АНАЛИЗЫ И СПОСОБЫ С ПРИМЕНЕНИЕМ БИОМАРКЕРОВ

Изобретение относится к биотехнологии. Представлен способ предсказания чувствительности образца ткани или клеток злокачественной опухоли млекопитающего к Apo2L/TRAIL, включающий стадии: получения образца ткани или клеток злокачественной опухоли млекопитающего; исследования образца ткани или клеток злокачественной опухоли для детекции экспрессии одного или нескольких биомаркеров, выбранных из группы из фукозилтрансферазы 3, фукозилтрансферазы 6, антигена (антигенов) сиалил-Льюис А и/или X, где экспрессия одного или нескольких указанных биомаркеров является показателем того, что указанный образец ткани или клеток является чувствительным к апоптоз-индуцирующей активности Apo2L/TRAIL. Также описан способ индукции апоптоза в образце ткани или клеток злокачественной опухоли млекопитающего. Предложен способ лечения злокачественной опухоли у млекопитающего. Изобретения позволяют использовать детекцию экспрессии одного или нескольких биомаркеров в качестве показателя того, что образец будет чувствительным ...

СПОСОБЫ ЛЕЧЕНИЯ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ ОПУХОЛЕЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ИНГИБИТОРА ATR

Группа изобретений относится к способам выявления рака, имеющего чувствительность к соединению-ингибитору ATR в комбинации с агентом, повреждающим ДНК, и к лечению субъектов с таким выявленным раком с помощью ингибитора ATR в комбинации с агентом, повреждающим ДНК. Измеряют уровень активности CDKN1A в злокачественной опухоли пациента. Сравнивают измеренную активность CDKN1A с активностью CDKN1A в контрольной ткани или клетке. Отбирают пациента со злокачественной опухолью, идентифицированной как имеющая сниженную активность CDKN1A, для лечения с использованием ингибитора ATR IIA-7 или I-G-32 в комбинации с повреждающим ДНК средством, которое представляет собой цисплатин или гемцитабин. Изобретения позволяют осуществлять стратификацию пациентов со злокачественной опухолью для терапии с использованием ингибитора ATR в комбинации с повреждающим ДНК средством с синергическим ответом. 4 н. и 32 з.п. ф-лы, 14 ил., 5 табл., 1 пр.

АНАЛИЗЫ И СПОСОБЫ, ИСПОЛЬЗУЮЩИЕ БИОМАРКЕРЫ

Изобретение относится к биотехнологии. Представлены способы, исследующие экспрессию одного или нескольких биомаркеров в образце ткани и клеток млекопитающего. В соответствии с описанными способами определение экспрессии одного или нескольких таких биомаркеров является показателем или означает, что образец ткани или клеток будет чувствительным к апоптоз-индуцирующим веществам, таким как антителам-агонистам Apo2L/TRAIL и анти-DR5. Некоторые биомаркеры, которые можно исследовать, включают фукозилтрансферазы, в частности фукозилтрансферазу 3 (FUT3) и/или фукозилтрансферазу 6 (FUC6), а также и сиалил-Льюис А и/или Х антигены. Изобретение расширяет арсенал способа прогнозирования и лечения рака. 6 н. и 31 з.п. ф-лы, 13 ил., 1 табл.

ОЦЕНКА АКТИВНОСТИ КЛЕТОЧНЫХ СИГНАЛЬНЫХ ПУТЕЙ С ПРИМЕНЕНИЕМ ВЕРОЯТНОСТНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ ЦЕЛЕВЫХ ГЕНОВ

Настоящая группа изобретений относится к биоинформатике. Предложен способ определения активности клеточного сигнального пути на основе уровней экспрессии по меньшей мере трех целевых генов, а также устройство для осуществления такого способа. Данная группа изобретений может найти применение в диагностике различных заболеваний. 2 н. и 8 з.п. ф-лы, 42 ил., 12 табл., 16 пр.

ЛЕЧЕНИЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ, СВЯЗАННЫХ С ПИРРОЛИН-5 КАРБОКСИЛАТРЕДУКТАЗОЙ 1(PYCR1), ПУТЕМ ИНГИБИРОВАНИЯ ПРИРОДНОГО АНТИСМЫСЛОВОГО ТРАНСКРИПТА К PYCR1

Изобретение относится к биохимии. Описан способ повышения экспрессии полинуклеотида пирролин-5-карбоксилатредуктазы 1(PYCR1) в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro, включающий: приведение указанных клеток или тканей в контакт с олигонуклеотидом, в частности с олигонуклеотидом малой интерферирующей РНК (миРНК), составляющим в длину от 20 до 30 нуклеотидов, который специфически гибридизуется с и нацелен на участок природного антисмыслового PYCR1. Представлен синтетический олигонуклеотид, составляющий 20-30 нуклеотидов в длину, содержащий необязательные модификации, причем указанные модификации выбраны из: по меньшей мере одного модифицированного фрагмента сахара; по меньшей мере одной модифицированной межнуклеотидной связи; по меньшей мере одного модифицированного нуклеотида; и их комбинаций; причем указанный олигонуклеотид специфичен для и специфически гибридизуется с природным антисмысловым полинуклеотидом PYCR1 и повышает экспрессию полинуклеотида PYCR1, имеющего последовательность ...

МикроРНК - БИОМАРКЕРЫ, УКАЗЫВАЮЩИЕ НА БОЛЕЗНЬ АЛЬЦГЕЙМЕРА

Изобретения касаются способа диагностики болезни Альцгеймера или умеренного когнитивного нарушения (MCI) у субъекта и набора для осуществления указанной диагностики. Представленный способ включает определение уровня по меньшей мере одной микроРНК, выбранной из группы, состоящей из miR-15b, miR-191, miR-142-3р, Let-7g, Let-7d и их комбинаций, в образце крови, плазмы или сыворотки, взятом у субъекта. Отклонение уровня указанной по меньшей мере одной микроРНК от уровня у здорового субъекта, определенное по отношению к соответствующему контролю, указывает на то, что субъект страдает болезнью Альцгеймера или MCI. Набор для диагностики включает два или более агентов, селективно детектирующих присутствие по меньшей мере двух микроРНК, выбранных из группы, состоящей из miR-191, miR-15b, miR-142-3р, Let-7g, Let-7d, miR-301a и miR-545 в образце. Изобретения могут быть использованы для точной диагностики болезни Альцгеймера и MCI у субъекта. 2 н. и 33 з.п. ф-лы, 3 ил., 11 табл., 3 пр.

УСИЛЕНИЕ ПРОГНОСТИЧЕСКОЙ ЦЕННОСТИ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА IL28B В КОМБИНАЦИИ С КОЛИЧЕСТВЕННОЙ ОЦЕНКОЙ IP-10 В СЫВОРОТКЕ ПРИ ОТВЕТЕ НА ПЕГИНТОРФЕРОН И РИБАВИРИН ПО СРАВНЕНИЮ С КАЖДЫМ ИЗ ЭТИХ БИОМАРКЕРОВ В ОТДЕЛЬНОСТИ

Изобретение относится к биотехнологии, а именно к способу комбинирования определения генотипа IL28B вместе с измерением сывороточного уровня IFN-γ-индуцируемого белка 10 (IP-10) для прогнозирования получения устойчивого вирусологического ответа (SVR) или отсутствия ответа на пегинтерферон и рибавирин для индивидуальных пациентов, инфицированных HCV, а также к диагностическому набору для применения в данном способе. Способ включает определение генотипа IL28B с помощью полиморфного маркера rs12979860 и сывороточного уровня IP-10 в группах с генотипом IL28B, который обеспечивает дополнительную и независимую информацию в отношении вероятности SVR. Носители СС с IP-10<600 пг/мл имеют вероятность SVR 100% и вероятность 75%, когда IP-10>600 пг/мл. Носители СТ с IP-10<600 пг/мл имеют вероятность SVR 79% и вероятность 34%, когда IP-10>600 пг/мл. Носители ТТ с IP-10<600 пг/мл имеют вероятность SVR 50% и вероятность 10%, когда IP-10>600 пг/мл. Предложенное изобретение позволяет получить информацию ...

ОПРЕДЕЛЕНИЕ СТАТУСА БЕРЕМЕННОСТИ

Изобретение относится к способам, позволяющим установить беременность у животных, в частности у некопытных, копытных и жвачных животных. Изобретение раскрывает способ и набор тестов для выявления того, является ли животное небеременным или беременным после осеменения. Уровень экспрессии индуцируемого при беременности белка определяют у животного, для которого статус беременности является желательным, и уровень экспрессии белка у такого животного сравнивают с уровнем экспрессии указанного белка у животных, которые не являются беременными. Изобретение обеспечивает создание надежного, воспроизводимого и недеструктивного способа определения наличия беременности или отсутствия беременности у домашнего крупного рогатого скота и достигается, если проводят определение уровня экспрессии индуцируемого при беременности 2,5-олигоаденилатсинтетазы, β2-микроглобулина, регуляторного фактора 1 интерферона, белка, перекрестно реагирующего с убихиноном (ISG-17), и Мх-белка. 3 н. и 33 з.п. ф-лы, 4 ил.

БИОМАРКЕР

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к маркерам рака, и может быть использовано в медицине. Выявление белка Engrailed-2 (EN2) или кодирующей его нуклеиновой кислоты в образце тканей мочевого пузыря или мочи от пациента может быть использовано в диагностике рака мочевого пузыря или для идентификации пациента, имеющего риск развития рака мочевого пузыря, а также для мониторинга прогрессирования рака мочевого пузыря у пациента или мониторинга эффективности лечения рака мочевого пузыря. Изобретение позволяет использовать EN2 в диагностике рака мочевого пузыря. 4 н. и 6 з.п. ф-лы, 5 ил., 3 пр.

БИОМАРКЕРЫ, АССОЦИИРОВАННЫЕ С ПРЕДИАБЕТОМ, ДИАБЕТОМ И СВЯЗАННЫМИ С ДИАБЕТОМ СОСТОЯНИЯМИ

Изобретение относится к области медицины и касается способа, тест-системы диагностики диабетической нефропатии. Сущность способа заключается в том, что в образце от субъекта определяют биомаркер, который представляет собой подобный антигену CD5. Использование способа позволяет диагностировать диабетическую нефропатию. 5 н. и 28 з.п. ф-лы, 13 табл., 5 ил., 1 пр.

