том, что из лимфоцитов периферической венозной крови выделяют ДНК, проводят генотипирование полиморфизма *1F(163A/C) гена цитохрома Р450 CYP1A2 методом анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов продуктов полимеразной цепной реакции синтеза ДНК. При обнаружении генотипа CYP1A2F1*C/C прогнозируют высокую эффективность профилактики альбендазолом послеоперационного рецидива цистного эхинококкоза. Использование изобретения дает возможность прогнозировать эффективность профилактики альбендазолом рецидива цистного эхинококкоза с высокой точностью. 2 пр.

Подробнее
Номер записи: 78
05-12-2023 дата публикации

Способ выделения рибонуклеиновой кислоты вируса из спинномозговой жидкости для молекулярно-биологических исследований

Номер: RU2808832C1
Автор: Итани Тарек Мохамедович (RU), Сергеев Александр Григорьевич (RU), Чалапа Владислав Игоревич (RU)
Принадлежит: Федеральное бюджетное учреждение науки "Федеральный научно-исследовательский институт вирусных инфекций "ВИРОМ" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ФНИИВИ "ВИРОМ" Роспотребнадзора) (RU)

Изобретение относится к молекулярной биологии. Предложен способ выделения РНК вируса из спинномозговой жидкости (СМЖ), включающий концентрацию образца СМЖ в центробежном вакуумном концентраторе с ускорением 150-300 g и отрицательным давлением 2 кПа до уменьшения конечного объема образца в 4 или в 5 раз; добавление в соотношении 1:10 лизирующего раствора, содержащего 4 М гуанидина тиоцианата, 25 мМ цитрата натрия, 0,5% натрия лаурилсаркозината, 0,1 М 2-меркоптоэтанола, инкубирование смеси до полного растворения компонентов; далее последовательно добавляют в соотношении 1:10:2 1-3 М ацетат натрия, фенол и смесь хлороформа с изоамиловым спиртом в соотношении 49:1 при перемешивании; охлаждают и центрифугируют с ускорением 10-13 тыс. g; верхнюю прозрачную водную фазу переосаждают добавлением изопропанола и инкубированием при минус 20°С; полученную РНК дополнительно очищают методом аффинной сорбции с использованием диоксида кремния. Изобретение обеспечивает повышение концентрации и степени очистки ...

Подробнее
Номер записи: 79
05-12-2023 дата публикации

Способ генотипирования полиморфного локуса rs346158 (T>C) гена C19orf53 у человека методом ПЦР в режиме "реального времени" с применением аллель-специфических флуоресцентных зондов

Номер: RU2808839C1
Автор: Полоников Алексей Валерьевич (RU), Бушуева Ольга Юрьевна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Курский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии, молекулярно-генетической диагностики, и может быть использовано в медицине при определении наследственной предрасположенности к развитию заболеваний, ассоциированных с носительством полиморфного варианта rs346158 (T>C) гена C19orf53. Предложен способ генотипирования полиморфного локуса rs346158 (T>C) гена C19orf53 у человека методом ПЦР в режиме «реального времени» с применением аллель-специфических флуоресцентных зондов, предусматривающий проведение ПЦР с использованием специально подобранных праймеров: прямого 5′-AGTTTGGGGTTCACACTGCT-3′ и обратного 5′-CCTCTGGTCCCAGCCTCTA-3′, и зондов c флуорофорами: Т-аллель-специфичного флуоресцентно-меченого зонда 5′-(FAM)TGCCGTCTGCAAAGCA(RTQ1)-3′ и C-аллель-специфичного флуоресцентно-меченого зонда 5′-(ROX)TGCCGTCCGCAAAGCA(BHQ2)-3′ в амплификаторе с детекцией флуоресценции. Изобретение позволяет расширить арсенал способов генотипирования полиморфных вариантов гена C19orf53, способотличается простотой и ...

Подробнее
Номер записи: 80
05-12-2023 дата публикации

Способ преимплантационного генетического тестирования лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии

Номер: RU2808833C1
Автор: Мусатова Елизавета Валерьевна (RU), Кушнир Арина Леонидовна (RU), Померанцева Екатерина Алексеевна (RU), Жикривецкая Светлана Олеговна (RU), Софронова Яна Владиславовна (RU), Исаев Артур Александрович (RU)
Принадлежит: Публичное акционерное общество "Центр Генетики и Репродуктивной Медицины "ГЕНЕТИКО" (RU)

Изобретение относится к медицинской генетике. Описан способ преимплантационного генетического тестирования лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии. Выявляют наследование патогенного варианта - уменьшение количества повторов в локусе D4Z4 в гене DUX4, с двойной системой детекции - прямая детекция наличия разрешающего гаплотипа 4qA и косвенное выявление унаследованного патогенного варианта от родителя с заболеванием. Прямую детекцию наличия разрешающего гаплотипа 4qA осуществляют с помощью праймеров для амплификации: прямой GGTGGAGTTCTGGTTTCAGC-(HEX) и обратный CCTGTGCTTCAGAGGCATTTG. Косвенную детекцию осуществляют с помощью праймеров для анализа наследования молекулярно-генетических маркеров типа STR, сцепленных с патогенным вариантом, выбранных из SEQ ID NO: 1-39. При этом используют праймеры, направленные на те STR, аллели которых разные на хромосомах родителей, при этом диагностику проводят в два этапа полугнездовой ПЦР: на первом этапе проводят мультиплексную ПЦР с внешними праймерами ...

Подробнее
Номер записи: 81
26-09-2023 дата публикации

Набор олигонуклеотидных праймеров и зондов для определения аллей полиморфизма rs55986091 и способ его применения

Номер: RU2804110C1
Автор: Попова Анна Анатольевна (RU), Акимкин Василий Геннадьевич (RU), Миронов Константин Олегович (RU), Винокуров Михаил Андреевич (RU), Домонова Эльвира Алексеевна (RU), Романюк Татьяна Николаевна (RU)
Принадлежит: Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора) (RU)

Изобретение относится к биотехнологии. Предложен набор олигонуклеотидных праймеров и зондов для определения аллей полиморфизма rs55986091, который ассоциирован с предрасположенностью к раку шейки матки. Набор включает прямой праймер 6091-F - SEQ ID NO: 1; TCT TTT TTA TTT TTC СТА AGA GTC GAT, обратный праймер 6091-R - SEQ ID NO: 2; GCA ATT TTA ATT TCG CCT CAG TC, флоуресцентный зонд 6091-G- SEQ ID NO: 3. (FAM)TTA TTA GGG ATT TTC A (BHQ1), флоуресцентный зонд 6091-А - SEHQ ID NO: 4. (R6G)TTA TTA GAG ATT TTC AA (BHQ1). Предложен способ применения набора олигонуклеотидных праймеров и зондов для определения аллей полиморфизма rs55986091. Способ предусматривает экстракцию ДНК из биологического материала и проведение ПЦР-РРВ, амплификацию, анализ и интерпретацию результатов. Наличие в образце биологического материала нукдеотида G определяется посредством оценки кривых накопления флуоресцентных сигналов по каналу для флуорофора FAM. Наличие в образце биологического материала нукдеотида А определяется ...

Подробнее
Номер записи: 82
17-03-2023 дата публикации

Способ молекулярного типирования типичных (O1) и атипичных (RO) нетоксигенных штаммов V. cholerae El Tor с помощью ПЦР в режиме реального времени

Номер: RU2792156C1
Автор: Водопьянов Алексей Сергеевич (RU), Левченко Дарья Александровна (RU), Водопьянов Сергей Олегович (RU), Ежова Марина Ивановна (RU), Кругликов Владимир Дмитриевич (RU), Олейников Игорь Павлович (RU)
Принадлежит: Федеральное казенное учреждение здравоохранения "Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (RU)

Данное изобретение относится к микробиологии и генетической инженерии и может быть использовано в лабораторной диагностике при проведении мониторинга за холерой, планировании противоэпидемических мероприятий и исследований, связанных с изучением особенностей биологии возбудителя. Описан способ молекулярного типирования типичных (O1) и атипичных (RО) нетоксигенных штаммов V. cholerae El Tor с помощью ПЦР в режиме реального времени, включающий выделение ДНК из исследуемого штамма, проведение ПЦР со специфическими праймерами и последующим учетом реакции амплификации. Амплификацию исследуемой ДНК проводят одновременно с пятью парами праймеров, при этом в инкубационную смесь вносят 0,5 мкл интеркалирующего красителя 50Х SYBR Green I для выявления продуктов амплификации по динамике изменения показателя флюоресценции по каналу FAM амплификатора. Учет результатов осуществляют по геометрическому методу, путем регистрации Дельта Ср, отраженному на экране монитора, а именно: при наличии целевого продукта ...

Подробнее
Номер записи: 83
01-03-2024 дата публикации

Способ идентификации ДНК ткани японской скумбрии (Scomber japonicus) в рыбных продуктах, в мясокостной рыбной муке и кормах с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Номер: RU2814552C1
Автор: Черных Олег Юрьевич (RU), Семененко Марина Петровна (RU), Манакова Алина Юрьевна (RU), Яковенко Павел Павлович (RU), Кривонос Роман Анатольевич (RU), Шевченко Александр Алексеевич (RU), Шевченко Людмила Васильевна (RU), Агольцов Валерий Александрович (RU), Адиатулин Ильяс Фаритович (RU), Баннов Василий Александрович (RU), Шевченко Александр Николаевич (RU), Белоусов Василий Иванович (RU), Чернов Альберт Николаевич (RU), Кощаев Андрей Георгиевич (RU), Забашта Сергей Николаевич (RU), Малышев Денис Владиславович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" (RU)

Изобретение относится к ветеринарной микробиологии. Описан способ идентификации ДНК ткани японской скумбрии (Scomber japonicus) в рыбных продуктах, в мясокостной рыбной муке в кормах. Выделяют ДНК из ткани животного сорбционным методом. Осуществляют постановку полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией с проведением 45 циклов амплификации в реальном времени с использованием специфичных для участка генома ДНК животного олигонуклеотидных праймеров, зондов, флуоресцентных красителей: для специфического сигнала для животного - JOE/Yellow и Cy5/Red - для внутреннего контрольного образца в виде суспензии бактериофага Т4 с концентрацией 5×103 фаговых частиц на 1 мкл, положительного контрольного образца в виде смеси, содержащую фрагменты геномов животного и бактериофага Т4 с нуклеотидной последовательностью: T4F TACATATAAATCACGCAAAGC - прямой праймер, T4R TAGTATGGCTAATCTTATTGG - обратный праймер, Т4Р CY5 ACATTGGCACTGACCGAGTTC - зонд, взятых в соотношении 1:1. Измеряют накопление флуоресцентных ...

Подробнее
Номер записи: 84
03-10-2024 дата публикации

СПОСОБ СОЗДАНИЯ КЛЕТОЧНЫХ МОДЕЛЕЙ ТРАНСЛОКАЦИЙ С ПОМОЩЬЮ ИНСТРУМЕНТОВ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА

Номер: RU2827872C1
Автор: ЛОМОВ Николай Андреевич (RU), ВЬЮШКОВ Владимир Сергеевич (RU), НИКОЛАЕВ Николай Андреевич (RU), РУБЦОВ Михаил Александрович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова" (МГУ) (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии, в частности к способу создания клеточной модели лейкоза для моделирования и изучения процессов, происходящих в лейкозных клетках. Способ направлен на выявление тех единичных клеток в популяции, в которых произошла транслокация, и их отбор. Первичный отбор осуществляют по флуоресценции репортерного белка, и гарантия того, что все необходимые для индукции транслокации элементы (гены Cas9 и РНК-гидов) попали в клетку, обеспечивается тем, что все эти элементы вместе с геном флуоресцентного белка собраны в одну плазмиду. Такая плазмида для индукции новой транслокации создается на основе универсального вектора в два шага клонирования. Для выявления транслокации используют ПЦР, причем без отдельной стадии выделения ДНК (т.н. прямая ПЦР), комбинируя этот подход с вложенной ПЦР, повышающей чувствительность метода. Для надежного получения клеточной линии с транслокацией с вероятностью не менее 0,95 может проводиться предварительная проверка эффективности ...

Подробнее
Номер записи: 85
01-08-2019 дата публикации

Способ выявления РНК вируса болезни Шмалленберга у сельскохозяйственных животных

Номер: RU2696306C1
Автор: Дорожкин Василий Иванович (RU), Дайбова Любовь Анатольевна (RU), Василевич Федор Иванович (RU), Черных Олег Юрьевич (RU), Кощаев Андрей Георгиевич (RU), Кривонос Роман Анатольевич (RU), Котельникова Александра Андреевна (RU), Лысенко Александр Анатолиевич (RU), Баннов Василий Александрович (RU), Донник Ирина Михайловна (RU), Дробин Юрий Дмитриевич (RU), Гринь Светлана Анатольевна (RU), Кривоногова Анна Сергеевна (RU), Шевкопляс Владимир Николаевич (RU), Шкуратова Ирина Алексеевна (RU), Семененко Марина Петровна (RU), Малышев Денис Владиславович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой способ выделения РНК из биологического материала по выбору: цельная кровь, сыворотка крови, фрагменты тканей и органов сорбционным методом, синтез кДНК на матрице РНК путем постановки одноэтапной с добавлением внутреннего и положительного контрольных образцов мультиплексной реакции обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции - с проведением 45 циклов амплификации с детекцией в реальном времени с использованием специфичных для участка генома возбудителя вируса Шмалленберга олигонуклеотидных праймеров флуоресцентно-меченого зонда и контрольных образцов, измерение накопления флуоресцентного сигнала по каналам соответствующих флуоресцентных красителей и интерпретацию результатов на основании наличия/отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией Threshold, согласно изобретению для внутреннего контрольного образца используют суспензию бактериофага MS2 с концентрацией 5×10копий нуклеотидных последовательностей ...