СЛИТЫЙ БЕЛОК ИЗ БЕЛКА DCTN1 С БЕЛКОМ RET

Настоящее изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к идентификации аномалий в организме, ассоциированных с развитием злокачественных опухолей, и может быть использовано в медицине для диагностики и терапии злокачественных опухолей щитовидной железы. Идентифицирован слитый ген DCTN1-RET, состоящий из генов DCTN1 и RET, ассоциированный со злокачественной опухолью щитовидной железы. Предложены средства и способы для его детекции в организме, а также для скрининга соединений, направленных на ингибирование его экспрессии или активности кодируемого им слитого полипептида и терапию таких опухолей. Изобретение позволяет провести идентификацию и терапию злокачественной опухоли щитовидной железы, экспрессирующей слитый ген DCTN1-RET. 35 н. и 2 з.п. ф-лы, 9 ил., 7 табл., 9 пр.

РЕПРЕЗЕНТАТИВНАЯ ДИАГНОСТИКА

Изобретение относится к диагностике, а именно к способу приготовления образца опухолевой ткани. Способ приготовления образца опухолевой ткани для определения фенотипического профиля образца опухолевой ткани, который включает: гомогенизацию образца опухолевой ткани; реконструирование гомогенизированного образца с получением гомогената, причем указанный гомогенат содержит по существу гомогенные клеточные структуры, где соотношение клеточных структур в подгруппе гомогената по существу аналогично или равно соотношению клеточных структур в образце ткани; анализ клеточных структур гомогената; определение фенотипического профиля опухолевой ткани. Вышеописанный способ позволяет повысить обнаружение мутаций из раковых тканей по сравнению с гистологическими срезами, взятыми из FFPE блоков той же самой ткани. 55 ил., 24 табл., 12 пр.

ФАРМАКОДИНАМИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ, ИНДУЦИРОВАННЫЕ ИНТЕРФЕРОНОМ АЛЬФА

Изобретение относится к иммунологии. Предложены варианты применения вариантов набора генов (фармакодинамических (ФД) маркеров) с повышенной регуляцией экспрессии или действия, индуцируемых интерфероном альфа (ИФНα). Описаны варианты способа идентификации пациентов для получения MEDI-545 по обнаружению таких профилей экспрессии ИФНα-индуцируемых ФД маркеров. Использование изобретения обеспечивает распознавание тех пациентов, для которых лечение нейтрализующим антителом MEDI-545 может быть действительно эффективным, что может найти применение в медицине. 7 н. и 3 з.п. ф.-лы, 90 ил., 33 табл., 22 пр.

КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ ГИПЕРТИРЕОЗА У ЖИВОТНЫХ-КОМПАНЬОНОВ

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к маркерам гипертиреоза, и может быть использовано в медицине для диагностики гипертиреоза у кошки. Способ диагностики гипертиреоза у кошки включает: (a) определение уровня нуклеиновой кислоты, кодирующей пептид натрий-йодного симпортера кошки с SEQ ID NO: 2, в биологическом образце кошки; и (b) сравнение уровня нуклеиновой кислоты с референсным уровнем указанной нуклеиновой кислоты, определенным у контрольных кошек без гипертиреоза, где биологический образец содержит ткань, клетку или биологическую жидкость, содержащую ДНК или РНК. При этом повышенный уровень указанной нуклеиновой кислоты в образце от кошки по сравнению с референсным уровнем является диагностическим для гипертиреоза у кошки. Настоящее изобретение позволяет повысить эффективность диагностики гипертиреоза кошки. 6 н. и 2 з.п. ф-лы, 2 табл., 12 пр.

ПРАЙМЕРЫ И ЗОНДЫ ДЛЯ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложен зонд, состоящий из выделенной нуклеиновой кислоты, для обнаружения, обладающей лекарственной устойчивостью, содержащий последовательность зонда, которая по меньшей мере на 85% идентична последовательности, выбранной из перечисленных в Таблице 2, а также соответствующие набор и способ обнаружения, обладающей лекарственной устойчивостью. Изобретение может быть использовано в медицине. 3 н. и 18 з.п. ф-лы, 3 ил., 5 табл., 7 пр.

СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ЗАБОЛЕВАНИЯ, СОПРОВОЖДАЮЩЕГОСЯ ПОВЫШЕННОЙ ГИБЕЛЬЮ КЛЕТОК, И НАБОР ДЛЯ ЕГО ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ

Настоящее изобретение относится к биохимии, в частности к способу диагностики заболеваний, сопровождающихся повышенной гибелью клеток, и набору для его осуществления. Для осуществления указанного способа получают образец плазмы крови у человека, затем проводят изотермическую амплификацию нуклеиновых кислот плазмы крови. Далее осуществляют очистку нуклеиновых кислот из реакционной смеси и проводят количественный анализ нуклеиновых кислот методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Определяют коэффициент К в пробах. Далее сравнивают коэффициент К с референсным значением и диагностируют заболевание, сопровождающееся повышенной гибелью клеток, при значении коэффициента К менее референсного значения. Настоящее изобретение позволяет проводить малоинвазивную диагностику заболеваний, сопровождающихся повышенной гибелью клеток, с высокой чувствительностью, на любых стадиях заболевания, в том числе на ранних стадиях, при которых клинические симптомы отсутствуют. 2 н. и 50 з.п.

ОТБОР БОЛЬНЫХ РАКОМ ДЛЯ ВВЕДЕНИЯ ИНГИБИТОРОВ СИГНАЛЬНОГО ПУТИ Wnt НА ОСНОВАНИИ СТАТУСА МУТАЦИИ RNF43

Изобретение относится к области биохимии. Описана группа изобретений, включающая способ прогнозирования чувствительности роста опухолевых клеток к подавлению ингибитором Wnt, набор для анализа, предназначенный для отбора больного раком, у которого согласно прогнозу может быть достигнут или не достигнут благоприятный результат от терапевтического введения ингибитора Wnt. Способ прогнозирования включает в себя стадии: определения в полученном у субъекта образце опухолевых клеток уровня биомаркера; сравнения уровня биомаркера в образце опухолевых клеток с контрольным уровнем биомаркера; отбора субъекта, у которого согласно прогнозу должен быть достигнут благоприятный результат от терапевтического введения ингибитора Wnt. Изобретение расширяет арсенал способов прогнозирования роста опухолевых клеток. 2 н. и 23 з.п. ф-лы, 8 ил., 10 табл., 4 пр.

ЛЕЧЕНИЕ СВЯЗАННЫХ С ГЕНОМ-СУПРЕССОРОМ ОПУХОЛЕЙ ЗАБОЛЕВАНИЙ ПОСРЕДСТВОМ ИНГИБИРОВАНИЯ ПРИРОДНОГО ТРАНСКРИПТА В АНТИСМЫСЛОВОЙ ОРИЕНТАЦИИ ОТНОСИТЕЛЬНО ЭТОГО ГЕНА

Изобретение относится к области биотехнологии. Описана группа изобретений, включающая способ повышения экспрессии полинуклеотида гена-супрессора опухолей в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro, где полинуклеотид гена-супрессора опухолей кодирует Р53 или Р73, синтетический модифицированный олигонуклеотид для повышения экспрессии полинуклеотида гена-супрессора опухолей in vivo, композицию для повышения экспрессии полинуклеотида гена-супрессора опухолей в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro и способ профилактики или лечения заболевания, связанного с по меньшей мере одним полинуклеотидом гена-супрессора опухолей и/или по меньшей мере одним кодируемым им продуктом, где указанный полинуклеотид гена-супрессора опухолей кодирует Р53 или Р73. Изобретение расширяет арсенал средств для повышения экспрессии полинуклеотида гена-супрессора опухолей в клетках, кодирующего Р53 или Р73. 4 н. и 10 з.п. ф-лы, 13 ил., 1 табл., 2 пр.

Способ применения информации о сложной группе биомаркеров для диагностики злокачественной опухоли легкого у субъекта, диагностический набор и вычислительная система с её использованием

Группа изобретений относится к медицине, а именно к онкологии, и может быть использована для диагностирования злокачественной опухоли легкого у субъекта. Способ предусматривает следующие стадии: 1) применяют вычислительную систему для получения модели диагностирования злокачественной опухоли легкого. Модель устанавливают с использованием: данных уровня экспрессии отдельных биомаркеров в сложной группе биомаркеров, измеренных из биологических образцов выборки, состоящей из пациентов со злокачественной опухолью легкого и людей без злокачественной опухоли легкого, или их обработанных данных B, где k представляет собой индекс для отдельных биомаркеров и i представляет собой индекс для отдельных биологических образцов выборки; 2) применяют вычислительную систему для получения данных уровня экспрессии отдельных биомаркеров, измеренных в биологическом образце субъекта, или их обработанных данных B, или данных уровня экспрессии отдельных биомаркеров, или их обработанных данных Bи возраст субъекта ...

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНЫХ МАРКЕРОВ IL-3, IL-33 и IL12ρ40 ДЛЯ ХАРАКТЕРИСТИКИ СТЕПЕНИ ТЯЖЕСТИ РЕСПИРАТОРНЫХ ИНФЕКЦИЙ, ВЫЗВАННЫХ РЕСПИРАТОРНО-СИНЦИТИАЛЬНЫМ ВИРУСОМ ЧЕЛОВЕКА И МЕТАПНЕВМОВИРУСОМ ЧЕЛОВЕКА

Изобретение относится к биотехнологии и определению респираторных заболеваний с помощью молекулярных маркеров в качестве средства прогнозирования развития случаев респираторных инфекций. Профиль экспрессии гена молекулярных маркеров может определяться в биологических образцах посредством анализа ELISA, проточной цитометрии или PCR в реальном времени. На основании подтверждения этиологического фактора инфекции вместе с определением профиля молекулярных маркеров IL-3, IL-33 и IL12p40 будет прогнозироваться тяжесть заболевания. 2 н. и 1 з.п. ф-лы, 5 ил., 1 табл., 1 пр.

СПОСОБ СКРИНИНГА НЕВРОПАТОЛОГИИ

Изобретение предназначено для диагностики невропатологических состояний, например церебральной ишемии, эпилепсии. Способ скрининга для невропатологии включает в себя несколько стадий. Получают образец жидкости от первого индивидуума. Соединяют его с антителом, специфически иммунореактивным с IСАМ-4. Проводят количественный анализ связывания IСАМ-4/антитело в образце. Сравнивают связывание IСАМ/антитело в указанном образце с таким же связыванием в образце от второго индивидуума, не имеющего неврологических заболеваний. Очищенная и выделенная ДНК содержит промотор для IСАМ-4 млекопитающих. Химерный полинуклеотид содержит промотор для гена человеческого IСАМ-4. Вектор экспрессии содержит указанную ДНК. Клетка-хозяин трансформирована указанным вектором экспрессии. Полипептид, обозначенный как "IСАМ-4", относится к факторам клеточной адгезии. Он обладает структурным родством с факторами межклеточной адгезии IСАМ-1, IСАМ-2 и IСАМ-R. Изобретение позволит определить уровни растворимого IСАМ-4 в ...