Подробнее
Номер записи: 86
07-04-2021 дата публикации

Способ прогнозирования риска тяжелого течения акне на основе экспрессии гена MEFV

Номер: RU2746115C1
Автор: Демина Ольга Михайловна (RU), Румянцев Александр Григорьевич (RU), Марахонов Андрей Владимирович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России) (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой способ прогнозирования риска тяжелого течения акне, включающий отбор цельной венозной крови больного, выделение ДНК и проведение молекулярно-генетического исследования. Молекулярно-генетическое исследование ДНК проводят методом высокопроизводительного секвенирования, и при выявлении полиморфизма гена MEFV rs104895094 прогнозируют риск развития тяжелого течения акне. Изобретение позволяет повысить достоверность выявления генетической предрасположенности к тяжелому течению акне. 1 пр.

Подробнее
Номер записи: 87
09-03-2021 дата публикации

РЕАГЕНТНО-ПРОГРАММНЫЙ КОМПЛЕКС ДЛЯ ПРОВЕДЕНИЯ ТАРГЕТНОГО АНАЛИЗА

Номер: RU2744443C1
Автор: Ткачук Артем Петрович (RU), Гущин Владимир Алексеевич (RU), Почтовый Андрей Андреевич (RU), Мануйлов Виктор Александрович (RU), Щетинин Алексей Михайлович (RU), Гинцбург Александр Леонидович (RU), Ремизов Тимофей Андреевич (RU), Кузнецова Надежда Анатольевна (RU), Спешилов Глеб Игоревич (RU)
Принадлежит: Российская Федерация, от имени которой выступает Министерство здравохранения Российской Федерации (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложен реагентно-программный комплекс для проведения таргетного анализа. Комплекс включает реагенты для выделения нуклеиновых кислот из исследуемого образца, выбранный для вариабельных регинов V3-V4 для целей метагеномного анализа набор для метапрофилирования регионов генов 16s рРНК, набор для таргетного обогащения генов токсинов методом ПЦР, набор для таргетного обогащения генов токсинов методом гибридизации, набор магнитных частиц для очистки ПЦР-продуктов и выделения биотинилированных объектов из растворов, набор адаптеров для мультиплексирования образцов и реагенты для проведения пробоподготовки к секвенированию, а также программное обеспечение. Изобретение обеспечивает эффективную обработку образца с реализацией прямой интеграции получаемых результатов в информационную сеть.

Подробнее
Номер записи: 88
30-09-2021 дата публикации

СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РАЗВИТИЯ НЕБЛАГОПРИЯТНЫХ СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ СОБЫТИЙ У БОЛЬНЫХ ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНЬЮ СЕРДЦА В ТЕЧЕНИЕ 12 МЕСЯЦЕВ ПОСЛЕ ДЕКОМПЕНСАЦИИ ХРОНИЧЕСКОЙ СЕРДЕЧНОЙ НЕДОСТАТОЧНОСТИ

Номер: RU2756391C1
Автор: Тепляков Александр Трофимович (RU), Копьева Кристина Васильевна (RU), Шилов Сергей Николаевич (RU), Панкова Ирина Владимировна (RU), Березикова Екатерина Николаевна (RU), Гракова Елена Викторовна (RU), Попова Анна Александровна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» (Томский НИМЦ) (RU)

Изобретение относится к биотехнологии и медицине и может быть использовано в кардиологии, ангиологии, кардиохирургии, терапии, реабилитологии. Определяют концентрацию цитомегаловирусной ДНК на 1 мл плазмы крови методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации в режиме «реального времени» (Real-time). При наличии концентрации цитомегаловирусной ДНК более 1418 копий/мл на 1 мл плазмы крови у пациентов с ИБС прогнозируют высокий риск развития неблагоприятных сердечно-сосудистых событий в течение последующих 12 месяцев наблюдения. Предлагаемый способ позволяет прогнозировать развитие неблагоприятных сердечно-сосудистых событий у больных ИБС в течение 12 месяцев наблюдения после выписки из стационара по поводу декомпенсации хронической сердечной недостаточности, что позволяет выделить приоритетную группу больных с повышенным риском кардиоваскулярных осложнений для диспансерного наблюдения. 1 ил., 5 табл., 1 пр.

Подробнее
Номер записи: 89
15-07-2021 дата публикации

Способ выявления предрасположенности к проявлению коморбидности нарушений функции поджелудочной железы у взрослых с артериальной гипертензией в условиях контаминации крови бензолом

Номер: RU2751594C1
Автор: Кривцов Александр Владимирович (RU), Казакова Ольга Алексеевна (RU), Ширинкина Алиса Сергеевна (RU), Долгих Олег Владимирович (RU), Аликина Инга Николаевна (RU), Мазунина Алена Александровна (RU)
Принадлежит: Федеральное бюджетное учреждение науки "Федеральный научный центр медико-профилактических технологий управления рисками здоровью населения" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН "ФНЦ медико-профилактических технологий управления рисками здоровью населения") (RU)

Изобретение относится к биотехнологии. Производят отбор проб крови и определяют в ней содержание бензола и уровень иммуноглобулина G (IgG) к бензолу. Также у указанного пациента отбирают пробу буккального эпителия и осуществляют выделение из указанной пробы дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Посредством ПЦР проводят генотипирование полиморфизма гена eNOS (rs1799983) и генотипирование полиморфизма гена HLA-DRA (rs3135388). При одновременном обнаружении диагностических маркеров: наличие гетерозиготного GT генотипа гена еМ%* (rsl799983), наличие гомозиготного СС генотипа гена (rs3135388), при условии наличия бензола в крови не ниже 0,00064 мг/дм3, а также при превышении не менее чем в 2,0 раза уровня IgG к бензолу по сравнению с верхней границей физиологической нормы делают вывод о высокой степени предрасположенности пациента к проявлению коморбидности нарушений функции поджелудочной железы, ассоциированной с артериальной гипертензией у пациента, в условиях избыточной контаминации крови ...

Подробнее
Номер записи: 90
29-11-2021 дата публикации

Набор олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченых зондов для выявления эпигенетических маркеров рака шейки матки

Номер: RU2760573C1
Автор: Викторов Денис Александрович (RU), Тороповский Андрей Николаевич (RU), Куклина Наталья Григорьевна (RU)
Принадлежит: Общество с ограниченной ответственностью "Эс Джи" (RU)

Изобретение относится к области медицинской биотехнологии. Для решения поставленной задачи определяют метилированные сайты RCGY промоторных областей генов-онкомаркеров CADM1, MAL, PAX1, DAPK1, FAM19A4, PRDM14 с помощью метода GLAD-ПЦР и используют специально разработанные олигонуклеотидные праймеры и зонды для определения этих участков. Использование заявляемого решения позволяет достигать технический результат: создание набора олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченых зондов для определения уровня метилирования эпигенетических маркеров, обуславливающих возникновение рака шейки матки, методом GLAD-ПЦР. 3 табл., 1 ил.

Подробнее
Номер записи: 91
16-12-2019 дата публикации

Способ дифференциации штаммов Legionella pneumophila путем молекулярно-генетического типирования

Номер: RU2709174C1
Автор: Водопьянов Алексей Сергеевич (RU), Водопьянов Сергей Олегович (RU), Иванов Сергей Анатольевич (RU), Олейников Игорь Павлович (RU)
Принадлежит: Федеральное казенное учреждение здравоохранения "Ростовский-на-Дону ордена трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Сущность изобретения заключается в том, что из ДНК исследуемого штамма L. pneumophila выявляют четыре общих INDEL-гена, имеющих делеции определенного размера, а именно IND- А9Р84_02210, А9Р84_08285, А9Р84_03850 и А9Р84_07165, с последующей их амплификацией с помощью сконструированных специфических праймеров, выявляющих два альтернативных аллеля: к гену IND- А9Р84_02210 - праймеры TTCCCCTTATTTAAATGACACCA и AAGCATAATAGGCGGGAAGA, с длиной амплифицированного фрагмента 80 п.н. или 110 п.н., к гену IND- А9Р84_08285 - праймеры CAGAAGACAAAGCGGAATCTG и TGAGGCCGAGTTTCTTGACT, с длиной амплифицированного фрагмента 62 п.н. или 74 п.н., к гену IND- А9Р84 03850 - праймеры CAGGTATCTGCCACGAATCA и TGGTTGTTGTCCATTTGACTG, с длиной амплифицированного фрагмента 63 п.н. или 75 п.н., к гену IND- А9Р84_07165 - праймеры TGGGTATTAAGCAATACGCAAG и AACAGAAACACCATTTATGCTTTG, с длиной амплифицированного фрагмента 84 п.н. или 96 п.н., при этом учет результатов дифференциации ...

Подробнее
Номер записи: 92
16-10-2019 дата публикации

Способ выявления и генотипирования РНК вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней

Номер: RU2703394C1
Автор: Дорожкин Василий Иванович (RU), Бахарев Алексей Александрович (RU), Дайбова Любовь Анатольевна (RU), Черных Олег Юрьевич (RU), Амерханов Харон Адиевич (RU), Кощаев Андрей Георгиевич (RU), Кривонос Роман Анатольевич (RU), Племяшов Кирилл Владимирович (RU), Котельникова Александра Андреевна (RU), Дунин Иван Михайлович (RU), Лысенко Александр Анатолиевич (RU), Баннов Василий Александрович (RU), Дробин Юрий Дмитриевич (RU), Донник Ирина Михайловна (RU), Кривоногова Анна Сергеевна (RU), Шевкопляс Владимир Николаевич (RU), Коломиец Сергей Николаевич (RU), Малышев Денис Владиславович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой способ выявления и генотипирования РНК вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней, включающий выделение РНК из биологического материала инфицированных свиней сорбционным методом, синтез кДНК на матрице РНК путем постановки одноэтапной мультиплексной реакции обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции с добавлением внутреннего контрольного образца на основе бактериофага MS2 и положительного контрольного образца, состоящего из внутреннего контрольного образца на основе бактериофага MS2, европейского и американского генотипов вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней, проведение 40 циклов амплификации с детекцией в реальном времени с использованием специфичных для участка генома вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней олигонуклеотидных праймеров, флуоресцентно-меченных зондов и контрольных образцов, измерение накопления флуоресцентного сигнала по каналам соответствующих флуоресцентных ...

Подробнее
Номер записи: 93
17-09-2019 дата публикации

Способ определения видовой принадлежности тканей кур и свиней в продовольственном сырье, кормах и пищевых продуктах

Номер: RU2700479C1
Автор: Джавадов Эдуард Джавадович (RU), Кузьминова Елена Васильевна (RU), Салеева Ирина Павловна (RU), Донник Ирина Михайловна (RU), Шевкопляс Владимир Николаевич (RU), Егоров Иван Афанасьевич (RU), Лоретц Ольга Геннадьевна (RU), Кривонос Роман Анатольевич (RU), Дробин Юрий Дмитриевич (RU), Малышев Денис Владиславович (RU), Дайбова Любовь Анатольевна (RU), Котельникова Александра Андреевна (RU), Лысенко Александр Анатолиевич (RU), Черных Олег Юрьевич (RU), Кощаев Андрей Георгиевич (RU), Тюрин Владимир Григорьевич (RU), Дельцов Александр Александрович (RU), Баннов Василий Александрович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой способ определения видовой принадлежности тканей кур и свиней в продовольственном сырье, кормах и пищевых продуктах, включающий выделение сорбционным методом ДНК из тканей курицы (Gallus gallus) и свиньи (Sus scrofa), постановку полимеразной цепной реакции с детекцией продуктов амплификации с использованием специфичных для участка генома ДНК ткани курицы (Gallus gallus) и свиньи (Sus scrofa) олигонуклеотидных праймеров, зондов, красителей, внутреннего контрольного образца и положительных контрольных образцов, измерение специфических сигналов и сигнала контролей и интерпретацию результатов, согласно изобретению проводят одноэтапную полимеразную цепную реакцию с флуоресцентной детекцией с применением термоциклера типа Rotor-Gene Q и измеряют накопление флуоресцентных сигналов по каналам соответствующих флуоресцентных красителей: JOE/Yellow для специфического сигнала для тканей свиньи (Sus scrofa); FAM/Green - тканей ...

Подробнее
Номер записи: 94
03-09-2019 дата публикации

НАБОР ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ ПРАЙМЕРОВ И ФЛУОРЕСЦЕНТНО-МЕЧЕНОГО ЗОНДА ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ РНК ВОЗБУДИТЕЛЕЙ САПА BURKHOLDERIA MALLEI И МЕЛИОИДОЗА BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI НА ОСНОВЕ ТРАНСКРИПЦИОННОЙ АМПЛИФИКАЦИИ (NASBA) В РЕЖИМЕ "РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ"

Номер: RU2699180C1
Автор: Ткаченко Галина Александровна (RU), Шпак Иван Михайлович (RU), Леденева Маргарита Леонтьевна (RU), Батурин Артем Александрович (RU)
Принадлежит: Федеральное казенное учреждение здравоохранения "Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии и молекулярной биологии. Предложен набор олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для идентификации РНК возбудителей сапа Burkholderia mallei и мелиоидоза Burkholderia pseudomallei на основе транскрипционной амплификации NASBA в режиме реального времени. Изобретение может быть использовано для выявления РНК возбудителей сапа Burkholderia mallei и мелиоидоза Burkholderia pseudomallei в пробах чистых культур, биологическом материале и объектах окружающей среды для нужд здравоохранения, службы Роспотребнадзора и в научных исследованиях. 1 ил., 1 табл., 3 пр.