СПОСОБ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКИ РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА МИКРОРНК ПЛАЗМЫ КРОВИ

Изобретение относится к области медицины, в частности к онкологии и молекулярной биологии, и предназначено для дифференциальной диагностики рака предстательной железы (РПЖ). В плазме крови пациента методом микрочипового анализа измеряют экспрессию микроРНК hsa-miR-619-5p и hsa-miR-1184. При величинах экспрессии микроРНК hsa-miR-619-5p в log2-шкале более 1,25 и микроРНК hsa-miR-1184 более 3,5 диагностируют РПЖ. Если величина экспрессии микроРНК hsa-miR-619-5p в log2-шкале менее 1,25 и микроРНК hsa-miR-1184 менее 3,5, диагностируют доброкачественную гиперплазию предстательной железы (ДГПЖ). Изобретение обеспечивает получение новых диагностических маркеров РПЖ и ДГПЖ, позволяющих при сопоставимой достоверности и специфичности осуществлять дифференциальную диагностику РПЖ и ДГПЖ. 3 табл., 6 пр.

СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РИСКА РАЗВИТИЯ ОСЛОЖНЕННОЙ ЯЗВЕННОЙ БОЛЕЗНИ ДВЕНАДЦАТИПЕРСТНОЙ КИШКИ НА ОСНОВЕ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЯ ЭКСПРЕССИИ МИКРОРНК-155

Изобретение относится к медицине, а именно к медицинской диагностике, и может быть использовано для прогнозирования риска развития осложненной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки. Производят биопсию двенадцатиперстной кишки с забором по одному биоптату на латеральной и медиальной стенках луковицы. Определяют уровень экспрессии микроРНК-155, вычисляют среднее арифметическое по результатам трех повторов. При значении 2.442±0.096 прогнозируют высокий риск развития осложненной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки. Способ обеспечивает повышение точности прогнозирования высокого риска развития осложненной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки за счет определения уровня экспрессии микроРНК-155 в биоптатах двенадцатиперстной кишки. 3 ил., 5 пр.

ВИРИОНЫ АДЕНОАССОЦИИРОВАННОГО ВИРУСА С ВАРИАНТНЫМ КАПСИДОМ И СПОСОБЫ ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ

Изобретение относится к биотехнологии. Описан вирион рекомбинантного аденоассоциированного вируса rAAV, содержащий: a) капсидный белок вариантного AAV, который содержит пептидную вставку, по сравнению с соответствующим капсидным белком родительского AAV, где пептидная вставка имеет длину от 7 аминокислот до 10 аминокислот, где участок вставки расположен между двумя соседствующими аминокислотами в положении между аминокислотами, соответствующем аминокислотам 570 и 611 VP1 из AAV2 или соответствующем положении в капсидном белке другого серотипа AAV; и b) гетерологичную нуклеиновую кислоту, содержащую нуклеотидную последовательность, кодирующую генный продукт. Представлена фармацевтическая композиция, содержащая данный вирион. Представлен способ лечения заболевания сетчатки, который включает введение индивидууму, нуждающемуся в этом, эффективного количества описанного вириона. При осуществлении изобретения достигается большая инфекционность ретинальной клетки, поскольку вирионы AAV вводятся ...

СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ БИОЛОГИЧЕСКОГО РИТМА

Изобретение относится к области хронобиологии. Способ определения циркадного цикла у субъекта на основе временных рядов данных по уровням экспрессии, полученных при измерении уровней экспрессии двух часовых генов в биологических образцах, которые берут у субъекта три раза в сутки. Причем часовые гены имеют разные фазы циркадного цикла изменений уровня экспрессии. Способ позволяет определить биологический ритм с большой точностью и сводит к минимуму количество раз взятия биологических образцов у субъекта. 3 з.п. ф-лы, 4 ил., 6 табл., 3 пр.

АНТИТЕЛО ПРОТИВ ОПУХОЛЕСПЕЦИФИЧНЫХ АНТИГЕНОВ В КАЧЕСТВЕ МИШЕНИ

... 1. Антитело, которое специфически связывается с человеческим белком окулоспанина и обладает цитотоксической активностью в отношении клетки, экспрессирующей указанный белок. 2. Антитело, которое специфически связывается с белком, имеющим аминокислотную последовательность, представленную SEQ ID NO:2 из списка последовательностей, и/или аминокислотную последовательность, представленную SEQ ID NO:4 из списка последовательностей, и которое обладает цитотоксической активностью в отношении клетки, экспрессирующей указанный белок/белки. 3. Антитело по п.1 или 2, отличающееся тем, что цитотоксическая активность является антитело-зависимой клеточно-опосредованной цитотоксичностью. 4. Антитело по п.1 или 2, отличающееся тем, что цитотоксическая активность является комплемент-зависимой цитотоксичностью. 5. Антитело по п.1 или 2, отличающееся тем, что цитотоксическая активность является комплемент-зависимой клеточно-опосредованной цитотоксичностью. 6. Антитело по п.1 или 2, отличающееся тем, что цитотоксичность ...

ГЕНЫ, СВЯЗАННЫЕ С ОСТЕОАРТРИТОМ СОБАК, И ОТНОСЯЩИЕСЯ К ЭТОМУ СПОСОБЫ И КОМПОЗИЦИИ

... 1. Комбинация, включающая множество молекул полинуклеотидов, причем молекулы полинуклеотидов дифференциально экспрессируются у субъектов, страдающих остеоартритом или в предостеоартритном состоянии, по сравнению с экспрессией у субъектов, не страдающих остеоартритом или не в предостеоартритном состоянии. 2. Комбинация по п.1, в которой множество молекул полинуклеотидов включает две или больше молекул, выбранных из SEQ ID NO:1-1558 или их фрагментов. 3. Способ выявления дифференциальной экспрессии нуклеиновых кислот в образце, включающий стадии: a) гибридизации комбинации, включающей множество молекул полинуклеотидов, причем молекулы полинуклеотидов дифференциально экспрессируются у субъектов, страдающих остеоартритом или в предостеоартритном состоянии, по сравнению с экспрессией у субъектов, не страдающих остеоартритом или не в предостеоартритном состоянии, с нуклеиновыми кислотами образца, при этом образуется один или несколько гибридизационных комплексов; b) детектирования гибридизационных ...

СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ВЕРОЯТНОСТИ РЕЦИДИВИРОВАНИЯ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

... 1. Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы у субъекта-млекопитающего, включающий:(a) измерение относительного уровня экспрессии РНК-транскриптов KI67, CCND1, PTEN, NDRG1, TERT в биологическом образце, содержащем опухолевые клетки, полученном от указанного субъекта;(b) определение показателя рецидивирования для указанного субъекта с учетом измеренных уровней экспрессии генов;(c) использование указанного показателя рецидивирования для определения вероятности рецидивирования рака молочной железы; и(d) составление отчета, в котором приведен результат указанного определения.2. Способ по п. 1, где в качестве референсного значения определялся уровень экспрессии генов GUSB, В2М, HPRT.3. Способ по п. 1, где указанный субъект представляет собой человека.4. Способ по п. 1, где индивидуальный вклад каждого гена оценивают отдельно.5. Способ по п. 1, включающий определение показателя рецидивирования как точки на графике с двумя координатами X и Y.6. Способ по п. 1, где для ...

СИНТЕТИЧЕСКАЯ ЛЕТАЛЬНОСТЬ И ЛЕЧЕНИЕ РАКА

... 1. Способ лечения субъекта, больного раком с недостатком NMT2, включающий введение упомянутому субъекту ингибитора NMT.2. Способ по п. 1, где упомянутый ингибитор NMT включает ингибитор NMT1.3. Способ по п. 2, где упомянутый ингибитор NMT1 включает небольшую молекулу, антитело, пептидный фрагмент, нуклеиновую кислоту или их комбинации.4. Способ по п. 3, где упомянутая небольшая молекула включает Tris-DBA, НМА или DDD85646, DDD86481 или их производные.5. Способ по п. 3, где упомянутое антитело является моноклональным антителом или поликлональным антителом.6. Способ по п. 3, где упомянутая нуклеиновая иклсота включает молекулу дцРНК (двухцепочечная РНК), молекулу иРНК, молекулу микроРНК, рибозим, молекулу кшРНК (короткая шпилечная РНК) или молекулу миРНК.7. Способ по любому из пп. 1-6, где упомянутый рак представляет собой лимфому, В-клеточную лимфому, фолликулярную лимфому, диффузную В-крупноклеточную лимфому, мантийноклеточную лимфому, В-ХЛЛ/ЛЛ, иммуноцитому/болезнь Вальденстрема, лимфому ...

SLIT-ROBO СИГНАЛИНГ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ ЗАБОЛЕВАНИЯ ПОЧЕК

... 1. Фармацевтическая композиция, содержащая ингибитор ROBO2, который ингибирует биологическую активность ROBO2, характеризующаяся тем, что ингибитор ROBO2 выбран из группы, состоящей из антитела к ROBO2 или его антигенсвязывающего фрагмента, который специфично связывается с ROBO2, антисмысловой молекулы, направленной на нуклеиновую кислоту, кодирующую ROBO2, короткой интерферирующей РНК (siPHK), направленной на нуклеиновую кислоту, кодирующую ROBO2, аптамера РНК или ДНК, который связывается с ROBO2, структурного аналога ROBO2, растворимого белка ROBO2 и ROBO2 ингибиторного полипептида, и фармацевтически приемлемого носителя.2. Фармацевтическая композиция по п. 1, характеризующаяся тем, что ингибитор ROBO2 препятствует или снижает связывание полипептида ROBO2 с SLIT2, с Nck или с обоими.3. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1 или 2, характеризующаяся тем, что ингибитор ROBO2 представляет собой структурный аналог.4. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1 или 2, характеризующаяся ...

ПРОТЕОМНЫЕ МАРКЕРЫ ИЛФ

СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ЗАБОЛЕВАНИЯ, СОПРОВОЖДАЮЩЕГОСЯ ПОВЫШЕННОЙ ГИБЕЛЬЮ КЛЕТОК, И НАБОР ДЛЯ ЕГО ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ

ЭКСПРЕССИЯ мРНК ГЕНОВ ДЛЯ ПЕРСОНАЛИЗАЦИИ ПРОТИВООПУХОЛЕВОЙ ТЕРАПИИ ПАЦИЕНТОВ АНТАГОНИСТОМ MDM2

ДЕТЕКТИРОВАНИЕ РАКА ПО ПОВЫШЕННЫМ УРОВНЯМ BCL-2

... 1. Способ детектирования рака у субъекта, предусматривающий детектирование присутствия Bcl-2 в биологической пробе, полученной из организма указанного субъекта, где уровень Bcl-2 выше предопределенного порога служит признаком наличия рака у указанного субъекта. ! 2. Способ по п.1, где указанное детектирование предусматривает ! (a) приведение биологической пробы в контакт со связывающим агентом, который связывается с белком Bcl-2, с образованием комплекса; ! (b) детектирование указанного комплекса; и установление корреляции детектируемого комплекса с количеством белка Bcl-2 в пробе, причем наличие повышенного уровня белка Bcl-2 служит признаком наличия рака. ! 3. Способ по п.1, где биологической пробой является моча. ! 4. Способ по п.1, где рак представляет собой рак яичника. ! 5. Способ по п.2, где связывающий агент иммобилизован на носителе. ! 6. Способ по п.5, где при указанном детектировании (b) используют иммуноферментное детектирование на основе ELISA. ! 7. Способ по п.1, дополнительно ...