Подробнее
Номер записи: 95
13-09-2019 дата публикации

Способ выявления ДНК провируса лейкоза крупного рогатого скота (Bovine leukosis virus, BLV)

Номер: RU2700245C1
Автор: Гулюкин Михаил Иванович (RU), Кощаев Андрей Георгиевич (RU), Шаравьев Павел Викторович (RU), Малышев Денис Владиславович (RU), Юлдашбаев Юсупжан Артыкович (RU), Котельникова Александра Андреевна (RU), Лайшев Касим Анверович (RU), Семененко Марина Петровна (RU), Молчанов Алексей Вячеславович (RU), Дайбова Любовь Анатольевна (RU), Черных Олег Юрьевич (RU), Дробин Юрий Дмитриевич (RU), Лысенко Александр Анатолиевич (RU), Кривонос Роман Анатольевич (RU), Донник Ирина Михайловна (RU), Шевкопляс Владимир Николаевич (RU), Баннов Василий Александрович (RU), Мирошников Сергей Александрович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой способ выявления ДНК провируса лейкоза крупного рогатого скота (Bovine leukosis virus, BLV), включающий выделение ДНК из биологического материала от инфицированных животных сорбционным методом, постановку одноэтапной полимеразной цепной реакции с одновременным проведением циклов амплификации с детекцией с использованием специфичных для участка генома провируса лейкоза крупного рогатого скота (Bovine leukosis virus, BLV) олигонуклеотидных праймеров, зондов, красителей и контрольных образцов в виде внутреннего и положительного, измерение специфического сигнала и сигнала контроля по каналам соответствующих красителей и интерпретацию результатов, согласно изобретению проводят флуоресцентную детекцию, измеряют по каналу JOE(HEX)/Yellow накопление флуоресцентного сигнала для специфического сигнала тестирования наличия генома провируса лейкоза крупного рогатого скота (Bovine leukosis virus, BLV), а по каналу FAM/Green ...

Подробнее
Номер записи: 96
17-09-2019 дата публикации

Тест-система для обнаружения генома возбудителя ДНК Bordetella bronchiseptica инфекции у сельскохозяйственных животных

Номер: RU2700477C1
Автор: Макаров Юрий Анатольевич (RU), Баннов Василий Александрович (RU), Шевкопляс Владимир Николаевич (RU), Кощаев Андрей Георгиевич (RU), Сисягин Павел Николаевич (RU), Малышев Денис Владиславович (RU), Юлдашбаев Юсупжан Артыкович (RU), Неверова Ольга Петровна (RU), Дробин Юрий Дмитриевич (RU), Черных Олег Юрьевич (RU), Лысенко Александр Анатолиевич (RU), Кривонос Роман Анатольевич (RU), Донник Ирина Михайловна (RU), Дайбова Любовь Анатольевна (RU), Чернов Альберт Николаевич (RU), Котельникова Александра Андреевна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой тест-систему для обнаружения ДНК генома возбудителя Brucella spp инфекции у сельскохозяйственных животных с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, включающую пластиковые флаконы и пробирки, термостабильный фермент Tag-полимеразу, буфер для постановки реакции, смесь четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, внутренний контрольный образец, положительный контроль - рекомбинантную плазмиду, содержащую фрагмент гена возбудителя Brucella spp, синтетические олигонуклеотидные праймеры и зонды, меченные красителями, согласно изобретению для внутреннего контрольного образца используют суспензию бактериофага Т4 с концентрацией 5×10копий нуклеотидных последовательностей на 1 мкл, а для положительного контрольного образца - смесь рекомбинантных плазмидных ДНК, содержащих фрагмент генома ДНК Brucella spp и фрагмент генома бактериофага Т4, взятых в соотношении 1:1. Изобретение позволяет достоверно диагностировать ...

Подробнее
Номер записи: 97
17-09-2019 дата публикации

Способ выявления ДНК вируса ринотрахеита (bovine herpes virus 1, BoHV-1) у крупного рогатого скота

Номер: RU2700449C1
Автор: Жолобова Инна Сергеевна (RU), Гулюкин Алексей Михайлович (RU), Донник Ирина Михайловна (RU), Шевкопляс Владимир Николаевич (RU), Дробин Юрий Дмитриевич (RU), Кривонос Роман Анатольевич (RU), Исаева Альбина Геннадиевна (RU), Дайбова Любовь Анатольевна (RU), Котельникова Александра Андреевна (RU), Шахов Алексей Гаврилович (RU), Кощаев Андрей Георгиевич (RU), Лысенко Александр Анатолиевич (RU), Черных Олег Юрьевич (RU), Гугушвили Нино Нодариевна (RU), Малышев Денис Владиславович (RU), Щукина Ирина Владимировна (RU), Тюрин Владимир Григорьевич (RU), Баннов Василий Александрович (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой способ выявления ДНК вируса ринотрахеита (bovine herpes virus 1, BoHV-1) у крупного рогатого скота, включающий выделение ДНК сорбционным методом, постановку одноэтапной полимеразной цепной реакции с одновременным проведением циклов амплификации с детекцией в реальном времени с использованием специфичных для участка генома вируса ринотрахеита (bovine herpes virus I, BoHV-1) олигонуклеотидных праймеров, зондов, красителей и контрольных образцов в виде внутреннего и положительного, измерение специфического сигнала и сигнала контроля по каналам соответствующих красителей и интерпретацию результатов, согласно изобретению проводят флуоресцентную детекцию, измеряют по каналу JOE(HEX)/Yellow накопление флуоресцентного сигнала для специфического сигнала ДНК вируса ринотрахеита (bovine herpes virus 1, BoHV-1), а по каналу FAM/Green сигнал внутреннего контрольного образца и интерпретацию результатов проводят на основании ...

Подробнее
Номер записи: 98
17-09-2019 дата публикации

Способ выявления ДНК возбудителя орнитоза (Chlamydophila psittaci) у птиц

Номер: RU2700456C1
Автор: Шевкопляс Владимир Николаевич (RU), Баннов Василий Александрович (RU), Клименко Александр Иванович (RU), Кощаев Андрей Георгиевич (RU), Донник Ирина Михайловна (RU), Малышев Денис Владиславович (RU), Дробин Юрий Дмитриевич (RU), Суханова Светлана Фаилевна (RU), Черных Олег Юрьевич (RU), Забашта Николай Николаевич (RU), Лунева Альбина Владимировна (RU), Лысенко Александр Анатолиевич (RU), Кривонос Роман Анатольевич (RU), Фисинин Владимир Иванович (RU), Дайбова Любовь Анатольевна (RU), Радченко Виталий Владиславович (RU), Кочиш Иван Иванович (RU), Котельникова Александра Андреевна (RU)
Принадлежит: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой способ выявления ДНК возбудителя орнитоза (Chlamydophila psittaci) у птиц, включающий выделение ДНК из биологического материала сорбционным методом, постановку полимеразной цепной реакции - с добавлением внутреннего положительного контроля и проведением последовательно не более 40 циклов амплификации с флуоресцентной детекцией в реальном времени с использованием специфичных для участка генома ДНК возбудителя орнитоза (Chlamydophila psittaci) олигонуклеотидных праймеров, флуоресцентно-меченного зонда, положительного и отрицательного контрольных образцов, измерение накопления флуоресцентного сигнала по каналам соответствующих флуоресцентных красителей для специфического сигнала и сигнала внутреннего контроля и интерпретацию результатов на основании наличия/отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией, согласно изобретению биологический материал отбирают от инфицированных птиц, при этом для внутреннего ...

Подробнее
Номер записи: 99
29-07-2021 дата публикации

СПОСОБ КВАНТИФИКАЦИИ СТАТИСТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ДАННЫХ РНК-СЕК

Номер: RU2752663C1
Автор: Мазин Павел Владимирович (RU), Хайтович Филипп Ефимович (RU)
Принадлежит: ОБЩЕСТВО С ОГРАНИЧЕННОЙ ОТВЕТСТВЕННОСТЬЮ "СберМедИИ" (RU)

Изобретение относится к биотехнологии. Описан способ обнаружения отличий в частоте включения экзона при помощи анализа данных РНК-секвенирования. Согласно способу: получают данные РНК-секвенирования, состоящие из набора прочтений, из по меньшей мере одного образца, при этом образец получают из субъекта, принадлежащего к определенному биологическому виду; б) получают информацию о референсной геномной ДНК организма, принадлежащего к указанному биологическому виду, которая содержит последовательности генов; в) осуществляют разбиение указанных последовательностей генов на сегменты, при этом каждый сегмент содержит фрагмент гена между двумя ближайшими сайтами сплайсинга; г) картируют полученные наборы прочтений на указанные последовательности генов, и для каждого сегмента определяют прочтения, содержащие последовательность, которая соответствует последовательности этого сегмента; д) для каждого сегмента определяют количество «включающих» прочтений, подтверждающих наличие данного сегмента в данных ...

Подробнее
Номер записи: 100
05-01-2012 дата публикации

Instrument for cassette for sample preparation

Номер: US20120003631A1
Автор: David Hsiang Hu, Jesus Ching, Phillip You Fai Lee, Steve Jia Chang Yu
Принадлежит: GENTURADX Inc

A parallel processing system for processing samples is described. In one embodiment, the parallel processing system includes an instrument interface parallel controller to control a tray motor driving system, a close-loop heater control and detection system, a magnetic particle transfer system, a reagent release system, a reagent pre-mix pumping system and a wash buffer pumping system.

Подробнее
Номер записи: 101
05-01-2012 дата публикации

Diagnosing fetal chromosomal aneuploidy using massively parallel genomic sequencing

Номер: US20120003635A1
Автор: Kwan Chee Chan, Rossa Wai Kwun Chiu, Yuk-Ming Dennis Lo
Принадлежит: Individual

Embodiments of this invention provide methods, systems, and apparatus for determining whether a fetal chromosomal aneuploidy exists from a biological sample obtained from a pregnant female. Nucleic acid molecules of the biological sample are sequenced, such that a fraction of the genome is sequenced. Respective amounts of a clinically-relevant chromosome and of background chromosomes are determined from results of the sequencing. The determination of the relative amounts may count sequences of only certain length. A parameter derived from these amounts (e.g. a ratio) is compared to one or more cutoff values, thereby determining a classification of whether a fetal chromosomal aneuploidy exists. Prior to sequencing, the biological sample may be enriched for DNA fragments of a particular sizes.

Подробнее
Номер записи: 102
05-01-2012 дата публикации

Diagnosing fetal chromosomal aneuploidy using massively parallel genomic sequencing

Номер: US20120003637A1
Автор: Kwan Chee Chan, Rossa Wai Kwun Chiu, Yuk-Ming Dennis Lo
Принадлежит: Chinese University of Hong Kong CUHK

Embodiments of this invention provide methods, systems, and apparatus for determining whether a fetal chromosomal aneuploidy exists from a biological sample obtained from a pregnant female. Nucleic acid molecules of the biological sample are sequenced, such that a fraction of the genome is sequenced. Respective amounts of a clinically-relevant chromosome and of background chromosomes are determined from results of the sequencing. The determination of the relative amounts may count sequences of only certain length. A parameter derived from these amounts (e.g. a ratio) is compared to one or more cutoff values, thereby determining a classification of whether a fetal chromosomal aneuploidy exists. Prior to sequencing, the biological sample may be enriched for DNA fragments of a particular sizes.

Подробнее
Номер записи: 103
05-01-2012 дата публикации

Genetic polymorphisms in the prostate-specific antigen gene promoter

Номер: US20120003647A1
Автор: Anuradha Rao, Bao-li CHANG, Jianfeng Xu, Scott D. Cramer
Принадлежит: Individual

The present invention includes methods of identifying a subject at risk for increased cellular PSA production and/or prostate cancer by detecting the presence or absence of a genetic polymorphism in the prostate specific antigen gene.

Подробнее
Номер записи: 104
05-01-2012 дата публикации

Magnetic lysis method and device

Номер: US20120003654A2
Автор: Benjamin Hindson, Philip Belgrader
Принадлежит: Akonni Biosystems Inc, BIO-RAD QL Inc

A method for lysing cells is disclosed. The method includes stirring cells with a magnetic stir element in the presence of a plurality of cell lysis beads at a speed sufficient to lyse the cells. Also disclosed is a device for lysing cells. The device includes a container having a magnetic stir element and a plurality of cell lysis beads disposed therein. The container is dimensioned to allow rotation of the magnetic stir element inside the container.

Подробнее
Номер записи: 105
05-01-2012 дата публикации

Isolation of Biomolecules from Biological Samples

Номер: US20120003710A1
Автор: Barbara Dawn Leinweber, Paul E. Diggins
Принадлежит: Individual

Nanoparticles for use in the collection, concentration, isolation and storage of biomolecules from biological samples are provided. More specifically, nanoparticles used to isolate biomolecules, including nucleic acids and proteins, cells, cell fragments, bacteria, and viruses from biological samples such as urine, cerebrospinal fluid (CSF), mouthwash samples, and amniotic fluid are provided. Kits for using nanoparticles for the isolation of biomolecules are also provided.

Подробнее
Номер записи: 106
05-01-2012 дата публикации

Gene expression markers of oncolytic virus sensitivity

Номер: US20120004119A1
Автор: Lynda Chin, Marc Lenburg
Принадлежит: Lynda Chin, Marc Lenburg

A method of predicting an efficacy of an oncolytic virus treatment for a tumor comprises calculating a single-gene predictor score for each of a plurality of genes; calculating a predictor score from the sum of the single-gene predictor scores for the plurality of genes; and predicting, if the predictor score is greater than a predictor score threshold, that the treatment would have efficacy, and if the predictor score is less than a predictor score threshold, that the treatment would lack efficacy. Also, methods of predicting an efficacy of a treatment for a tumor comprise identifying the type and subtype of the tumor, wherein the efficacy of the treatment for the type and subtype of the tumor is known.

Подробнее
Номер записи: 107
05-01-2012 дата публикации

Identification of nucleic acid delivery vehicles using dna display

Номер: US20120004137A1
Автор: Richard W. Wagner, Steven Mark SHAMAH, Yan Chen
Принадлежит: X Body Inc

The present invention features methods and compositions for the identification of molecules that facilitate the intracellular delivery of a, e.g., nucleic acid molecule. The methods and compositions of the invention utilize any display methodology wherein a library (e.g., a small molecule or protein library) is coupled to a nucleic acid (e.g., RNA or DNA) that encodes each library member.