ОЦЕНКА АКТИВНОСТИ КЛЕТОЧНЫХ СИГНАЛЬНЫХ ПУТЕЙ С ПРИМЕНЕНИЕМ ВЕРОЯТНОСТНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ ЦЕЛЕВЫХ ГЕНОВ

... 1. Способ, включающий:выведение активности одного или более клеточных сигнальных путей в ткани медицинского субъекта, основанное по меньшей мере на уровне(-ях) экспрессии (20) одного или более целевых генов клеточного сигнального пути(-ей), измеренном в извлеченном образце ткани медицинского субъекта, при этом выведение включает:выведение активности клеточного сигнального пути(-ей) в ткани медицинского субъекта посредством оценки по меньшей мере части вероятностной модели (40-1, …, 40-7), предпочтительно Байесовой сети (40-1, …, 40-7), представляющей клеточный сигнальный путь(-и) для ряда входных данных, включая по меньшей мере уровень(-и) экспрессии (20) одного или более целевых генов клеточного сигнального пути(-ей), измеренный в извлеченном образце ткани медицинского субъекта;оценку (46) уровня в ткани медицинского субъекта по меньшей мере одного элемента транскрипционного фактора (TF), при этом по меньшей мере один элемент TF управляет транскрипцией одного или более целевых генов клеточного ...

СПОСОБЫ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ ЭОЗИНОФИЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ

МАРКЕТЫ И СПОСОБЫ АНАЛИЗА И ЛЕЧЕНИЯ ЯЗВЕННОГО КОЛИТА И СХОДНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ПАНЕЛИ ИЗ 20 ГЕНОВ

... 1. Способ предсказания пригодности применения заданного вида терапии для лечения у субъекта желудочно-кишечного расстройства, включающий: ! a) приготовление образца нуклеиновых кислот из образца, полученного у субъекта; ! b) приведение образца в контакт с рядом фрагментов нуклеиновых кислот, состоящим по меньшей мере из части из 2 членов группы, состоящей из нуклеотидных последовательностей, соответствующих SEQ ID NO:1-20, с целью определения уровней содержания фрагментов, входящих в указанный ряд; ! c) оценку образца в сравнении с эталонным стандартом с целью определения величины изменения количеств по меньшей мере двух членов, присутствующих в образце; и ! d) сопоставление величины изменения с пригодностью применения заданного вида терапии для лечения желудочно-кишечного расстройства. ! 2. Способ по п.1, в котором субъект является пациентом с желудочно-кишечным расстройством, а заданным видом терапии является применение антител к TNFα. ! 3. Способ по п.2, в котором антитело к TNFα представляет ...

СПОСОБ ХАРАКТЕРИЗАЦИИ БИОЛОГИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ ЯИЦ ГЕЛЬМИНТОВ, ПРЕЖДЕ ВСЕГО ЯИЦ ГЕЛЬМИНТОВ Р. TRICHURIS

... 1. Способ оценки биологической активности эмбрионированных яиц Trichuris, заключающийся в том, что осуществляют по меньшей мере 3 из следующих анализов: ! а) оценку и/или подтверждение стадии эмбрионального развития яиц гельминтов с помощью метода количественной ПЦР с использованием пригодных маркерных последовательностей для определения количества копий геномной ДНК, ! б) оценку метаболической активности эмбрионированных яиц гельминтов с помощью биохимических и/или молекулярно-биологических методов, ! в) оценку индуцибельности генной экспрессии в эмбрионированных яйцах гельминтов, ! г) оценку с помощью микроскопа подвижности личинок гельминтов, находящихся в яйце, в течение продолжительных периодов наблюдения после предварительной инкубации при повышенных температурах и/или ! д) оценку коэффициента вылупляемости личинок Trichuris в организме лабораторного животного, при этом осуществляют количественное сравнение интактных эмбрионированных яиц, выделенных из содержимого кишечника, с внутренним ...

НАБОР ИЛИ УСТРОЙСТВО ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ РАКА ОБОДОЧНОЙ И ПРЯМОЙ КИШКИ И СПОСОБ ОБНАРУЖЕНИЯ

НАБОР ИЛИ УСТРОЙСТВО ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ РАКА ЛЕГКОГО И СПОСОБ ОБНАРУЖЕНИЯ

НАБОР ИЛИ УСТРОЙСТВО ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ РАКА ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ И СПОСОБ ОБНАРУЖЕНИЯ

АПОПТОТИЧЕСКАЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ К Apo2L/TRAIL ПУТЕМ ТЕСТИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ GalNac-N14 В КЛЕТКАХ/ТКАНЯХ

... 1. Способ прогнозирования чувствительности образца ткани или клеток млекопитающего к Apo2L/TRAIL, включающий в себя стадии: ! получения образца ткани или клеток млекопитающего; ! исследование образца ткани или клеток млекопитающего для выявления экспрессии GalNac-T14, где экспрессия указанной GalNac-T14 прогнозирует чувствительность указанного образца ткани или клеток к апоптоз-индуцирующей активности Apo2L/TRAIL. ! 2. Способ по п.1, в котором указанную экспрессию GalNac-T14 исследуют путем выявления экспрессии мРНК GalNac-T14. ! 3. Способ по п.1, в котором указанную экспрессию GalNac-T14 исследуют с помощью иммуногистохимии. ! 4. Способ по п.1, дополнтительно включающий в себя стадию исследования экспрессии рецепторов DR4, DR5, DcR1 или DcR2 в указанном образце ткани или клеток. ! 5. Способ по п.1, в котором образец ткани или клеток содержит злокачественную ткань или злокачественные клетки. ! 6. Способ по п.5, в котором указанные злокачественные клетки представляют собой клетки или ткань ...

МОДУЛЯТОРЫ CIDEA ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ АКНЕ, СЕБОРЕЙНОГО ДЕРМАТИТА ИЛИ ГИПЕРСЕБОРЕИ

... 1. In vitro или in vivo способ скрининга соединений-кандидатов для профилактического и/или актуального лечения акне, себорейного дерматита или заболеваний кожи, связанных с гиперсебореей, включающий определение способности соединения модулировать экспрессию или активность CIDEA, или экспрессию его гена, или активность по меньшей мере одного из его промоторов. ! 2. Способ по п.1, включающий внесение соединения в контакт с белком CIDEA и определение способности соединения модулировать активность белка CIDEA, причем разница в активности по сравнению с контролем, проведенным в отсутствие соединения, указывает на пригодность соединения для профилактического и/или актуального лечения акне, себорейного дерматита или заболеваний кожи, связанных с гиперсебореей. ! 3. In vitro способ скрининга соединений-кандидатов для профилактического и/или актуального метода лечения акне, себорейного дерматита или заболеваний кожи, связанных с гиперсебореей, по п.1, включающий следующие стадии: ! а. получения ...

СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ТУБЕРКУЛЕЗА

КОМБИНИРОВАННЫЕ ВИДЫ ЛЕЧЕНИЯ, СОДЕРЖАЩИЕ АНТАГОНИСТЫ С-МЕТ И АНТАГОНИСТЫ B-RAF

... 1. Способ лечения пациента со злокачественной опухолью, предусматривающий введение эффективного количества антагониста B-raf и антагониста c-met.2. Способ лечения пациента со злокачественной опухолью, которая характеризуется повышенной вероятностью развития устойчивости к антагонисту B-raf, предусматривающий введение эффективного количества антагониста B-raf и антагониста c-met.3. Способ увеличения и/или восстановления чувствительности к антагонисту B-raf, предусматривающий введение пациенту со злокачественной опухолью эффективного количества антагониста B-raf и антагониста c-met.4. Способ увеличения периода чувствительности к антагонисту B-raf, предусматривающий введение пациенту со злокачественной опухолью эффективного количества антагониста B-raf и антагониста c-met.5. Способ лечения пациента с устойчивой к антагонисту B-raf злокачественной опухолью, предусматривающий введение эффективного количества антагониста B-raf и антагониста c-met.6. Способ увеличения длительности ответа на антагонист ...

АПОПТОТИЧЕСКАЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ К Apo2L/TRAIL ПУТЕМ ТЕСТИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ GalNac-T14 В КЛЕТКАХ/ТКАНЯХ

... 1. Способ прогнозирования чувствительности образца ткани или клеток млекопитающего к Apo2L/TRAIL, включающий в себя стадии: ! получения образца ткани или клеток млекопитающего; ! исследование образца ткани или клеток млекопитающего для выявления экспрессии GalNac-T14, где экспрессия указанной GalNac-T14 прогнозирует чувствительность указанного образца ткани или клеток к апоптоз-индуцирующей активности Apo2L/TRAIL. ! 2. Способ по п.1, в котором указанную экспрессию GalNac-T14 исследуют путем выявления экспрессии мРНК GalNac-T14. ! 3. Способ по п.1, в котором указанную экспрессию GalNac-T14 исследуют с помощью иммуногистохимии. ! 4. Способ по п.1, дополнтительно включающий в себя стадию исследования экспрессии рецепторов DR4, DR5, DcR1 или DcR2 в указанном образце ткани или клеток. ! 5. Способ по п.1, в котором образец ткани или клеток содержит злокачественную ткань или злокачественные клетки. ! 6. Способ по п.5, в котором указанные злокачественные клетки представляют собой клетки или ткань ...

НУТРИГЕНОМНЫЕ СПОСОБЫ И КОМПОЗИЦИИ

... 1. Применение одной или более композиции для получения одного или более лекарственного средства, которые вместе используют для лечения заболевания или состояния, выбранного из группы, состоящей из синдрома дефицита удовлетворения (RDS), расстройства, вызванного употреблением психоактивных веществ (SUD), острой или хронической боли, воспаления, повреждения суставов, стресса, беспокойства, бессонницы, инсомнии, апатичности, синдрома гиперактивности с дефицитом внимания, депрессии и предменструального дисфорического расстройства, где композицию(и) вводят пациенту, генотип которого определен и коррелирует с заболеванием или состоянием, где композиция(и) включает по меньшей мере следующие вещества: ! а. ингибирующее разрушение опиата количество по меньшей мере одного из веществ, выбранных из группы, состоящей из D-аминокислоты, пептида и структурного аналога или производного D-аминокислоты или пептида; ! b. промотирующее синтез нейротрансмиттера количество по меньшей мере одного предшественника ...