Подробнее
Номер записи: 108
11-04-2019 дата публикации

Дозированная форма для выделения днк

Номер: RU0000188424U1
Автор: Важа Хутаевич Пация, Вахтанг Почхуа, Гиоргий Жгенти, Марина Почхуа, Мераб Георгиевич Чикобава, Олег Васильевич Рубальский, Ульрих Мартин
Принадлежит: Важа Хутаевич Пация, Вахтанг Почхуа, Гиоргий Жгенти, Марина Почхуа, Мераб Георгиевич Чикобава, Олег Васильевич Рубальский, Ульрих Мартин

Полезная модель относится к медицине и биологии и предназначена для использования при производстве наборов для выделения ДНК, применяемых при проведении молекулярно-генетических исследований. Дозированная форма для выделения ДНК включает ядро, содержащее совместно спрессованные мочевину, натрия хлорид и диоксид кремния, а также сплошную оболочку, состоящую, по меньшей мере, из одного гидрофобного ингредиента, выбранного из ряда: парафин и воск, и выполнена в виде глобулы или таблетки, при этом глобула имеет предпочтительный диаметр 2,0-4,0 мм, а таблетка имеет предпочтительный диаметр 2,0-4,0 мм и предпочтительную толщину 2,0-4,0 мм, причем содержание мочевины, натрия хлорида и диоксида кремния в ядре составляет, мас. %: мочевина - 67,5-80,0, натрия хлорид - 10,0-25,5 и диоксид кремния - 7,0-10,0. Техническим результатом полезной модели является увеличение срока хранения дозированной формы, предотвращение перекрестной контаминации реакционных смесей и обеспечение их пароизоляции. РОССИЙСКАЯ ФЕДЕРАЦИЯ (19) RU (11) (13) 188 424 U1 (51) МПК C12M 3/02 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА ПО ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ СОБСТВЕННОСТИ (12) ОПИСАНИЕ ПОЛЕЗНОЙ МОДЕЛИ К ПАТЕНТУ (52) СПК C12M 3/02 (2019.02); C12N 15/1003 (2019.02); C12Q 1/68 (2019.02) (21) (22) Заявка: 2018128273, 02.08.2018 (24) Дата начала отсчета срока действия патента: 02.08.2018 11.04.2019 (45) Опубликовано: 11.04.2019 Бюл. № 11 Адрес для переписки: 414004, г. Астрахань, ул. Софьи Перовской, 64, кв. 56, Рубальскому Олегу Васильевичу R U 1 8 8 4 2 4 U 1 (56) Список документов, цитированных в отчете о поиске: US 2017/0081704 A1, 23.03.2017. US 5405951 A, 11.04.1995. RU 2539030 C1, 10.01.2015. RU 2116795 C1, 10.08.1998. BY 15648 C1, 30.04.2012. (54) ДОЗИРОВАННАЯ ФОРМА ДЛЯ ВЫДЕЛЕНИЯ ДНК (57) Реферат: Полезная модель относится к медицине и предпочтительный диаметр 2,0-4,0 мм, а таблетка биологии и предназначена для использования при имеет предпочтительный диаметр 2,0-4,0 мм и производстве ...

Подробнее
Номер записи: 109
12-01-2012 дата публикации

Methods of predicting responsiveness to interferon treatment and treating hepatitis c infection

Номер: US20120009148A1
Автор: Yoav Smith
Принадлежит: Yissum Research Development Co of Hebrew University of Jerusalem

Provided are methods of predicting responsiveness of a subject to interferon treatment, comprising comparing a level of expression in a cell of the subject of at least one gene selected from the group consisting KIR3DL3, KIR3DL2, KIR3DL1, KIR2DL1, KIR2DL2, KIR2DL3, KLRG1, KIR3DS1, CD160, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-F, HLA-G and IFI27 to a reference expression data of the at least one gene obtained from at least one interferon responder subject and/or at least one interferon non-responder subject. Also provided are methods and pharmaceutical compositions for treating a subject in need of interferon treatment.

Подробнее
Номер записи: 110
12-01-2012 дата публикации

Renal cell carcinoma biomarkers

Номер: US20120009201A1
Автор: Bih-Rong Wei, Donald J. Johann, Josip Blonder, Timothy D. Veenstra
Принадлежит: US Department of Health and Human Services

Disclosed herein is a method of identifying a tumor biomarker. In one example, a tumor biomarker is identified by obtaining a peripheral biological fluid sample from a subject with a tumor as well as a tumor sample and an adjacent non-tumor sample from such subject. A protein expression profile is detected in the peripheral biological fluid sample, tumor sample and adjacent non-tumor sample. The protein expression profiles of the peripheral biological fluid sample, tumor sample and adjacent non-tumor sample are then compared, wherein an increase in expression of a specific protein in the tumor sample and peripheral biological fluid sample but not in the adjacent non-tumor sample indicates that the specific protein is a biomarker of the tumor. Also disclosed herein is a gene profiling signature that can be used to diagnosis a subject with renal cell carcinoma (RCC) or to identify agents with therapeutic potential to treat RCC. Thus, methods of diagnosing a subject with RCC are disclosed. Methods are also provided for identifying agents that alter an activity of a RCC biomarker.

Подробнее
Номер записи: 111
12-01-2012 дата публикации

Thermoelectric method of sequencing nucleic acids

Номер: US20120009568A1
Автор: Eric J. Guilbeau
Принадлежит: Individual

The present invention relates to a novel thermoelectric method for determining the sequence of nucleotides on a nucleic acid molecule through use of a thermopile and/or sequencing reagents flowing under the conditions of laminar flow. The methods disclosed herein involve the measurement of the heat generated by a deoxynucleotide incorporation event that can be accomplished without the need to control the temperature of any of a thermopile's junctions.

Подробнее
Номер записи: 112
12-01-2012 дата публикации

Tmprss2 for the diagnosis of prostate disease

Номер: US20120009571A1
Автор: Heather R. Sanders, Maher Albitar
Принадлежит: Quest Diagnostics Investments LLC

Described herein are methods, compositions and kits directed to the detection the 5′ portion of TMPRSS2 mRNA for the detection and diagnosis of prostate disease including prostate cancer and benign prostatic hyperplasia.

Подробнее
Номер записи: 113
12-01-2012 дата публикации

Inducible nucleic acid targets for detection of pathogens, methods and compositions thereof

Номер: US20120009575A1
Автор: Craig Cummings, Hemant Pawar, Manohar Furtado, Olga Petrauskene, Priya Balachandran, Robert Tebbs
Принадлежит: Life Technologies Corp

The present application describes compositions, methods and kits for rapid detection and identification of various microorganisms using inducible RNA. Methods for rapidly detecting microorganisms by detecting expression of inducible RNA of target genes following induction of a target gene using an inducer are described. Some embodiments describe methods and workflows for rapidly detecting microbes such as, but not limited to, Salmonella spp, Listeria spp. and Vibrio spp. Compositions and kits comprise primer nucleic acid sequences having hybridization specificity for priming amplification of genes of microorganisms (or gene fragments) that are responsive to one or more RNA-inducing agents. In some embodiments, kits and compositions further comprise probe nucleic acid sequences having hybridization specificity for genes responsive to RNA-inducing agents or fragments thereof.

Подробнее
Номер записи: 114
12-01-2012 дата публикации

Probe for Detection of Polymorphism in ABL Gene, and Use Thereof

Номер: US20120009576A1
Автор: Toshiya Hosomi
Принадлежит: Arkray Inc

A probe for detecting a polymorphism in ab1 gene, said probe comprising at least one fluorescence-labeled oligonucleotide selected from P1 below: (P1) an oligonucleotide comprising a nucleotide sequence complementary to a nucleotide sequence of 10 to 50 consecutive nucleotides containing nucleotides 125 to 133 in SEQ ID NO:1 or 2 or a homologous sequence thereof, wherein the nucleotide corresponding to the nucleotide at position 125 is cytosine and labeled with a fluorescent dye.

Подробнее
Номер записи: 115
12-01-2012 дата публикации

Synthesis of tagged nucleic acids

Номер: US20120009649A1
Автор: Gary Dahl, Roy Rabindranauth Sooknanan
Принадлежит: Cellscript Inc

The present invention relates generally to methods, compositions and kits for synthesizing sense RNA molecules from one or more RNA molecules of interest in a sample. In exemplary embodiments, the methods use a terminal tagging oligoribonucleotide (rTTO) to join a DNA sequence tag to the 3′-termini of first-strand cDNA molecules. The use of an rTTO comprising ribonucleotides results in decreased oligonucleotide-derived background synthesis of RNA in the absence of sample RNA and, surprisingly and unexpectedly, also results in significantly increased yields of sense RNA molecules that exhibit sequences that are substantially identical to those of the RNA molecules of interest in the sample. The sense RNA molecules also have an RNA sequence tag on their 5′-termini that is useful for fixing the lengths of sense RNA molecules that are synthesized in a second or subsequent round.

Подробнее
Номер записи: 116
12-01-2012 дата публикации

Methods for determining fraction of fetal nucleic acids in maternal samples

Номер: US20120010085A1
Автор: David A. COMSTOCK, Gabrielle HEILEK, Manjula CHINNAPPA, Michael Hunkapiller, Richard P. Rava, Yue-Jen Chuu
Принадлежит: Artemis Health Inc, Verinata Health Inc

The invention provides compositions and methods for determining the fraction of fetal nucleic acids in a maternal sample comprising a mixture of fetal and maternal nucleic acids. The fraction of fetal nucleic acids can be used in determining the presence or absence of fetal aneuploidy.

Подробнее
Номер записи: 117
12-01-2012 дата публикации

Novel uses of vegfxxxb

Номер: US20120010138A1
Автор: Andrew Salmon, David Owen Bates, Steven James Harper
Принадлежит: University of Bristol

The invention provides VEGF xxx b, or an agent which selectively promotes the expression of VEGF xxx b in preference to VEGF xxx in cells of a subject or in vitro, or an expression vector system which causes the expression of the VEGF xxx b in a host organism, for use in treating or preventing microvascular hyperpermeability disorders, or in regulating the pro-angiogenic pro-permeability properties of VEGF xxx isoforms, or in supporting epithelial cell survival without increased permeability, or in reducing the nature (for example the number density and/or size) of fenestrations of epithelial filtration membranes in vivo or in vitro.

Подробнее
Номер записи: 118
12-01-2012 дата публикации

Nucleic Acid Abundance Ratio Measurement Device, Method, and Program Storage Medium, Determination Method and Nucleic Acid Abundance Ratio Measurement Kit

Номер: US20120010821A1
Автор: Katsuyasu Hirano, Mariko Komori
Принадлежит: Arkray Inc

A nucleic acid abundance ratio measurement device includes a detection section that detects a detection signal over different temperature ranges of a melting curve for a nucleic acid mixture having one or more melting temperatures, and an abundance ratio computation section that computes a nucleic acid abundance ratio based on a ratio of characteristic amounts obtained from the detection signal detected by the detection section and based on detection amount data.

Подробнее
Номер записи: 119
19-01-2012 дата публикации

Compositions and methods for detection of hepatitis a virus nucleic acid

Номер: US20120015348A1
Автор: James D. Carlson, Steven T. Brentano
Принадлежит: Gen Probe Inc

Nucleic acid oligomeric sequences and in vitro nucleic acid amplification and detection methods for detecting the presence of HAV RNA sequences in samples are disclosed. Kits comprising nucleic acid oligomers for amplifying and detecting HAV nucleic acid sequences are disclosed.

Подробнее
Номер записи: 120
19-01-2012 дата публикации

Compositions and methods for detecting cryptococcus neoformans

Номер: US20120015362A1
Автор: Eli Mordechai, John Entwistle, Martin Adelson, Melanie Feola
Принадлежит: Medical Diagnostic Laboratories LLC

Disclosed are oligonucleotides useful in methods for determining whether a sample contains Cryptococcus neoformans , a causative agent for human cryptococcosis. These oligonucleotides, which have nucleotide sequences derived from a coding segment of the gene encoding the fungal specific transcription factor gene in Cryptococcus neoformans , are useful as forward and reverse primers for a polymerase chain reaction using nucleic acids from a biological sample as templates, and as probes for detecting any resultant amplicon. Detection of an amplicon indicates the sample contains Cryptococcus neoformans . Real-time PCR and detection using florescence resonance energy transfer is disclosed.

Подробнее
Номер записи: 121
19-01-2012 дата публикации

Methods and compositions to identify increased risk of breast cancer by detection of cpg island methylator phenotype (cimp)

Номер: US20120015366A1
Автор: Victoria L. Seewaldt
Принадлежит: Duke University

The present invention is directed to kits and methods for identifying a female subject as having an increased risk of developing breast cancer, comprising detecting a CPG island methylator phenotype (CIMP) in nucleic acid of the subject.

Подробнее
Номер записи: 122
19-01-2012 дата публикации

Sensor Housing and Reagent Chemistry

Номер: US20120015444A1
Автор: David G. Kellner, Debapriya Mazumdar
Принадлежит: ANDALYZE Inc

A sensor comprises a sensor housing, having a channel; a porous substrate, in the channel; an analysis chemistry reagent, on the porous substrate; and a nozzle, in fluid connection with the channel. The porous substrate fills a cross section of the channel, and the cross-sectional area of the channel at the porous substrate is greater than the cross-sectional area at the nozzle.

Подробнее
Номер записи: 123
19-01-2012 дата публикации

Microrna profiles for evaluating multiple sclerosis

Номер: US20120015830A1
Автор: Douglas W. Bigwood, Eric M. Eastman, Michael Elashoff
Принадлежит: DIOGENIX Inc

The present invention provides methods, systems, and kits for evaluating multiple sclerosis (MS) in a patient. Particularly, the invention provides convenient miRNA-based tests for evaluating a patient for MS, including for diagnosing MS, for excluding MS as a diagnosis, for determining the presence of disease activity associated with MS, and for monitoring the course of disease or efficacy of treatment for MS.

Подробнее
Номер записи: 124
19-01-2012 дата публикации

Method of immobilizing and stretching a nucleic acid on a substrate

Номер: US20120016110A1
Автор: Akio Yasuda, Jurina Wessels, William E. Ford
Принадлежит: Individual

The present invention relates to a method of immobilizing and stretching a nucleic acid on a silicon substrate, to nucleic acids and substrates prepared according to this method, to uses of the method and to uses of the nucleic acid and the substrate.