СПОСОБЫ И БИОМАРКЕРЫ ДЛЯ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ И ОЦЕНКИ ЛЕЧЕНИЯ АГОНИСТОМ ОХ40

КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ И МОНИТОРИНГА ГИПЕРТИРЕОЗА У ЖИВОТНЫХ СЕМЕЙСТВА КОШАЧЬИХ

... 1. Способ диагностики существования или наличия высокого риска гипертиреоза у животного семейства кошачьих, включающий измерение уровня экспрессии одного или более биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из генов, приведенных в таблице A и B; любого из IYD, TG, SLC5A5 (NIS), TPO, TSHR, DUOX1 и DUOX2 (ThOX); и их продуктов экспрессии, в биологическом образце от указанного животного семейства кошачьих, где измененная экспрессия одного или более биомаркеров в образце относительно контрольной величины экспрессии в образце от нормального животного семейства кошачьих или группы животных семейства кошачьих, и/или относительно предшествующей индивидуальной исходной величины для этого животного семейства кошачьих указывает на существование или высокий риск гипертиреоза.2. Способ по п.1a. где один или более биомаркеров включают IYD, TG, SLC5A5 (NIS), TPO, TSHR, DUOX1, DUOX2 (ThOX), TGFB1 и/или CSTD; или их продукты экспрессии, и где увеличение экспрессии IYD, TG, SLC5A5 (NIS), TPO, TSHR, DUOX1 ...

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНЫХ МАРКЕРОВ IL-3, IL-33 и IL12ρ40 ДЛЯ ХАРАКТЕРИСТИКИ СТЕПЕНИ ТЯЖЕСТИ РЕСПИРАТОРНЫХ ИНФЕКЦИЙ, ВЫЗВАННЫХ РЕСПИРАТОРНО-СИНЦИТИАЛЬНЫМ ВИРУСОМ ЧЕЛОВЕКА И МЕТАПНЕВМОВИРУСОМ ЧЕЛОВЕКА

УЛУЧШЕННОЕ ВЫЯВЛЕНИЕ КОРОТКИХ ГОМОПОЛИМЕРНЫХ ПОВТОРОВ

РАСТЕНИЯ СОИ, УСТОЙЧИВОЙ К ГЕРБИЦИДАМ, И СПОСОБЫ ИХ ИДЕНТИФИКАЦИИ

... 1. Способ идентификации одновременного присутствия элитных событий EE-GM3 и EE-GM1 в биологических образцах, включающий обнаружение области, специфической для EE-GM3, с помощью специфического праймера или зонда, специфически распознающего 5'- или 3'-фланкирующую последовательность чужеродной ДНК в EE-GM3, включающей гены устойчивости к гербицидам, и обнаружение области, специфической для EE-GM1, с помощью специфического праймера или зонда, специфически распознающего 5'- или 3'-фланкирующую последовательность чужеродной ДНК в EE-GM1, включающей гены устойчивости к гербицидам.2. Способ по п.1, отличающийся тем, что включает амплификацию двух фрагментов ДНК длиной между 50 и 1000 п.о. из нуклеиновой кислоты, присутствующей в указанном биологическом образце, с помощью первой полимеразной цепной реакции, использующей по меньшей мере два праймера, один из которых распознает 5'-фланкирующую область чужеродной ДНК в EE-GM3, содержащей гены устойчивости к гербицидам, причем указанная 5'-фланкирующая ...

СПОСОБЫ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ФАКТОРЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ И ВАРИАНТЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ

... 1. Способ повышения продукции интересующего полипептида, где способ предусматривает:a) наличие патогенных клеток А/Е, содержащих рекомбинантную молекулу нуклеиновой кислоты Orf11/GrlA,b) экспрессию полипептида Orf11/GrlA, кодируемого рекомбинантной молекулой нуклеиновой кислоты Orf11/GrlA, иc) выращивание патогенных клеток А/Е в условиях, благоприятных для продукции интересующего полипептида, где продукция интересующего полипептида повышается по сравнению с патогенными клетками А/Е, которые не содержат рекомбинантную молекулу нуклеиновой кислоты Orf11/GrlA.2. Способ по п.1, где рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты Orf11/GrlA является гетерологичной.3. Способ по п.1, где рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты Orf11/GrlA не является гетерологичной.4. Способ по п.1, где рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты Orf11/GrlA получена из энтерогеморрагической E.coli (ЕНЕС), энтеропатогенной E.coli (EPEC) или Citrobacter rodentium.5. Способ по п.1, где рекомбинантная молекула нуклеиновой ...

ЛЕЧЕНИЕ СВЯЗАННЫХ С ЭРИТРОПОЭТИНОМ (ЕРО) ЗАБОЛЕВАНИЙ ПУТЕМ ИНГИБИРОВАНИЯ ПРИРОДНОГО АНТИСМЫСЛОВОГО ТРАНСКРИПТА К ЕРО

... 1. Способ модуляции функции и/или экспрессии полинуклеотида эритропоэтина (EPO) в клетках или тканях пациентаили, предусматривающий приведение указанных клеток или тканей в контакт по меньшей мере с одним антисмысловым олигонуклеотидом длиной в 5-30 нуклеотидов, где указанный олигонуклеотид имеет последовательность, по меньшей мере на 50% идентичную обратному комплементу полинуклеотида, содержащего от 5 до 30 нуклеотидов внутри нуклеотидов 1-156 последовательности SEQ ID NO: 2 (фигура 3); в результате которого происходит модуляция функции и/или экспрессии полинуклеотида эритропоэтина (EPO) в клетках или тканях пациентаили.2. Способ модуляции функции и/или экспрессии полинуклеотида эритропоэтина (EPO) в клетках или тканях пациентаили, предусматривающий приведение указанных клеток или тканей в контакт по меньшей мере с одним антисмысловым олигонуклеотидом длиной в 5-30 нуклеотидов, где указанный олигонуклеотид имеет последовательность, по меньшей мере на 50% идентичную обратному комплементу ...

ФОСФОДИЭСТЕРАЗА 4D7 В КАЧЕСТВЕ МАРКЕРА ДЛЯ АГРЕССИВНОГО ГОРМОН-ЧУВСТВИТЕЛЬНОГО РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

... 1. Фосфодиэстераза 4D7 (PDE4D7) для применения в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где экспрессия маркера увеличена при сравнении экспрессии в ткани агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы с экспрессией в нормальной ткани или ткани доброкачественной опухоли предстательной железы.2. Композиция для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, содержащая аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты и/или пептидный аффинный лиганд для продукта экспрессии или белка PDE4D7.3. Композиция по п.2, где указанный аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты или пептидный аффинный лиганд модифицированы, чтобы они функционировали в качестве контрастного средства.4. Композиция по п.2, где указанный аффинный лиганд ...

СПОСОБЫ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ВОСПРИИМЧИВОСТИ ПАЦИЕНТА К ВНУТРИБОЛЬНИЧНОЙ ИНФЕКЦИИ И СОСТАВЛЕНИЯ ПРОГНОЗА РАЗВИТИЯ СЕПТИЧЕСКОГО СИНДРОМА

... 1. Способ определения восприимчивости пациента к внутрибольничной инфекции, согласно которому:a) получают биологический образец пациента и экстрагируют биологический материал из биологического образца;b) получают по меньшей мере один специфический реагент в отношении продукта экспрессии по меньшей мере одного гена-мишени, выбираемого среди генов-мишеней S100A9 и S100A8;c) определяют экспрессию по меньшей мере одного из генов-мишеней S100A9 и S100A8, причем сверхэкспрессия по отношению к определенной пороговой величине является указанием на восприимчивость к внутрибольничной инфекции.2. Способ по п.1, согласно которому на стадии с) определяют экспрессию гена-мишени S100A9 и гена-мишени S100A8, причем сверхэкспрессия гена-мишени S100A9 по отношению к определенной пороговой величине и сверхэкспрессия гена-мишени S100A8 по отношению к определенной пороговой величине являются указанием на восприимчивость к внутрибольничной инфекции.3. Способ по п.1, согласно которому биологический образец берут ...

БИОМАРКЁРЫ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ НЕОПЛАСТИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ С ПРИМЕНЕНИЕМ НАЦЕЛЕННЫХ НА АНДРОГЕН МЕТОДОВ ЛЕЧЕНИЯ

НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ И СПОСОБЫ ДЕТЕКЦИИ ПАТОГЕНОВ И ПОЛЕЗНЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ, АССОЦИИРОВАННЫЕ С ОТВЕТОМ НА АНТИАГОНИСТЫ РЕЦЕПТОРА CRTH2

ЛЕЧЕНИЕ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ ОПУХОЛЕЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МОДУЛЯТОРОВ ИЗОФОРМ PI3-КИНАЗЫ

СИСТЕМЫ

ТОНКОЕ КАРТИРОВАНИЕ И ПОДТВЕРЖДЕНИЕ ЛОКУСА QTL, ОТВЕТСТВЕННОГО ЗА ПРИЗНАКИ СОДЕРЖАНИЯ ВОЛОКОН И ЦВЕТА ОБОЛОЧКИ СЕМЯН, И ИДЕНТИФИКАЦИЯ МАРКЕРОВ SNP ДЛЯ МАРКЕР-ОПОСРЕДОВАННОГО ОТБОРА НА ЭТИ ПРИЗНАКИ В ЛИНИИ КАНОЛЫ С ЖЕЛТОЙ ОБОЛОЧКОЙ СЕМЯН (YSC) YN01-429 И В ЕЕ ЛИНИИ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ

СПОСОБ ПРЕДСКАЗАНИЯ ОТВЕТА НА ЛЕЧЕНИЕ

... 1. Способ предсказания ответа пациента на лечение ингибитором димеризации HER, заключающийся в том, что ! а) оценивают в биологическом образце, взятом из организма пациента, ! маркерный ген или комбинацию маркерных генов, выбранных из группы, включающей маркерные гены эпидермального фактора роста, трансформирующего фактора роста альфа и HER2 или ! комбинацию маркерных генов, включающую маркерный ген амфирегулина и маркерный ген, выбранный из группы, включающей маркерный ген эпидермального фактора роста, трансформирующего фактора роста альфа и HER2, и ! б) предсказывают ответ пациента на лечение ингибитором димеризации HER на основе оценки результатов, полученных на стадии а). ! 2. Способ по п.1, в котором стадия а) оценки маркерного гена или комбинации маркерных генов заключается в том, что ! а1) оценивают уровень экспрессии маркерного гена или комбинации маркерных генов, ! а2) определяют, находится ли уровень экспрессии, оцененный на стадии а1), выше или ниже порогового значения. ! 3.

C12ORF48 КАК ГЕН-МИШЕНЬ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ И ДИАГНОСТИКИ РАКА

... 1. Способ обнаружения или диагностики рака у пациента, включающий определение уровня экспрессии гена C12ORF48 в полученном от пациента биологическом образце, в котором повышение указанного уровня по сравнению с нормальным контрольным уровнем гена указывает на то, что пациент страдает раком или имеет риск развития рака, котором уровень экспрессии определяют способом, выбранным из группы, состоящей из следующих способов: ! (а) обнаружение мРНК гена C12ORF48, ! (b) обнаружение белка, кодируемого геном C12ORF48, и ! (с) обнаружение биологической активности белка, кодируемого геном C12ORF48. ! 2. Способ по п.1, в котором указанное повышение составляет по меньшей мере 10% по сравнению с указанным нормальным контрольным уровнем. ! 3. Способ по п.1, в котором полученный от пациента биологический образец представляет собой биоптат. ! 4. Способ по п.1, в котором рак выбран из группы рака поджелудочной железы и рака предстательной железы. ! 5. Способ по п.4, в котором рак поджелудочной железы представляет ...

СПОСОБЫ ПОВЫШЕНИЯ КАЧЕСТВА ЖИЗНИ ПОЛОВОЗРЕЛОГО ЖИВОТНОГО

... 1. Способ улучшения качества жизни половозрелого и гериатрического животного, включающий кормление животного композицией, содержащей питательные элементы в основном в соответствии с композицией, выбираемой из следующих композиций А, В и С, определенных из расчета на сухую массу: ! А В С Питательный компонент Сырой белок, % 20,1 19,3 35,7 Жир, % 16,5 16,9 22,5 Кальций, % 0,7 0,7 0,9 Фосфор, % 0,6 0,7 0,8 ЕРА, % 0,3 0,3 0,2 DHA, % 0,2 0,2 0,3 Линолевая кислота, % 4 4 5,1 Все N-3 жирные кислоты, % 1,3 2,2 1,1 Все N-6 жирные кислоты, % 4 4 5,1 Таурин, млн-1 1400 1525 2100 Карнитин, млн-1 314 337 367 Метионин, % 1 1,2 1,3 Цистин, % 0,3 0,2 0,5 Марганец, % 87 100 104 Витамин Е, МЕ/кг 1492 1525 1292 Витамин С, млн-1 127 261 141 Липоевая кислота, млн-1 101 135 ! 2. Способ по п.1, где способ включает кормление животного композицией в количестве, эффективном для повышения качества жизни животного, где повышенное качество жизни подтверждено улучшением одной или нескольких характеристик, выбираемых ...

ПРОТИВОВИРУСНАЯ ТЕРАПИЯ

... 1. Способ определения вероятности того, что пациент, страдающий вирусной инфекцией печени, будет чувствителен к противовирусной терапии, включающей стимуляцию активности интерферона (ИФН), где способ включает: ! (а) анализ образца пациента на экспрессию хотя бы одного гена каждой из нижеследующих групп генов: ! (1) LOC129607, RPLP0 и HERC5, ! (2) HTATIP2 и IFI44L, ! (3) IFI27, IFIT1, G1P2, IRF7, RSAD2, IFI44, OAS3 и IFIT2, ! (4) LAMP3, HERC6, LOC286208, IFIT3, RALGPS1, PARP9, CCDC75 и CNP, ! (5) HIST1H2BG, HIST1H2BD, FLJ20035, PARP12, PNPT1, LGALS3BP, SAMD9 и LOC402560, а также ! (б) сопоставление экспрессии генов в образце с экспрессией тех же генов в контрольном образце. ! 2. Способ по п.1, в котором отклонения в экспрессии генов образце по сравнению с теми же генами в контрольном образце указывает на то, что пациент вероятно не будет чувствителен к упомянутой противовирусной терапии. ! 3. Способ по п.1, в котором отсутствие отклонений в экспрессии генов образце по сравнению с теми же ...

БИОЛОГИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ И СПОСОБЫ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ ВОСПРИИМЧИВОСТИ К АНТАГОНИСТАМ В-КЛЕТОК

... 1. Биомаркер для прогнозирования восприимчивости пациента к терапевтическому агенту, включающему антагонист В-клеток, где биомаркер включает повышенный общий уровень мРНК плазматических клеток/плазмабластов в биологическом образце, полученном от пациента, по сравнению с общим уровнем мРНК плазматических клеток/плазмабластов в биологическом образце, полученном от контрольного субъекта, или по сравнению с пороговым значением общего уровня мРНК плазматических клеток/плазмабластов.2. Биомаркер по п.1, дополнительно включающий низкий уровень общей мРНК наивных/зрелых В-клеток в биологическом образце пациента по сравнению с уровнем общей мРНК наивных/зрелых В-клеток в биологическом образце контрольного субъекта или по сравнению с пороговым значением общего уровня мРНК наивных/зрелых В-клеток.3. Биомаркер по п.1, отличающийся тем, что биологическим образцом является цельная кровь.4. Биомаркер по п.1, отличающийся тем, что пациент болен ревматоидным артритом или предполагается, что он болен ревматоидным ...

БИОМАРКЕР ER2 ДЛЯ ГИНЕКОЛОГИЧЕСКОГО РАКА

... 1. Специфичный биомаркер гинекологического рака, содержащий:(i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащую SEQ ID NO:1, или ее фрагмент или вариант, или молекулу нуклеиновой кислоты, которая содержит указанную последовательность нуклеиновой кислоты; или(ii) аминокислотную последовательность, содержащую SEQ ID NO:2, или ее фрагмент или вариант, или молекулу аминокислоты, которая содержит указанную аминокислотную последовательность.2. Биомаркер по п.1, отличающийся тем, что указанные фрагменты или варианты содержат:(i) последовательность нуклеиновой кислоты, по меньшей мере приблизительно на 50%, или по меньшей мере приблизительно на 60%, или по меньшей мере приблизительно на 70%, или по меньшей мере приблизительно на 75%, или по меньшей мере приблизительно на 80%, или по меньшей мере приблизительно на 85%, или по меньшей мере приблизительно на 90%, или по меньшей мере приблизительно на 95%, или по меньшей мере приблизительно на 96%, или по меньшей мере приблизительно на 97%, или ...

РЕГИСТРАЦИЯ РАХ2 ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

... 1. Способ мониторинга состояний молочной железы у субъекта, включающий:определение отношения экспрессии гена парного бокса 2 к экспрессии гена бета-дефензина-1 (PAX2-к-DEFB1) в клетках, полученных из молочной железы субъекта,при этом отношение экспрессии PAX2-к-DEFB1 коррелирует с состояниями молочной железы.2. Способ по п.1, в котором отношение экспрессии PAX2-к-DEFB1 100:1 или выше является показателем наличия рака молочной железы у субъекта и отношение экспрессии PAX2-к-DEFB1 менее чем 100:1 является показателем наличия незлокачественного или предзлокачественного состояния молочной железы у субъекта.3. Способ по п.2, в котором предзлокачественным состоянием молочной железы является внутриэпителиальная неоплазия молочной железы.4. Способ по п.1, в котором стадия определения включает:определение уровня экспрессии гена PAX2 по сравнению с уровнем экспрессии контрольного гена;определение уровня экспрессии гена DEFB1 по сравнению с уровнем экспрессии того же контрольного гена иопределение ...

НЕКОТОРЫЕ ХИМИЧЕСКИЕ СОЕДИНЕНИЯ, КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ

ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПРИЗНАКА КАЧЕСТВА В СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ И ПЛОДООВОЩНЫХ КУЛЬТУРАХ

... 1. Способ определения генетических или белковых/ферментативных маркеров для предсказания, в момент сбора урожая, ожидаемой величины релевантного признака (показателя) качества для сельскохозяйственного и/или плодоовощного продукта в конкретный момент во время или после сбора урожая, предусматривающий стадии: ! a. определения количественно или относительно измеряемой величины для релевантного признака для конкретного сельскохозяйственного или плодоовощного продукта; ! b. определения уровней экспрессии набора генов, предпочтительно связанных с этим конкретным признаком качества, или концентрации белка набора белков/ферментов, предпочтительно связанных с этим конкретным признаком качества, в нескольких временных точках до, во время и после сбора урожая; ! c. определения корреляции уровней экспрессии, определенных в b), или концентрации белка, определенной в b), с величиной (в соответствии с определением, указанным в а)) признака качества, специфического для этого сельскохозяйственного или ...

КОМБИНАЦИИ БИОМАРКЕРОВ ДЛЯ КОЛОРЕКТАЛЬНЫХ ОПУХОЛЕЙ

... 1. Способ, включающий:(a) измерение в образце, полученном от субъекта, количества каждого биомаркера панели биомаркеров, содержащей по меньшей мере один высокоприоритетный биомаркер и по меньшей мере два основных биомаркера, выбранных из группы, состоящей из IL1B, PTGS2, S100A8, LTF, CXCL10 и CACNB4;(b) вычисление оценки вероятности на основании измерения на стадии (a); и(c) исключение колоректальной опухоли для субъекта, если оценка на стадии (b) ниже, чем предварительно определенная оценка; или(d) подтверждение вероятности колоректальной опухоли для субъекта, если оценка на стадии (b) выше, чем предварительно определенная оценка.2. Способ, включающий:(a) измерение в образце, полученном от субъекта, количества каждого биомаркера панели биомаркеров, содержащей по меньшей мере один высокоприоритетный биомаркер и по меньшей мере два основных биомаркера, выбранных из группы, состоящей из IL1B, PTGS2, S100A8, LTF, CXCL10 и CACNB4;(b) сравнение количества, измеренного на стадии (a), с эталонным ...