Подробнее
Номер записи: 125
19-01-2012 дата публикации

Transcript mapping method

Номер: US20120016595A1
Автор: Wing Kin Ken Sung, Yijun Ruan
Принадлежит: Agency for Science Technology and Research Singapore

A transcript mapping method according to an embodiment of the invention is described hereinafter and combines short tag based (SAGE and MPSS) efficiency with the accuracy of full-length cDNA (flcDNA) for comprehensive characterization of transcriptomes. This method is also referred to as Gene Identification Signature (GIS) analysis. In this method, the 5′ and 3′ ends of full-length cDNA clones are initially extracted into a ditag structure, with the ditag concatemers of the ditag being subsequently sequenced in an efficient manner, and finally mapped to the genome for defining the gene structure. As a GIS ditag represents the 5′ and 3′ ends of a transcript, it is more informative than SAGE and MPSS tags. Segment lengths between 5′ and 3′ tag pairs are obtainable including orientation, ordering and chromosome family for efficient transcript mapping and gene location identification. Furthermore, a compressed suffix array (CSA) is used for indexing the genome sequence for improve mapping speed and to reduce computational memory requirements.

Подробнее
Номер записи: 126
26-01-2012 дата публикации

Methods and Devices for Rapid Urine Concentration

Номер: US20120021407A1
Автор: Yousef Haj-Ahmad
Принадлежит: Norgen Biotek Corp

The present invention provides a device for the concentration of one or more target analytes contained in a urine sample. The device comprises a tube comprising an upper portion defining an opening for receiving the urine sample and a lower tapered portion terminating in collection reservoir. The tube contains a predetermined amount of a particulate binding agent which specifically binds the one or more target analytes and of a predetermined amount of a binding buffer. The device comprises means for seating the opening of the tube. The present invention further provides methods and kits for concentrating one or more target analytes in murine sample.

Подробнее
Номер записи: 127
26-01-2012 дата публикации

DOPAMINERGIC NEURON PROLIFERATIVE PROGENITOR CELL MARKER Nato3

Номер: US20120021417A1
Автор: Tomoya Nakatani, Yasuko Nakagawa, Yoshimasa Sakamoto, Yuichi Ono
Принадлежит: Eisai R&D Management Co Ltd

The present invention is a probe, a primer, and an antibody, for detecting a dopaminergic neuron proliferative progenitor cell. According to the present invention, there is provided a polynucleotide probe and a polynucleotide primer for use in the detection or selection of a dopaminergic neuron proliferative progenitor cell, which can hybridize with a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence of a Nato3 gene, or a complementary sequence thereto, and an antibody against a Nato3 protein, or a part thereof for use in the detection or selection of a dopaminergic neuron proliferative progenitor cell.

Подробнее
Номер записи: 128
26-01-2012 дата публикации

Synthetic siRNA Detection Method

Номер: US20120021420A1
Автор: Eiji Kobayashi, Hiroyuki Mukai, Satoshi Yanagi, Takashi Uemori
Принадлежит: Takara Bio Inc

A method for accurately and easily detecting a synthetic siRNA, for example, a siRNA in which the 3′ end is DNA, and a kit used for the method are provided. The present invention relates to a method for detecting a siRNA in which the 3′ end is DNA, comprising: (a) adding polydeoxyadenosine to the 3′ DNA end of at least one strand of the siRNA to be detected to produce a polydeoxyadenosine-added RNA; (b) annealing a polydeoxythymidine primer having a tag sequence at its 5′ side to the polydeoxyadenosine-added RNA and synthesizing DNA from the primer by a reverse transcription; and (c) detecting the DNA synthesized in (b).

Подробнее
Номер записи: 129
26-01-2012 дата публикации

Materials and methods for isothermal nucleic acid amplification

Номер: US20120021460A1
Автор: Anna K. Fulbright, Brian Lowe
Принадлежит: Qiagen Gaithersburg LLC

A method for isothermal amplification of a target nucleic acid sequence is disclosed. The target nucleic acid is amplified by an enzyme with helicase activity and an enzyme with reverse transcriptase activity and DNA-dependant DNA polymerase activity. Also disclosed is a kit for isothermal amplification of a target nucleic acid sequence, including HPV nucleic acids. The kit comprises a first enzyme with helicase activity and a second enzyme having both reverse transcriptase activity and DNA-dependant DNA polymerase activity.

Подробнее
Номер записи: 130
26-01-2012 дата публикации

Optics collection and detection system and method

Номер: US20120021525A1
Автор: Adrian Fehr, Nathaniel Joseph McCaffrey, Stephen Turner
Принадлежит: Pacific Biosciences of California Inc

Optics collection and detection systems are provided for measuring optical signals from an array of optical sources over time. Methods of using the optics collection and detection systems are also described.

Подробнее
Номер записи: 131
26-01-2012 дата публикации

Genetic markers for risk management of atrial fibrillation and stroke

Номер: US20120021989A1
Автор: Daniel Gudbjartsson, Hilma Holm
Принадлежит: DECODE GENETICS EHF

The invention relates to procedures and methods of determining a susceptibility to cardiac arrhythmia, including Atrial Fibrillation, Atrial Flutter and Stroke, by assessing the presence or absence of alleles at polymorphic markers found to be associated with risk of these conditions. The invention further relates to kits encompassing reagents for assessing such markers, and diagnostic 5 methods, uses and procedures for utilizing such susceptibility markers.

Подробнее
Номер записи: 132
26-01-2012 дата публикации

Array configuration and readout scheme

Номер: US20120022795A1
Автор: Jeremy JORDAN, Kim Johnson, Mark Milgrew, Peter Levine
Принадлежит: Life Technologies Corp

The described embodiments may provide a chemical detection circuit that may comprise a plurality of first output circuits at a first side and a plurality of second output circuits at a second side of the chemical detection circuit. The chemical detection circuit may further comprise a plurality of tiles of pixels each placed between respective pairs of first and second output circuits. Each tile may include four quadrants of pixels. Each quadrant may have columns with designated first columns interleaved with second columns. Each first column may be coupled to a respective first output circuit in first and second quadrants, and to a respective second output circuit in third and fourth quadrants. Each second column may be coupled to a respective second output circuit in first and second quadrants, and to a respective first output circuit in third and fourth quadrants.

Подробнее
Номер записи: 133
02-02-2012 дата публикации

Method and compositions for cancer prognosis

Номер: US20120027750A1
Автор: Guillaume Cartron, Hervé WATIER
Принадлежит: Centre Hospitalier Regional Universitaire De Tours, UNIVERSITE FRANCOIS RABELAIS DE TOURS

Methods are provided to determine the cancer prognosis of subjects and/or to adapt the treatment protocol of subjects having or susceptible to cancer. Embodiments include the steps of determining in vitro the genotype of said subject at a polymorphism in the C3-ITGAM axis, making a cancer prognosis of the subject based on said genotype and selecting an anti-cancer treatment for the subject.

Подробнее
Номер записи: 134
02-02-2012 дата публикации

Compositions and methods for treating or preventing inflammatory bowel disease and colon cancer

Номер: US20120027799A1
Автор: Cynthia L. Sears, Drew M. Pardoll, Franck Housseau, Shaoguang Wu
Принадлежит: JOHNS HOPKINS UNIVERSITY

The invention provides compositions and methods for useful for the diagnosis of inflammatory bowel disease, ETBF-induced colitis, colonic hyperplasia and/or colon carcinogenesis in a subject in biological samples (e.g., stool, urine, blood, serum, tissue). The invention further provides compositions and methods for the treatment or prevention of colitis, colon cancer, or inflammatory bowel disease (e.g., Crohn's disease).

Подробнее
Номер записи: 135
02-02-2012 дата публикации

Galectin-1 (gal1) as a biomarker for differential diagnosis of osteosarcoma and chondrosarcoma

Номер: US20120028825A1
Автор: Anne Gomez-Brouchet, Claudine Schiff
Принадлежит: CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale INSERM, UNIVERSITE de la MEDITERRANNEE

The present invention relates to a method for differential diagnosis of osteosarcoma and chondrosarcoma, especially chondroblastic osteosarcoma and conventional chondrosarcoma, in a patient comprising a step consisting of detecting galectin-1 (GAL1) expression in a bone sample obtained from said patient.

Подробнее
Номер записи: 136
02-02-2012 дата публикации

Method for determining a risk, for a subject, of suffering from atopic dermatitis or severity of atopic dermatitis for a subject suffering from atopic dermatitis and method for using a single-nucleotide polymorphism rs12313273 as a biomarker for determining the development or severity of atopic dermatitis

Номер: US20120028827A1
Автор: Chih-Hung Lee, Hsin-Su Yu, Suh-Hang Juo, Wei-Chiao Chang, Wei-Chiao Chen
Принадлежит: KAOHSIUNG MEDICAL UNIVERSITY

The invention provides a method for determining a risk, for a subject, of suffering from atopic dermatitis, including: obtaining a biosample of the subject; detecting the presence of the single-nucleotide polymorphism rs12313273 (C/T) at position 30881 of the ORAI1 gene (SEQ ID No.: 1) in the biosample; and determining the risk, for the subject, of suffering from atopic dermatitis, wherein the presence of a C allele or genotype CC of the single-nucleotide polymorphism rs12313273 (C/T) indicates that the subject is at increased risk for suffering from atopic dermatitis.

Подробнее
Номер записи: 137
09-02-2012 дата публикации

Marker for Liver-Cancer Diagnosis and Recurrence and Survival Prediction, a Kit Comprising the Same, and Prognosis Prediction in Liver-Cancer Patients Using the Marker

Номер: US20120034235A1
Автор: Chul Ju Han, Dong Hyoung Lee, Eun Ju LEE, Eun Ran Park, Hyun Jin Shin, Kee Ho Lee, Myoung Jin Park, Pu Hyeon Cha, Sang Bum Kim, Sang Gu Hwang, Seon Rang Woo, Sun Hoo Park, Yong Ho Ham
Принадлежит: Korea Institute of Radiological and Medical Sciences

A composition for detecting a marker for the diagnosis or prognosis of liver cancer is disclosed. The composition includes an agent capable of assessing the expression level of UQCRH (ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein). In addition, a kit having the composition, a microarray for the diagnosis of liver cancer using the marker, and a method for detecting the marker, and predicting recurrence following surgery in liver cancer patients are disclosed. The marker is able to contribute to the early diagnosis of liver cancer and prediction of recurrence following surgery and survival of liver cancer patients who have undergone hepatic resection, and also is significant for being a promising therapeutic target for liver cancer.

Подробнее
Номер записи: 138
09-02-2012 дата публикации

Ligation-based detection of genetic variants

Номер: US20120034603A1
Автор: Andrew Sparks, Arnold Oliphant, John Stuelpnagel, Ken Song
Принадлежит: Tandem Diagnostics Inc

The present invention provides assays systems and methods for detection of genetic variants in a sample, including copy number variation and single nucleotide polymorphisms. The invention preferably employs the technique of tandem ligation, i.e. the ligation of two or more fixed sequence oligonucleotides and one or more bridging oligonucleotides complementary to a region between the fixed sequence oligonucleotides.

Подробнее
Номер записи: 139
09-02-2012 дата публикации

Cell lines producing blocking antibodies to human RANKL

Номер: US20120034690A1
Автор: Dirk M. Anderson
Принадлежит: Immunex Corp

Described herein are cell lines and methods for preparing antibodies that bind RANKL, including cell lines that produce blocking antibodies to human RANKL.

Подробнее
Номер записи: 140
09-02-2012 дата публикации

Compositions and methods for the treatment of immune related diseases

Номер: US20120035073A1
Автор: Brisdell Hunte, Hilary Clark, Janet K. Jackman, Jill R. Schoenfeld, P. Mickey Williams, Sarah C. Bodary-Winter, Thomas D. Wu, William I. Wood
Принадлежит: Individual

The present invention relates to compositions containing novel proteins and methods of using those compositions for the diagnosis and treatment of immune related diseases.

Подробнее
Номер записи: 141
09-02-2012 дата публикации

Antireflective Coatings for High-Resolution Photolithographic Synthesis of DNA Array

Номер: US20120035083A1
Автор: Bei-Shen Sywe, Dana Truong, Glenn H. McGall, Lisa T. Kajisa, Mark O. Trulson, Martin J. Goldberg, Richard P. Rava
Принадлежит: Affymetrix Inc

The present invention provides an array of polymers and methods of forming arrays of polymers by providing a substrate having a first layer including one or more dielectric coatings on a solid support and a second layer including a plurality of polymers disposed on the first layer. The invention also provides methods for forming an array of polymers on a substrate using light-directed synthesis by providing a substrate having a first layer including one or more dielectric coatings on a solid support, derivatizing the first layer by contacting the first layer with a silanation reagent, and a second layer disposed on said first layer wherein the second layer includes functional groups protected with a photolabile protecting group.

Подробнее
Номер записи: 142
09-02-2012 дата публикации

Dual targeting of mir-208 and mir-499 in the treatment of cardiac disorders

Номер: US20120035243A1
Автор: Eric Olson, Eva Van Rooij
Принадлежит: University of Texas System

The present invention provides a method of treating or preventing cardiac disorders in a subject in need thereof by inhibiting the expression or function of both miR-499 and miR-208 in the heart cells of the subject. In particular, specific protocols for administering inhibitors of the two miRNAs that achieve efficient, long-term suppression are disclosed. In addition, the invention provides a method for treating or preventing musculoskeletal disorders in a subject in need thereof by increasing the expression or activity of both miR-208 and miR-499 in skeletal muscle cells of the subject.

Подробнее
Номер записи: 143
09-02-2012 дата публикации

GC Wave Correction for Array-Based Comparative Genomic Hybridization

Номер: US20120035860A1
Автор: Angela Leo, Thomas Scholl, Viatcheslav R. Akmaev
Принадлежит: Esoterix Genetic Laboratories LLC

The present invention provides, among other things, new methods for optimizing comparative genomic hybridization (CGH) data analysis. In particular, the methods of the invention provide increased sensitivity and specificity due to the implemented individual chromosome-based GC-wave correction. In certain embodiments, the log ratios of probes derived from each chromosome are corrected based on the chromosome's GC content slope, and certain selected chromosomes undergo chromosomal median adjustment. As a result, the log ratios of the probes on the array are normalized to be closer to zero (0) for diploid regions and thus, the GC waves are substantially reduced, resulting in a reduced false positive rate. Systems, computer readable media, and kits for use in the optimized CGH methods also are provided.

Подробнее
Номер записи: 144
09-02-2012 дата публикации

Predictive models and method for assessing age

Номер: US20120036101A1
Автор: James A. Winrove, Michael R. Elashoff, Steve Rosenberg, Whittemore G. Tingley
Принадлежит: CardioDX Inc

Biomarkers useful for diagnosing and assessing physiological age are provided, along with kits for measuring their expression. The invention also provides predictive models, based on the biomarkers, as well as computer systems, and software embodiments of the models for scoring and optionally classifying samples. In a preferred embodiment, the biomarkers include a group of biomarkers whose expression levels are highly correlated to each other. In a preferred embodiment, expression levels of CD248; CD248 and SLC 1A7; CD248 and one, two, three or four of the group consisting of CCR7, B3GAT1, VSIG4 and LR-RN3; or CD248, SLC1A7 and one, two, three or four of the group consisting of CCR7, B3GAT1, VSIG4 and LRRN3 are determined.

Подробнее
Номер записи: 145
16-02-2012 дата публикации

Genetic polymorphisms associated with venous thrombosis, methods of detection and uses thereof

Номер: US20120039864A1
Автор: Frits R. Rosendaal, Irene D. Bezemer, James J. Devlin, Lance Bare, Pieter H. Reitsma
Принадлежит: Celera Corp, Leids Universitair Medisch Centrum LUMC

The present invention is based on the discovery of genetic polymorphisms that are associated with coronary heart disease and in particular VT and response to drug treatment. In particular, the present invention relates to nucleic acid molecules containing the polymorphisms, variant proteins encoded by such nucleic acid molecules, reagents for detecting the polymorphic nucleic acid molecules and proteins, and methods of using the nucleic acid and proteins as well as methods of using reagents for their detection.

Подробнее
Номер записи: 146
16-02-2012 дата публикации

Compositions and methods for diagnosing prostate cancer based on detection of slc45a3-elk4 fusion transcript

Номер: US20120039887A1
Автор: David S. Rickman, Dorothee Pflueger, Mark A. Rubin
Принадлежит: CORNELL UNIVERSITY

RNA transcripts representing a fusion of a human SLC45A3 nucleic acid and a human ELK4 nucleic acid that are associated with prostate cancer are described. Compositions and methods useful for detection of fusion transcripts of human SLC45A3 and ELK4 genetic sequences associated with cancer and useful for cancer therapy are provided.

Подробнее
Номер записи: 147
16-02-2012 дата публикации

Conformational Epitope Initiated Signal Amplification

Номер: US20120040337A1
Автор: John T. Unger, Rolf Hilfiker
Принадлежит: Individual

This invention relates to a method to generate a signal used to detect the presence or quantity of a biomarker in a sample. The signal generating reaction is initiated when the biomarker under assay interacts with a specific binding partner. The interaction produces a structural change in the binding partner that is recognized by additional binding partners capable of generating a signal. The reaction produces a localized cluster of signaling molecules that can be detected above background. The signaling cluster is detectable within minutes when interrogated in a chamber of specific dimensions. The presence of the signaling clusters is a qualitative indication of the presence of the analyte, while the number of signaling clusters detected is a direct quantification of the number of biomarker molecules in the sample. The reaction can be formatted to detect proteins, nucleic acids, cells or other informative biomarkers.

Подробнее
Номер записи: 148
16-02-2012 дата публикации

RBM3 in Testicular Cancer Diagnostics and Prognostics

Номер: US20120040338A1
Автор: Jakob Eberhard, Karin Jirstrom
Принадлежит: Atlas Antibodies AB

The present disclosure provides a method for determining whether a mammalian subject belongs to a first or a second group, wherein subjects of the first group have a higher risk of having a testicular disorder than subjects of the second group, comprising the steps of: evaluating an amount of RBM3 protein or RBM3 mRNA in at least part of an earlier obtained sample comprising biological material from a testicle of said subject and determining a sample value corresponding to the evaluated amount; comparing said sample value with a predetermined reference value; and if said sample value is higher than said reference value, concluding that the subject belongs to the first group; and if said sample value is lower than or equal to said reference value, concluding that the subject belongs to the second group. Further, a prognostic method for testicular cancer is provided, as well as means and uses with prognostic and diagnostic applications.

Подробнее
Номер записи: 149
16-02-2012 дата публикации

Primers, probes and methods for nucleic acid amplification

Номер: US20120040352A1
Автор: Arthur Reis, Cristina Hartshorn, J. Aquiles Sanchez, Jesse Salk, John Rice, Kenneth Pierce, Lawrence J. Wangh
Принадлежит: BRANDEIS UNIVERSITY

Homogenous detection during or following PCR amplification, preferably LATE-PCR, utilizing fluorescent DNA dye and indirectly excitable labeled primers and probes, improves reproducibility and quantification. Low-temperature homogeneous detection during or following non-symmetric PCR amplification, preferably LATE-PCR, utilizing fluorescent DNA dye and indirectly excitable labeled mismatch-tolerant probes permits analysis of complex targets. Sequencing sample preparation methods following LATE-PCR amplifications reduce complexity and permit “single-tube” processing.

Подробнее
Номер записи: 150
16-02-2012 дата публикации

Real time multiplex pcr detection on solid surfaces using double stranded nucleic acid specific dyes

Номер: US20120040853A1
Автор: Anke Pierik, Danielle Elisa Willemine CLOUT, Derk Jan Wilfred Klunder, Hendrik Roelof Stapert, Marius losif Boamfa, Richard Joseph Marinus Schroedes
Принадлежит: KONINKLIJKE PHILIPS ELECTRONICS NV

The present invention provides method allowing for real time detection of a multitude of target nucleic acids of interest in one reaction (multiplexing) using dyes that are specific for double stranded nucleic acids.

Подробнее
Номер записи: 151
16-02-2012 дата публикации

Biomarkers for stroke

Номер: US20120040858A1
Автор: Byron D. Ford, Gregory Ford
Принадлежит: Morehouse School of Medicine Inc

Biomarkers for stroke and methods for their detection are disclosed. In one aspect, the present application discloses biomarkers for the diagnosis of stroke in a subject. In another aspect, the application discloses a method for the diagnosis of stroke in a subject. The method comprises detection of stroke biomarkers in cerebrospinal fluid, blood, serum or PMBCs of a subject. Also disclosed is a kit for the detection of biomarkers for the diagnosis of stroke in a subject.

Подробнее
Номер записи: 152
16-02-2012 дата публикации

Target substance detection method using aptamer

Номер: US20120040865A1
Автор: So Youn Kim
Принадлежит: Industry Academic Cooperation Foundation of Dongguk University

The present invention relates to a method and kit of detecting a target material using an aptamer, and more particularly to a method and kit for detecting a target material, in which a sample and a second aptamer are added to a first aptamer immobilized on a solid phase so as to form a bond sandwiched between the first aptamer, the target material and the second aptamer, to an FET sensor-based method and kit for detecting a target material, and to an AAO sensor-based method and kit for detecting a target material. The inventive method for a target material using an aptamer can detect even low-molecular-weight materials which were difficult to detect in the prior art, thereby enabling detection of disease-related metabolites, environmental pollutants and food toxins in solutions. In addition, the detection method of the present invention is a direct and simple method and is highly cost-effective, because it uses the aptamer which can be consistently reproduced and can be produced at low costs. Thus, the present invention is very useful.

Подробнее
Номер записи: 153
23-02-2012 дата публикации

Method and device for electrowetting genetic analysis

Номер: US20120045798A1
Автор: Christine Peponnet, Dorothee Jary, Valérie VAN WILDER
Принадлежит: Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA

It relates to a method for amplifying at least one nucleotide molecule contained in a sample (E) comprising the following successive steps consisting of (a) subjecting said sample (E) to a 1st amplification step on an area (Z 1 ) of a support; (b) bringing by electrowetting at least one portion of the sample (Ea) obtained after step (a) from the area (Z 1 ) onto at least one area (Z 2 ) of said support, distinct from the area (Z 1 ); (c) subjecting the sample (Ea) to a 2nd amplification step on said area (Z 2 ). It also relates to a device which may be applied within the scope of said method.

Подробнее
Номер записи: 154
23-02-2012 дата публикации

Mostly Natural DNA Sequencing by Synthesis

Номер: US20120046177A1
Автор: Eric Roller, Xiaohua Huang
Принадлежит: UNIVERSITY OF CALIFORNIA

The invention provides a new method for DNA sequencing called “natural sequencing by synthesis” (nSBS). According to the method, DNA that includes a desired sequence is synthesized using a dNTP mix with a small percentage of fluorescently-labeled nucleotides. The fluorescent label is cleavable. In contrast to previous methods that utilize 100% labeled nucleic acids, use of a small percentage of labeled nucleic acids minimizes the distortion of the natural structure of the extending DNA strand and the DNA polymerase. Using the disclosed methods with less than 10,000 copies of template DNA and 10% of the nucleotides labeled, long homopolymer stretches up to 20 bases can be sequenced with high accuracy and Q20 (with 99% accuracy) read lengths of up to 1,000 bases can be achieved. A Q20 read length of greater than 100 bases can potentially be achieved, even if the sequencing is performed with 1,000 copies of a template and 10% of the nucleotides labeled.

Подробнее
Номер записи: 155
23-02-2012 дата публикации

Detecting bcl-b expression in cancer and uses thereof

Номер: US20120046195A1
Автор: John C. Reed, Maryla Krajewska
Принадлежит: SANFORD BURNHAM PREBYS MEDICAL DISCOVERY INSTITUTE

Provided herein are compositions and methods of detecting Bcl-B expression in cancer cells to prognose, monitor, or select therapies for cancers such as breast cancer, prostate cancer, lung cancer, or gastric cancer.

Подробнее
Номер записи: 156
23-02-2012 дата публикации

Systems and methods to detect copy number variation

Номер: US20120046877A1
Автор: Fiona Hyland, Rajesh Gottimukkala
Принадлежит: Life Technologies Corp

In one aspect, a system for implementing a copy number variation analysis method, is disclosed. The system can include a nucleic acid sequencer and a computing device in communications with the nucleic acid sequencer. The nucleic acid sequencer can be configured to interrogate a sample to produce a nucleic acid sequence data file containing a plurality of nucleic acid sequence reads. In various embodiments, the computing device can be a workstation, mainframe computer, personal computer, mobile device, etc. The computing device can comprise a sequencing mapping engine, a coverage normalization engine, a segmentation engine and a copy number variation identification engine. The sequence mapping engine can be configured to align the plurality of nucleic acid sequence reads to a reference sequence, wherein the aligned nucleic acid sequence reads merge to form a plurality of chromosomal regions. The coverage normalization engine can be configured to divide each chromosomal region into one or more non-overlapping window regions, determine nucleic acid sequence read coverage for each window region and normalize the nucleic acid sequence read coverage determined for each window region to correct for bias. The segmentation engine can be configured to convert the normalized nucleic acid sequence read coverage for each window region to discrete copy number states. The copy number variation identification engine can be configured to identify copy number variation in the chromosomal regions by utilizing the copy number states of each window region.

Подробнее
Номер записи: 157
01-03-2012 дата публикации

Markers and methods for assessing and treating lupus patients susceptible to photoprovocation

Номер: US20120052066A1
Автор: Cesar Calderon, John Getsy
Принадлежит: Centocor Inc

A method for predicting or detecting susceptibility to lupus of an individual subjected to photoprovocation obtains biological samples from the individual before and after exposure to photoprovocation and compares the levels of at least a portion of members of a 45-member panel or subset thereof to determine whether the individual is susceptible to lupus. The method enables identification of potential lupus patients prior to onset of disease symptoms.

Подробнее
Номер записи: 158
01-03-2012 дата публикации

Compositions, Kits, and Methods for Predicting Anti-Cancer Response to Anthracyclines

Номер: US20120052079A1
Автор: Andrea L. Richardson, Zhigang C. Wang
Принадлежит: Dana Farber Cancer Institute Inc

The present invention is based, in part, on the discovery that amplification of human chromosome 8q22-23 regions and over-expression of 8q22-23 genes (e.g., LAPTM4B and YWHAZ) is associated with and predictive of resistance to anthracycline-type chemotherapy. Accordingly, the invention relates to compositions, kits, and methods for predicting the response of cancer cells, e.g., breast, prostate, lung, ovarian, pancreatic, liver, and colon malignancies to anthracyclines.

Подробнее
Номер записи: 159
01-03-2012 дата публикации

Photodamage mitigation compounds and systems

Номер: US20120052488A1
Автор: Andrei Fedorov, John Lyle, Robert Weber, Stephen Yue, Xiangxu Kong
Принадлежит: Pacific Biosciences of California Inc

Compositions, devices, systems and methods for reducing and/or preventing photo-induced damage of one or more reactants in an illuminated analytical reaction by addition of one or more photoprotective compounds to the reaction mixture and allowing the reaction to proceed for a period that is less than a photo-induced damage threshold period.

Подробнее
Номер записи: 160
01-03-2012 дата публикации

Methods and systems for monitoring reactions

Номер: US20120052490A1
Автор: John Eid, Stephen Turner
Принадлежит: Pacific Biosciences of California Inc

Methods and systems for monitoring reactions by observing signals deriving from those reactions, using signal processing that allows differentiation between signals that are otherwise optically overlapping by conventional detection methods. Centroid determination is used to identify signal sources that are presenting confounding overlapping signals due to their physical proximity, and/or to identify discrete signals from different reaction centers.

Подробнее
Номер записи: 161
01-03-2012 дата публикации

OLIGONUCLEOTIDES FOR DETECTING E. coli O157:H7 STRAINS AND USE THEREOF

Номер: US20120052494A1
Автор: Jason Opdyke, Jun Li, Win Den Cheung
Принадлежит: Samsung Techwin Co Ltd

Oligonucleotides, a kit, and a method for detecting E. coli O157:H7 strains are provided. According to the kit for detecting E. coli O157:H7 strains and the method of detecting E. coli O157:H7 strains by using the kit, the results of the detection can be rapidly identified with a reduced number of copies of a sample in real-time.