СПОСОБЫ ЛЕЧЕНИЯ, ДИАГНОСТИКИ И МОНИТОРИНГА РЕВМАТОИДНОГО АРТРИТА

... 1. Способ диагностики молекулярного субтипа RA у субъекта, причем способ включает измерение в биологическом образце, полученном от субъекта, экспрессии одного гена или их комбинации или экспрессии одного белка или их комбинации, кодируемой одним геном или их комбинацией, где один ген или их комбинация выбраны из любого из перечисленных в таблице 1, в таблице 5, в таблице 10, CXCL13, FcRH5, sFcRH5, LTβ, ICAM3, IL18, PACAP, TNFRSF7, IgJ, IGM, IgG и XBP1, где повышенная экспрессия одного гена или их комбинации или повышенная экспрессия одного белка или их комбинации является индикатором молекулярного субтипа RA.2. Способ по п. 1, в котором биологический образец представляет собой синовиальную ткань.3. Способ по п. 2, в котором экспрессию одного гена или их комбинации измеряют с использованием способа на основе ПЦР или на основе чипа микроматрицы.4. Способ по п. 1, в котором комбинация генов включает XBP1, SMPDL3B, LOC255458, LOC339562, PIM2, SLC2A11, FAM46C, NDP52, CD79A, SLC38A1, IGLL1, LOC91316 ...

КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ ГИПЕРТИРЕОЗА У ЖИВОТНЫХ-КОМПАНЬОНОВ

... 1. Выделенная молекула ДНК, содержащая (a) нуклеотидную последовательность SEQ ID NO:1 или (b) нуклеотидную последовательность, полностью комплементарную нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1.2. Выделенная молекула ДНК, содержащая по меньшей мере 70 смежных нуклеотидов SEQ ID NO:1 или по меньшей мере 70 смежных нуклеотидов, полностью комплементарных нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1.3. Выделенная молекула ДНК по п. 2, где 70 смежных нуклеотидов находятся в кодирующей последовательности белка натрий-йодного симпортера кошки (белка NIS).4. Выделенная молекула РНКи или антисмысловая молекула нуклеиновой кислоты, избирательно связывающаяся с молекулой нуклеиновой кислоты по п. 1.5. Выделенная молекула РНКи или антисмысловая молекула нуклеиновой кислоты по п. 4, где молекула РНКи избирательно связывается с кодирующей последовательностью белка натрий-йодного симпортера кошки (белка NIS).6. Выделенный белок от 8 до 400 аминокислот в длину, содержащий аминокислотную последовательность ...

ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНЫЕ КАРТИНЫ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ, КОТОРЫЕ ПРЕДСКАЗЫВАЮТ ХЕМОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ И ХЕМОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ К ДОЦЕТАКСЕЛУ

... 1. Способ скрининга пациента в отношении ответа на терапию доцетакселом, включающий в себя стадии: получения образца опухоли от пациента; выделения РНК из образца; определения относительной экспрессии отдельных нуклеиновых кислот в РНК, по меньшей мере, 10 нуклеиновых кислот, выбранных из группы, состоящей из SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:28, SEQ ID NO:29, SEQ ID NO:30, SEQ ID NO:31, SEQ ID NO:32, SEQ ID NO:33, SEQ ID NO:34, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:36, SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:39, SEQ ID NO:40, SEQ ID NO:41, SEQ ID NO:42, SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:45, SEQ ID NO:46, SEQ ID NO:47, SEQ ID NO:48, SEQ ID NO:49, SEQ ID NO:50, ...

НОВЫЕ ПОЛИНУКЛЕОТИДЫ И ПОЛИПЕПТИДЫ ГЕНА IFN АЛЬФА-17

... 1. Выделенный полинуклеотид, включающий а) нуклеотидную последовательность, которая, по крайней мере, на 90% идентична нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1 или ее кодирующей последовательности, при условии, что указанная нуклеотидная последовательность включает, по крайней мере, один SNP, выбранный из группы, состоящей из g771с, 808Ins(a), или b) нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности (а). 2. Выделенный полинуклеотид, включающий а) нуклеотидную последовательность, которая, по крайней мере, на 95%, а предпочтительно, по крайней мере, на 99% идентична нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1 или ее кодирующей последовательности, при условии, что указанная нуклеотидная последовательность включает, по крайней мере, один SNP, выбранный из группы, состоящей из g771с, 808Ins(a), или b) нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности (а). 3. Выделенный полинуклеотид, состоящий из: а) (i) всей или части нуклеотидной ...

СПОСОБ ЛЕЧЕНИЯ БУЦИНДОЛОЛОМ, ОСНОВАННЫЙ НА ОПРЕДЕЛЕНИИ ГЕНОТИПА

... 1. Способ оценки эффективности лечения пациента буциндололом, включающий в себя получение данных о последовательности, относящихся по меньшей мере к одному полиморфизму в гене адренергического рецептора, присутствующего у пациента, где полученные данные являются показателем эффективности буциндолола для указанного пациента.2. Способ по п.1, где геном адренергического рецептора является βAR или αAR.3. Способ по п.2, где геном адренергического рецептора является βAR.4. Способ по п.2, где геном адренергического рецептора является αAR.5. Способ по п.2, где указанные данные о последовательности включают в себя либо (i) данные относительно нуклеотида в положении 1165 кодирующей последовательности одного или обоих аллелей βAR указанного пациента, либо (ii) данные относительно аминокислоты в положении 389 белков βAR указанного пациента, и где рассматривается возможность лечения указанного индивидуума буциндололом.6. Способ по п.5, где нуклеотид в положении 1165 в кодирующих последовательностях ...

СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ВЕРОЯТНОСТИ ТЕРАПЕВТИЧЕСКОГО ОТВЕТА НА ПРОТИВОРАКОВУЮ ХИМИОТЕРАПИЮ СЕРДЕЧНЫМ ГЛИКОЗИДОМ

... 1. In vitro прогностический анализ, который может быть использован для предсказания in vivo терапевтического ответа на заболевание или расстройство, имеющее этиологию, связанную с избыточной пролиферацией клеток, в целях проведения лечения сердечным гликозидом или композицией, содержащей сердечный гликозид, где указанный анализ включает: ! определение отношения α3-изоформы к α1-изоформе α-субъединиц Na, K-АТФазы в образце, выделенном непосредственно или опосредованно из пораженной клеточной ткани in vivo у индивидуума с заболеванием или расстройством, имеющим этиологию, связанную с избыточной пролиферацией клеток, где указанный образец содержит одну или несколько изоформ α-субъединицы Na, K-ATФазы; и ! определение вероятности терапевтического ответа у индивидуума, подвергнутого лечению терапевтически релевантной дозой сердечного гликозида. ! 2. Анализ по п.1, который дополнительно включает предсказание терапевтического ответа клеточной ткани на лечение сердечным гликозидом, если указанное ...

НОВЫЕ СПОСОБЫ ФУНКЦИОНАЛЬНОГО АНАЛИЗА БОЛЬШОГО КОЛИЧЕСТВА ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ ДАННЫХ И ГРУПП ГЕНОВ, ИДЕНТИФИЦИРОВАННЫХ ИЗ УКАЗАННЫХ ДАННЫХ

... 1. Изделие для классификации образца ткани рака молочной железы, которое включает средство для измерения экспрессии генов в следующих дескрипторных группах: ! (1) ERBB2, STARD3, GRB7, THRAP4, PPARBP; ! (2) ESR1, GATA3, XBP1, TFF3, ACADSB; ! (3) KRT5, KRT17, TRIM29, GABRP; ! (4) KRT18, KRT8, PPP2CA, KRT8L2; ! (5) PLAU, COL5A2, FAP, THY1; ! (6) STAT1, UBE2L6, TAP1, LAP3 и ! (7) SEACAM5, SEACAM6, SEACAM7, ! где сверхэкспрессия большинства генов в дескрипторной группе показывает, что образец ткани является положительным для данной группы, и отсутствие сверхэкспрессии большинства генов в дескрипторной группе показывает, что образец ткани является отрицательным для данной группы; и ! где комбинация положительных и/или отрицательных статусов дескрипторных групп образует генную сигнатуру для классификации образца ткани рака молочной железы. ! 2. Изделие по п.1, в котором средство для измерения экспрессии генов включает комплементарные олигонуклеотидные зонды или затравки. ! 3. Изделие по п.2, в ...

СЕЛЕКТИВНОСТЬ В ОТНОШЕНИИ МУТАНТНЫХ ФОРМ И КОМБИНАЦИИ СОЕДИНЕНИЯ, ПРЕДСТАВЛЯЮЩЕГО СОБОЙ ИНГИБИТОР ФОСФОИНОЗИТИД-3-КИНАЗЫ, И ХИМИОТЕРАПЕВТИЧЕСКИХ АГЕНТОВ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ РАКА

... 1. Способ лечения рака, выбранного из рака молочной железы, шейки матки, толстой кишки, эндометрия, желудка, глиомы, рака легкого, меланомы, рака яичников, поджелудочной и предстательной железы, включающий введение млекопитающему терапевтической комбинации в виде объединенной композиции или путем чередования, где терапевтическая комбинация содержит терапевтически эффективное количество GDC-0032, имеющего структуру:,и терапевтически эффективное количество химиотерапевтического агента, выбранного из 5-фторурацила (5-FU), доцетаксела, эрибулина, гемцитабина, GDC-0973, GDC-0623, паклитаксела, фулвестранта, пертузумаба, трастузумаба эмтанзина и трастузумаба.2. Способ по п. 1, где химиотерапевтический агент представляет собой 5-FU.3. Способ по п. 1, где химиотерапевтический агент представляет собой доцетаксел.4. Способ по п. 1, где химиотерапевтический агент представляет собой эрибулин.5. Способ по п. 1, где химиотерапевтический агент представляет собой гемцитабин.6. Способ по п. 1, где химиотерапевтический ...

Способ прогнозирования исхода у больных раком желудка после комбинированного лечения, включающего неоадъювантную химиотерапию по схемам FOLFOX6 или FLOT и хирургическое лечение

Изобретение относится к медицине, а именно к онкологии, и может быть использовано для прогнозирования исхода у больных раком желудка после комбинированного лечения, включающего неоадъювантную химиотерапию по схемам FOLFOX6 или FLOT и хирургическое лечение. Из опухолевой ткани получают кДНК на матрице тотальной РНК с помощью реакции обратной транскрипции. Проводят амплификацию генов PD-L1 и PDK1. Оценивают экспрессию генов PD-L1 и PDK1 с помощью метода 2-ΔΔCt относительно гена GAPDH. Полученные значения подставляют в формулу регрессионной функции и рассчитывают вероятность наступления благоприятного исхода Р. При Р<0.061 прогнозируют благоприятный исход. При Р>0.061 прогнозируют неблагоприятный исход. Способ обеспечивает повышение точности и информативности прогнозирования исхода у больных раком желудка после комбинированного лечения, включающего неоадъювантную химиотерапию по схемам FOLFOX6 или FLOT и хирургическое лечение, за счет оценки экспрессии генов PD-L1 и PDK1 в опухолевой ткани ...