Подробнее
Номер записи: 162
01-03-2012 дата публикации

Cyanine dyes

Номер: US20120052506A1
Автор: David Sun, Gene Shen, Stephen Yue
Принадлежит: Pacific Biosciences of California Inc

The invention provides a novel class of cyanine dyes that are functionalized with sulfonic acid groups and a linker moiety that facilitates their conjugation to other species and substituent groups which increase the water-solubility, and optimize the optical properties of the dyes. Also provided are conjugates of the dyes, methods of using the dyes and their conjugates and kits including the dyes and their conjugates.

Подробнее
Номер записи: 163
01-03-2012 дата публикации

Phospholinked dye analogs with an amino acid linker

Номер: US20120052507A1
Автор: Gene Shen
Принадлежит: Pacific Biosciences of California Inc

In various embodiments, the present invention provides fluorescent dyes that are linked to another species through an amino acid or peptide linker. In an exemplary embodiment, the dye is linked to a polyphosphate nucleic acid through an amino acid or peptide linker. These conjugates find use in single molecule DNA sequencing and other applications. In various embodiments, the dye moiety is a cyanine dye. Cyanine dyes that are highly charged, such as those including muliple sulfonate, alkylsulfonate, carboxylate and/or alkylcarboxylate moieties are examples of cyanine dyes of use in the compounds of the invention.

Подробнее
Номер записи: 164
01-03-2012 дата публикации

Genetic markers and diagnostic methods for resistance of breast cancer to hormonal therapies

Номер: US20120052508A1
Автор: Erhan Bilal, Gyan Bhanot, Shrider Ganesan
Принадлежит: Rutgers State University of New Jersey

This application provides a method to identify genetic markers associated with increased sensitivity or resistance to hormonal therapies using an outlier analysis. More specifically, this application discloses that amplifications on chromosomes 8 and 17 are associated with increased proliferation and poor outcome in ER-positive breast cancer, and amplicons 17q21.33-q25.1, 8p11.2 and 8q24.3 may be responsible for higher proliferation and poor outcome in the setting of antiestrogen, in particular Tamoxifen, treatment clinically observed in a subset of ER-positive, HER2-negative breast cancers. The invention also provides use of the identified genetic markers in the development of targeted treatments for antiestrogen-resistant ER-positive breast cancers as well as in improving current methods of drug response prediction.

Подробнее
Номер записи: 165
01-03-2012 дата публикации

Methods for sequencing polynucleotides

Номер: US20120053063A1
Автор: Jonathan Mark Boutell, Niall Anthony Gormley, Roberto Rigatti
Принадлежит: Illumina Cambridge Ltd

Provided herein is a method for sequencing a polynucleotide molecules. The method includes the steps of providing a plurality of polynucleotide molecules attached to a surface, wherein a first portion of each polynucleotide molecule is attached to a first location of the surface and a second portion of each polynucleotide molecule is attached to a second location of the surface, the relative proximity of the first and second locations being correlated with the probability that the first and second portions are paired, separating the first and second portions of the polynucleotide molecules on the surface, determining the sequences of the first and second portions of the polynucleotide molecules and comparing the relative proximities and the sequences to determine which first and second portions are paired and to determine the sequence of the target polynucleotide molecules.

Подробнее
Номер записи: 166
01-03-2012 дата публикации

Genetic Risk Analysis In Reward Deficiency Syndrome

Номер: US20120053070A1
Автор: Kenneth Blum, Roger L. Waite, William B. Downs, William J. Heaney
Принадлежит: Individual

Methods and kits for performing genetic analyses of biological samples to assess predisposition for and/or to stratify risk Reward Deficiency Syndrome (RDS) behavior, including various addictive and/or compulsive behaviors, are described. The methods and kits of the invention use different nucleic acid probes to determine if a human subject's genome contains one or more alleles for one or more genes implicated in RDS.

Подробнее
Номер записи: 167
01-03-2012 дата публикации

Method for the detection of dna methylation patterns

Номер: US20120053071A1
Автор: Chetan Mittal, Nevenka Dimitrova, Sitharthan Kamalakaran
Принадлежит: KONINKLIJKE PHILIPS ELECTRONICS NV

The present invention relates to a method for the detection of a DNA methylation signature associated with the presence of or the predisposition to develop a disorder, the method comprising the identification of one or more candidate genes exhibiting differential DNA methylation in target and reference samples as well as the respective determination of the nucleic acid sites in said candidate genes that are differentially methylated and the recognition sites for DNA binding factors, said DNA binding factors each recognizing such a differentially methylated nucleic acid site, wherein the patterns of differentially methylated nucleic acid sites and of DNA binding factor recognition sites obtained together represent a DNA methylation signature that is indicative for the presence of or the predisposition to develop a disorder in a target sample.

Подробнее
Номер записи: 168
01-03-2012 дата публикации

Methods of creating and screening dna-encoded libraries

Номер: US20120053091A1
Автор: Richard W. Wagner
Принадлежит: X Chem Inc

The present invention features a number of methods for identifying one or more compounds that bind to a biological target. The methods include synthesizing a library of compounds, wherein the compounds contain a functional moiety having one or more diversity positions. The functional moiety of the compounds is operatively linked to an initiator oligonucleotide that identifies the structure of the functional moiety.

Подробнее
Номер записи: 169
01-03-2012 дата публикации

Methods of predicting medically refractive ulcerative colitis (mr-uc) requiring colectomy

Номер: US20120053131A1
Автор: Dermot P. McGovern, Jerome I. Rotter, Kent D. Taylor, Stephan R. Targan, Talin Haritunians, Xiuqing Guo
Принадлежит: Cedars Sinai Medical Center

Disclosed are methods of predicting the development of medically refractory ulcerative colitis (MR-UC) in a patient In one embodiment, disclosed is a method of prognosing ulcerative colitis in an individual by determining the presence or absence of one or more risk variants, where the presence of one or more risk variants is indicative of a severe and/or aggressive form of ulcerative colitis. In another embodiment, the severe form of ulcerative colitis is indicative of MR-UC.

Подробнее
Номер записи: 170
01-03-2012 дата публикации

ISOLATED GENOMIC POLYNUCLEOTIDE FRAGMENTS FROM THE p15 REGION OF ISOLATED GENOMIC POLYNUCLEOTIDE FRAGMENTS FROM THE p15 REGION OF CHROMOSOME 11 ENCODING HUMAN TUMOR SUPPRESSING SUBTRANSFERABLE CANDIDATE 4 (TSSC4)

Номер: US20120053232A1
Автор: James W. Ryan
Принадлежит: RYOGEN LLC

Provided herein are isolated genomic polynucleotide fragments from the from the p15 region of chromosome 11 encoding human and tumor suppressing subtransferable candidate 4 (TSSC4) and methods of use.

Подробнее
Номер записи: 171
01-03-2012 дата публикации

Corn Variety DE811ASR(BC5)

Номер: US20120054921A1
Автор: Alexandre Da Silva Conceicao, Dilbag Singh Multani, Elizabeth S. Jones, James A. Hawk, Jennifer S. Jaqueth, Karen E. Broglie, Karlene H. Butler, Marymar G. Butruille, Petra Johanna Christina Cecilia Wolters, Travis James Frey
Принадлежит: EI Du Pont de Nemours and Co, PIONEER HI BRED INTERNATIONAL INC, University of Delaware

This invention relates to polynucleotide sequences encoding a gene that can confer resistance to the plant pathogen Colletotrichum , which causes anthracnose stalk rot, leaf blight and top dieback in corn and other cereals. It further relates to plants and seeds of plants carrying chimeric genes comprising said polynucleotide sequences, which enhance or confer resistance to the plant pathogen Colletotrichum , and processes of making said plants and seeds. The invention further presents sequences that can be used as molecular markers that in turn can be used to identify the region of interest in corn lines resulting from new crosses and to quickly and efficiently introgress the gene from corn lines carrying said gene into other corn lines that do not carry said gene, in order to make them resistant to Colletotrichum and resistant to stalk rot.

Подробнее
Номер записи: 172
08-03-2012 дата публикации

Msp nanopores and related methods

Номер: US20120055792A1
Автор: Jens H. Gundlach, Mark A. Troll, Michael Niederweis, Mikhail PAVLENOK, Thomas Z. BUTLER
Принадлежит: UAB RESEARCH FOUNDATION, UNIVERSITY OF WASHINGTON

Provided herein are Mycobacterium smegmatis porin nanopores, systems that comprise these nanopores, and methods of using and making these nanopores. Such nanopores may be wild-type MspA porins, mutant MspA porins, wild-type MspA paralog porins, wild-type MspA homolog porins, mutant MspA paralog porins, mutant MspA homolog porins, or single-chain Msp porins. Also provided are bacterial strains capable of inducible Msp porin expression.

Подробнее
Номер записи: 173
08-03-2012 дата публикации

Method and system for nucleic acid detection using electroconductive or electrochemically active labels

Номер: US20120058472A1
Автор: I Ming Hsing, Ming Hung Thomas LEE, Xiaoteng LUO
Принадлежит: Hong Kong University of Science and Technology HKUST

A method for electrochemically or electrically detecting nucleic acids, utilizes electrochemically active or electrically conductive reporter materials. An electric voltage is applied and electric signals are measured to the electrodes that are suitable for detecting or quantifying the nucleic acid(s) in a sample. This technique is suitable for point-of-use applications, e.g. detecting bioanalytes in remote locations. A microchip, device, kit used adapted to be used for this method is also disclosed.

Подробнее
Номер записи: 174
08-03-2012 дата публикации

Quantitative Real Time PCR Assay Using FRET Dual-Labeled Primers

Номер: US20120058481A1
Автор: Wayne Ge, Yue Ling Ng
Принадлежит: Life Technologies Corp

This specification generally relates to non-radioactive methods of non-radioactive real-time PCR using FRET dual-labeled primers.

Подробнее
Номер записи: 175
08-03-2012 дата публикации

Compositions and methods for detecting klebsiella pneumoniae

Номер: US20120058487A1
Автор: Ann Huletsky, Christian Menard, François J. Picard, Marc Ouellette, Maurice Boissinot, Michel G. Bergeron, Paul H. Roy
Принадлежит: GeneOhm Sciences Canada Inc

Four highly conserved genes, encoding translation elongation factor Tu, translation elongation factor G, the catalytic subunit of proton-translocating ATPase and the RecA recombinase, are used to generate species-specific, genus-specific, family-specific, group-specific and universal nucleic acid probes and amplification primers to rapidly detect and identify algal, archaeal, bacterial, fungal and parasitical pathogens from clinical specimens for diagnosis. The detection of associated antimicrobial agents resistance and toxin genes are also under the scope of the present invention.

Подробнее
Номер записи: 176
08-03-2012 дата публикации

Universal Tags, Probes and Detection Methods For Multiple Targets Detection of Biomolecules

Номер: US20120058908A1
Автор: Demin Duan, Fang BAO, Jiong Li, Kexiao Zheng, LI Jiang, Rong Cao, Weibing Gu, Zhuoxuan Lv
Принадлежит: Suzhou Institute of Nano Tech and Nano Bionics of CAS

The present invention provides universal tags, probes and detection methods for multiple targets detection of biomolecules. The universal tag in the present invention is a fragment of DNA, RNA, peptide nucleic acid, or LNA, and is 3-20 mer in length. The probe in the present invention contains in order from 3′ terminus to 5′ terminus, a nucleotide sequence which is reverse complementary to a target molecule or a portion of the target molecule, and a nucleotide sequence which is reverse complementary to the universal tag; or said probe contains in order from 3′ terminus to 5′ terminus, a nucleotide sequence which is reverse complementary to the universal tag, and a nucleotide sequence which is reverse complementary to a target molecule or a portion of the target molecule.

Подробнее
Номер записи: 177
08-03-2012 дата публикации

METHOD OF DIAGNOSING POOR SURVIVAL PROGNOSIS COLON CANCER USING miR-203

Номер: US20120058914A1
Автор: Aaron J. Schetter, Carlo M. Croce, Curtis C. Harris
Принадлежит: Ohio State University Research Foundation, US Department of Health and Human Services

The present invention provides novel methods and compositions for the diagnosis and treatment of colon cancers. In particular, the present invention provides diagnostics and prognostics for colon (including colon adenocarcinoma) cancer patients, wherein the methods related to measuring miR levels can predict poor survival. The invention also provides methods of identifying inhibitors of tumorigenesis.

Подробнее
Номер записи: 178
15-03-2012 дата публикации

Progesterone receptor membrane component 1 (PGRMC1) as an indicator of fertility in animals

Номер: US20120060767A1
Автор: John J. Peluso
Принадлежит: University of Connecticut

Methods of evaluating fertility of an animal based on determination of a PGRMC1 characteristic that correlates with animal fertility. In one embodiment, a sample is obtained from an animal, a PGRMC1 characteristic is determined and compared to a baseline PGRMC1 characteristic, wherein a variation between the determined PGRMC1 characteristic and the baseline characteristic indicates a level of fertility of the animal. A PGRMC1 characteristic can be one or more of PGRMC1 expression, transcription, translation, amino acid sequence, nucleic acid sequence, post-translational modification, cell localization or tissue localization. A sample can be a cell sample, a tissue sample, a blood sample, a lymphocyte sample, an oocyte sample, or a sperm sample. The animal can be male or female. In one embodiment, a variation of PGRMC1 nucleic acid sequence indicates reduced fertility of the animal.

Подробнее
Номер записи: 179
15-03-2012 дата публикации

Generic Buffer For Amplification

Номер: US20120064511A1
Автор: Dirk Zimmermann, Hermann Leying
Принадлежит: Roche Molecular Systems Inc

The present invention relates to a method of amplifying a first and a second target nucleic acid in separate reaction receptacles, wherein said reaction receptacles comprise a solution comprising amplification reagents and oligonucleotides specific for said first or said second target nucleic acid, wherein said solution is the same for amplifying said first target nucleic acid and said second target nucleic acid.

Подробнее
Номер записи: 180
15-03-2012 дата публикации

Modified nucleotide and real-time polymerase reaction using the same

Номер: US20120064531A1
Автор: Dae-Ro AHN
Принадлежит: Korea Advanced Institute of Science and Technology KAIST

The present invention relates to a modified nucleotide and real-time polymerase reaction using the nucleotide. Specifically, the present invention relates to a fluorescence material linked-nucleotide, a composition for real-time polymerase reaction comprising the nucleotide, an analysis kit and an analysis method. In the present invention, the fluorescence material linked-nucleotide serves the dual roles of producing fluorescence signal as well as being used as a substrate. Therefore, the present invention is economically advantageous because it is unnecessary to prepare probes, but can be applied to analyze various real-time polymerase reactions such as PCR, RCA and isothermal polymerization reaction, and shows higher quality of performance than the past methods.

Подробнее
Номер записи: 181
15-03-2012 дата публикации

Methods of Diagnosing Hypophosphatemic Disorders

Номер: US20120064544A1
Автор: Ken White, Michael Econs, Thomas Meitinger, Tim Matthias Strom
Принадлежит: Indiana University Research And Technology Corp, Ludwig Maximilians Universitaet Muenchen LMU

The present invention relates to methods of diagnosing hypophosphatemic disorders.

Подробнее
Номер записи: 182
15-03-2012 дата публикации

Methods for the diagnosis of fetal disease

Номер: US20120065076A1
Автор: David G. Peters, Tianjiao Chu
Принадлежит: University of Pittsburgh

Methods are provided for detecting an aneuploidy in a fetus. These methods can be used to detect trisomy 13, 8 or 21, amongst other aneupoloidies. In some embodiments, the methods include selectively purifying fetal DNA from a maternal biological sample using the methylation status of a CpG containing genomic sequence and genotyping the fetus using the purified fetal DNA, thereby detecting aneuploidy in the fetus.

Подробнее
Номер записи: 183
15-03-2012 дата публикации

Methods and Apparatus for Detecting Molecular Interactions Using FET Arrays

Номер: US20120065093A1
Автор: Jonathan Rothberg, Wolfgang Hinz
Принадлежит: Life Technologies Corp

Methods and apparatuses relating to large scale FET arrays for analyte detection and measurement are provided. ChemFET (e.g., ISFET) arrays may be fabricated using conventional CMOS processing techniques based on improved FET pixel and array designs that increase measurement sensitivity and accuracy, and at the same time facilitate significantly small pixel sizes and dense arrays. Improved array control techniques provide for rapid data acquisition from large and dense arrays. Such arrays may be employed to detect a presence and/or concentration changes of various analyte types in a wide variety of chemical and/or biological processes.

Подробнее
Номер записи: 184
15-03-2012 дата публикации

Methods and kits for diagnosing osteoarthritis and predicting progression

Номер: US20120065094A1
Автор: Mukundan Attur, Steven B. Abramson
Принадлежит: New York University NYU

This disclosure relates to methods and kits for diagnosing osteoarthritis and for determining the progression of osteoarthritis in a subject.

Подробнее
Номер записи: 185
15-03-2012 дата публикации

Chimeric Oligonucleotides for Ligation-Enhanced Nucleic Acid Detection, Methods and Compositions Therefor

Номер: US20120065105A1
Автор: Brittan L. Pasloske, R. Scott KUERSTEN
Принадлежит: Life Technologies Corp

Ligation-enhanced nucleic acid detection assay embodiments for detection of RNA or DNA are described. The assay embodiments rely on ligation of chimeric oligonucleotide probes to generate a template for amplification and detection. The assay embodiments are substantially independent of the fidelity of a polymerase for copying compromised nucleic acid. Very little background amplification is observed and as few as 1000 copies of target nucleic acid can be detected. Method embodiments are particularly adept for detection of RNA from compromised samples such as formalin-fixed and paraffin-embedded samples. Heavily degraded and cross-linked nucleic acids of compromised samples, in which classic quantitative real time PCR assays typically fail to adequately amplify signal, can be reliably detected and quantified.

Подробнее
Номер записи: 186
15-03-2012 дата публикации

Predicting risk of major adverse cardiac events

Номер: US20120065897A1
Автор: Eugene R. Heyman, James V. Snider
Принадлежит: Critical Care Diagnostics Inc

Measurement of circulating ST2 and natriuretic peptide (e.g., NT-proBNP) concentrations is useful for the prognostic evaluation of subjects, in particular for the prediction of adverse clinical outcomes, e.g., mortality, transplantation, and heart failure.

Подробнее
Номер записи: 187
15-03-2012 дата публикации

Identification of a jak2 mutation involved in vaquez polyglobulia

Номер: US20120066776A1
Автор: Chloe James, Jean-Pierre Le Couedic, Nicole Casadevall, Valerie Ugo, William Vainchenker
Принадлежит: Assistance Publique Hopitaux de Paris APHP, IGR&D SA, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale INSERM

The present invention concerns the V617F variant of the protein-tyrosine kinase JAK2, said variant being responsible for Vaquez Polyglobulia. The invention also relates to a first intention diagnostic method for erythrocytosis and thrombocytosis allowing their association with myeloproliferative disorders, or to the detection of the JAK2 V617F variant in myeloproliferative disorders allowing their reclassification in a new nosological group.

Подробнее
Номер записи: 188
15-03-2012 дата публикации

Test agent for visceral obesity and use thereof

Номер: US20120066777A1
Автор: Atsunori Kashiwagi, Hiroshi Maegawa, Masatomo Rokushima, Minoru Ikeda, Minoru Suzuki, Shiro Maeda, Tatsuya Takahashi, Tohru Tani, Yoshihiro Kawamura
Принадлежит: RIKEN Institute of Physical and Chemical Research, Shiga University of Medical Science NUC, Shionogi and Co Ltd

Disclosed are: a method for detecting (diagnosing) visceral obesity in a subject; a test agent useful for the method; a method for searching for a substance that can be used as an active ingredient for ameliorating visceral obesity; and an ameliorating agent for visceral obesity or a medicinal agent for preventing a metabolic disease developed as a result of the progression of visceral obesity. As the test agent, a polynucleotide which comprises at least 15 nucleotides and can hybridize with a nucleotide sequence for coiled-coil domain containing protein 3 (CCDC3) gene or a nucleotide sequence complementary to the nucleotide sequence under stringent conditions or an antibody capable of recognizing CCDC3 protein is used.

Подробнее
Номер записи: 189
22-03-2012 дата публикации

Treatment of pancreatic cancer using a dr5 agonist in combination with gemcitabine

Номер: US20120070432A1
Автор: Jeffrey Scott Wiezorek, Jennifer Joy Kordich, Jonathan David Graves
Принадлежит: AMGEN INC

Methods and compositions for treatment of exocrine pancreatic cancer in a human patient comprising administering a therapeutically effective amount of a DR5 agonist and gemcitabine. Methods and compositions for treating a patient by identifying the alleleic variant of FcγRIIIA.

Подробнее
Номер записи: 190
22-03-2012 дата публикации

Method of Cloning Stable Stress Tolerant Superoxide Dismutase Using Universal Primers

Номер: US20120070835A1
Автор: Amit Kishore, Arti Rani, Arun Kumar, Harsharan Singh, Hitesh Kumar, Kashmir Singh, Paramvir Singh Ahuja, Pardeep Kumar Bhardwaj, Payal Sood, Ravi Shankar Singh, Sanjay Ghawana, Sanjay Kumar, Som Dutt
Принадлежит: Council of Scientific and Industrial Research CSIR

The present invention relates to a method of cloning stable stress tolerant superoxide dismutase from diverse plant species using universal primers.

Подробнее
Номер записи: 191
22-03-2012 дата публикации

Soybean event mon89788 and methods for detection thereof

Номер: US20120070839A1
Автор: Ellen Dickinson, Jennifer Rinehart, Marianne Malven, Nancy Taylor
Принадлежит: Individual

The present invention provides for soybean plant and seed comprising transformation event MON89788 and DNA molecules unique to these events. The invention also provides methods for detecting the presence of these DNA molecules in a sample.

Подробнее
Номер записи: 192
22-03-2012 дата публикации

Label-free method for detecting presence or absence of nucleic acids

Номер: US20120070909A1
Автор: Roejarek Kanjanawarut, Xiaodi Su
Принадлежит: Agency for Science Technology and Research Singapore

The present invention is directed to a method of detecting presence or absence of a target nucleic acid using negatively charged metallic nanoparticles dissolved in a solution. A nucleic acid probe with a substantially neutral net charge is used for detecting the target nucleic acid. The present invention is also directed to a kit including at least one nucleic acid probe with a substantially neutral net charge and at least one type of negatively charged metallic nanoparticles for carrying out the method.

Подробнее
Номер записи: 193
22-03-2012 дата публикации

Method for Quantification of Small RNA Species

Номер: US20120071332A1
Автор: Peter Kamp Busk
Принадлежит: Exiqon AS

The present invention relates to a method for amplification and quantification of microRNA molecules using quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR) technology. The method comprise the steps of (a) producing cDNA molecules complementary to microRNAs in a sample using polyadenylation and primer extension by reverse transcription, and (b) amplification and quantification of the cDNAs by qPCR using microRNA specific primer sets of forward and reverse primers containing LNA monomers.

Подробнее
Номер записи: 194
22-03-2012 дата публикации

Biomarkers for differentiating melanoma from benign nevus in the skin

Номер: US20120071343A1
Автор: Xiao-Jun Ma, Xingyong Wu, Yuling Luo
Принадлежит: Advanced Cell Diagnostics Inc

Disclosed is a method for diagnosing melanoma in a human subject, as well as a method for providing a prognosis to a human subject who is at risk of developing melanoma recurrence, and a method for determining the stage of melanoma in a human subject, comprising the step of determining the level of expression of phosphatase and actin regulator 1 (PHACTR1) gene, or fragments thereof, either alone or in combination with the level of expression of secreted integrin-binding phosphoprotein (SPP1), preferentially expressed antigen in melanoma (PRAME), growth differentiation factor 15 (GDF 15), and chemokine C-X-C motif ligand 10 (CXCL10) genes. Further, the invention relates to a diagnostic kit, comprising at least one substance for detection of the expression of PHACTR1, or fragments thereof, either alone or in combination with the detection of SPP1, PRAME, GDF15, and CXCL10, for the diagnosis or prognosis of melanoma.

Подробнее
Номер записи: 195
22-03-2012 дата публикации

Compositions and methods for identifying enzyme and transport protein inhibitors

Номер: US20120071344A1
Автор: Roland Wolkowicz
Принадлежит: SAN DIEGO STATE UNIVERSITY RESEARCH FOUNDATION

The invention is directed to compositions, e.g., cell-based and multiplexed platforms, to screen for small molecule drugs that inhibit enzymes such as proteases, e.g., viral proteases, e.g., HIV proteases; and methods for making and using these compositions. The invention provides compositions and methods for identifying compositions, e.g., drug molecules, that can inhibit proteases, e.g., viral proteases such as HIV proteases. In alternative embodiments, the invention provides cell-based platforms or assays to screen for compositions, e.g., small molecules or drugs, that inhibit or modify the activity of enzymes such as calcium-dependent protein convertases involved in HIV envelope protein processing, including cleavage of the HIV gp160 envelope precursor, resulting in gp120 and gp41 envelope products. In one embodiment, the invention provides a cell-based or multiplexed platform for monitoring the activity of enzymes, e.g., proteases such as viral proteases.

Подробнее
Номер записи: 196
22-03-2012 дата публикации

Methods and systems for uniform enrichment of genomic regions

Номер: US20120071357A1
Автор: Christina Middle, Jacob Kitzman, Jeffrey Jeddeloh, Mark D'Ascanzo, Thomas Albert, Todd Richmond
Принадлежит: Individual

The present invention provides methods and compositions for the enrichment of target nucleic acids in a microarray system. In particular, the present invention provides methods and compositions for uniform enrichment of target nucleic acid molecules in a microarray format. The present invention also provides for intentionally non-uniform enrichment among target nucleic acid molecules.

Подробнее
Номер записи: 197
22-03-2012 дата публикации

Alkaline shock-based method of processing a biological sample

Номер: US20120071360A1
Автор: Jeffrey M. Linnen, Kui Gao, Michael M. Becker, Wen Wu
Принадлежит: Gen Probe Inc

Method of processing a biological sample to yield nucleic acid appropriate for use in a subsequent in vitro nucleic acid amplification reaction. The method involves a rapid, transient exposure to alkaline conditions which can be achieved by mixing an alkaline solution with a pH-buffered solution that includes a detergent and the biological sample to be tested for the presence of particular nucleic acid species using in vitro amplification. The invented method advantageously can improve detection of some target nucleic acids without substantially compromising detectability of others. The method is particularly useful for simultaneously preparing RNA and DNA templates that can be used in multiplex amplification reactions.

Подробнее
Номер записи: 198
29-03-2012 дата публикации

Methods of predicting complication and surgery in crohn's disease

Номер: US20120073585A1
Автор: Jerome I. Rotter, Kent D. Taylor, Marla Dubinsky, Stephan R. Targan
Принадлежит: Cedars Sinai Medical Center

The present invention relates to prognosing, diagnosing and treating an aggressive form of Crohn's disease characterized by rapid progression to complication and/or surgery from the time of diagnosis. In one embodiment, the prognosis, diagnosis and treatment is based upon the presence of one or more genetic risk factors.

Подробнее
Номер записи: 199
29-03-2012 дата публикации

Method for Detecting and Quantitating Multiple-Subcellular Components

Номер: US20120075453A1
Автор: Michael Kilpatrick, Triantafyllos Tafas
Принадлежит: Ikonisys Inc

A method for detecting and quantitating multiple and unique fluorescent signals from a cell sample is provided. The method combines immunohistochemistry and a fluorescent-labeled in situ hybridization techniques. The method is useful for identifying specific subcellular components of cells such as chromosomes and proteins.

Подробнее
Номер записи: 200