OSTEOGENISCHE PROTEINE IN DER BEHANDLUNG VON METABOLISCHEN KNOCHENKRANKHEITEN

DIAGNOSTIKA UND THERAPEUTIKA FÜR MACULARE DEGENERATION

Menschliche Arylamine-N-acetyltransferase Genen

SH2B-Adapterprotein-3 für die Vorhersage einer Knochenmarkantwort und Immunantwort

Die vorliegende Erfindung betrifft das SH2B-Adapterprotein-3 (SH2B3) zur Anwendung als diagnostischer Marker. Ferner betrifft die vorliegende Erfindung ein Verfahren zur Bestimmung der Expression des SH2B3-Gens.

Methods of predicting responsiveness to interferon treatment and treating hepatitis c infection

Provided are methods of predicting responsiveness of a subject to interferon treatment, comprising comparing a level of expression in a cell of the subject of at least one gene selected from the group consisting KIR3DL3, KIR3DL2, KIR3DL1, KIR2DL1, KIR2DL2, KIR2DL3, KLRG1, KIR3DS1, CD160, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-F, HLA-G and IFI27 to a reference expression data of the at least one gene obtained from at least one interferon responder subject and/or at least one interferon non-responder subject. Also provided are methods and pharmaceutical compositions for treating a subject in need of interferon treatment.

Inducible nucleic acid targets for detection of pathogens, methods and compositions thereof

The present application describes compositions, methods and kits for rapid detection and identification of various microorganisms using inducible RNA. Methods for rapidly detecting microorganisms by detecting expression of inducible RNA of target genes following induction of a target gene using an inducer are described. Some embodiments describe methods and workflows for rapidly detecting microbes such as, but not limited to, Salmonella spp, Listeria spp. and Vibrio spp. Compositions and kits comprise primer nucleic acid sequences having hybridization specificity for priming amplification of genes of microorganisms (or gene fragments) that are responsive to one or more RNA-inducing agents. In some embodiments, kits and compositions further comprise probe nucleic acid sequences having hybridization specificity for genes responsive to RNA-inducing agents or fragments thereof.

Novel uses of vegfxxxb

The invention provides VEGF xxx b, or an agent which selectively promotes the expression of VEGF xxx b in preference to VEGF xxx in cells of a subject or in vitro, or an expression vector system which causes the expression of the VEGF xxx b in a host organism, for use in treating or preventing microvascular hyperpermeability disorders, or in regulating the pro-angiogenic pro-permeability properties of VEGF xxx isoforms, or in supporting epithelial cell survival without increased permeability, or in reducing the nature (for example the number density and/or size) of fenestrations of epithelial filtration membranes in vivo or in vitro.

Compositions and methods for detection of hepatitis a virus nucleic acid

Nucleic acid oligomeric sequences and in vitro nucleic acid amplification and detection methods for detecting the presence of HAV RNA sequences in samples are disclosed. Kits comprising nucleic acid oligomers for amplifying and detecting HAV nucleic acid sequences are disclosed.

Compositions and methods for detecting cryptococcus neoformans

Disclosed are oligonucleotides useful in methods for determining whether a sample contains Cryptococcus neoformans , a causative agent for human cryptococcosis. These oligonucleotides, which have nucleotide sequences derived from a coding segment of the gene encoding the fungal specific transcription factor gene in Cryptococcus neoformans , are useful as forward and reverse primers for a polymerase chain reaction using nucleic acids from a biological sample as templates, and as probes for detecting any resultant amplicon. Detection of an amplicon indicates the sample contains Cryptococcus neoformans . Real-time PCR and detection using florescence resonance energy transfer is disclosed.

Microrna profiles for evaluating multiple sclerosis

The present invention provides methods, systems, and kits for evaluating multiple sclerosis (MS) in a patient. Particularly, the invention provides convenient miRNA-based tests for evaluating a patient for MS, including for diagnosing MS, for excluding MS as a diagnosis, for determining the presence of disease activity associated with MS, and for monitoring the course of disease or efficacy of treatment for MS.

DOPAMINERGIC NEURON PROLIFERATIVE PROGENITOR CELL MARKER Nato3

The present invention is a probe, a primer, and an antibody, for detecting a dopaminergic neuron proliferative progenitor cell. According to the present invention, there is provided a polynucleotide probe and a polynucleotide primer for use in the detection or selection of a dopaminergic neuron proliferative progenitor cell, which can hybridize with a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence of a Nato3 gene, or a complementary sequence thereto, and an antibody against a Nato3 protein, or a part thereof for use in the detection or selection of a dopaminergic neuron proliferative progenitor cell.

Galectin-1 (gal1) as a biomarker for differential diagnosis of osteosarcoma and chondrosarcoma

The present invention relates to a method for differential diagnosis of osteosarcoma and chondrosarcoma, especially chondroblastic osteosarcoma and conventional chondrosarcoma, in a patient comprising a step consisting of detecting galectin-1 (GAL1) expression in a bone sample obtained from said patient.

Method for determining a risk, for a subject, of suffering from atopic dermatitis or severity of atopic dermatitis for a subject suffering from atopic dermatitis and method for using a single-nucleotide polymorphism rs12313273 as a biomarker for determining the development or severity of atopic dermatitis

The invention provides a method for determining a risk, for a subject, of suffering from atopic dermatitis, including: obtaining a biosample of the subject; detecting the presence of the single-nucleotide polymorphism rs12313273 (C/T) at position 30881 of the ORAI1 gene (SEQ ID No.: 1) in the biosample; and determining the risk, for the subject, of suffering from atopic dermatitis, wherein the presence of a C allele or genotype CC of the single-nucleotide polymorphism rs12313273 (C/T) indicates that the subject is at increased risk for suffering from atopic dermatitis.

Marker for Liver-Cancer Diagnosis and Recurrence and Survival Prediction, a Kit Comprising the Same, and Prognosis Prediction in Liver-Cancer Patients Using the Marker

A composition for detecting a marker for the diagnosis or prognosis of liver cancer is disclosed. The composition includes an agent capable of assessing the expression level of UQCRH (ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein). In addition, a kit having the composition, a microarray for the diagnosis of liver cancer using the marker, and a method for detecting the marker, and predicting recurrence following surgery in liver cancer patients are disclosed. The marker is able to contribute to the early diagnosis of liver cancer and prediction of recurrence following surgery and survival of liver cancer patients who have undergone hepatic resection, and also is significant for being a promising therapeutic target for liver cancer.

Compositions and methods for the treatment of immune related diseases

The present invention relates to compositions containing novel proteins and methods of using those compositions for the diagnosis and treatment of immune related diseases.

Dual targeting of mir-208 and mir-499 in the treatment of cardiac disorders

The present invention provides a method of treating or preventing cardiac disorders in a subject in need thereof by inhibiting the expression or function of both miR-499 and miR-208 in the heart cells of the subject. In particular, specific protocols for administering inhibitors of the two miRNAs that achieve efficient, long-term suppression are disclosed. In addition, the invention provides a method for treating or preventing musculoskeletal disorders in a subject in need thereof by increasing the expression or activity of both miR-208 and miR-499 in skeletal muscle cells of the subject.

Predictive models and method for assessing age

Biomarkers useful for diagnosing and assessing physiological age are provided, along with kits for measuring their expression. The invention also provides predictive models, based on the biomarkers, as well as computer systems, and software embodiments of the models for scoring and optionally classifying samples. In a preferred embodiment, the biomarkers include a group of biomarkers whose expression levels are highly correlated to each other. In a preferred embodiment, expression levels of CD248; CD248 and SLC 1A7; CD248 and one, two, three or four of the group consisting of CCR7, B3GAT1, VSIG4 and LR-RN3; or CD248, SLC1A7 and one, two, three or four of the group consisting of CCR7, B3GAT1, VSIG4 and LRRN3 are determined.

Genetic polymorphisms associated with venous thrombosis, methods of detection and uses thereof

The present invention is based on the discovery of genetic polymorphisms that are associated with coronary heart disease and in particular VT and response to drug treatment. In particular, the present invention relates to nucleic acid molecules containing the polymorphisms, variant proteins encoded by such nucleic acid molecules, reagents for detecting the polymorphic nucleic acid molecules and proteins, and methods of using the nucleic acid and proteins as well as methods of using reagents for their detection.

RBM3 in Testicular Cancer Diagnostics and Prognostics

The present disclosure provides a method for determining whether a mammalian subject belongs to a first or a second group, wherein subjects of the first group have a higher risk of having a testicular disorder than subjects of the second group, comprising the steps of: evaluating an amount of RBM3 protein or RBM3 mRNA in at least part of an earlier obtained sample comprising biological material from a testicle of said subject and determining a sample value corresponding to the evaluated amount; comparing said sample value with a predetermined reference value; and if said sample value is higher than said reference value, concluding that the subject belongs to the first group; and if said sample value is lower than or equal to said reference value, concluding that the subject belongs to the second group. Further, a prognostic method for testicular cancer is provided, as well as means and uses with prognostic and diagnostic applications.

Biomarkers for stroke

Biomarkers for stroke and methods for their detection are disclosed. In one aspect, the present application discloses biomarkers for the diagnosis of stroke in a subject. In another aspect, the application discloses a method for the diagnosis of stroke in a subject. The method comprises detection of stroke biomarkers in cerebrospinal fluid, blood, serum or PMBCs of a subject. Also disclosed is a kit for the detection of biomarkers for the diagnosis of stroke in a subject.

Markers and methods for assessing and treating lupus patients susceptible to photoprovocation

A method for predicting or detecting susceptibility to lupus of an individual subjected to photoprovocation obtains biological samples from the individual before and after exposure to photoprovocation and compares the levels of at least a portion of members of a 45-member panel or subset thereof to determine whether the individual is susceptible to lupus. The method enables identification of potential lupus patients prior to onset of disease symptoms.

Compositions, Kits, and Methods for Predicting Anti-Cancer Response to Anthracyclines

The present invention is based, in part, on the discovery that amplification of human chromosome 8q22-23 regions and over-expression of 8q22-23 genes (e.g., LAPTM4B and YWHAZ) is associated with and predictive of resistance to anthracycline-type chemotherapy. Accordingly, the invention relates to compositions, kits, and methods for predicting the response of cancer cells, e.g., breast, prostate, lung, ovarian, pancreatic, liver, and colon malignancies to anthracyclines.

Genetic markers and diagnostic methods for resistance of breast cancer to hormonal therapies

This application provides a method to identify genetic markers associated with increased sensitivity or resistance to hormonal therapies using an outlier analysis. More specifically, this application discloses that amplifications on chromosomes 8 and 17 are associated with increased proliferation and poor outcome in ER-positive breast cancer, and amplicons 17q21.33-q25.1, 8p11.2 and 8q24.3 may be responsible for higher proliferation and poor outcome in the setting of antiestrogen, in particular Tamoxifen, treatment clinically observed in a subset of ER-positive, HER2-negative breast cancers. The invention also provides use of the identified genetic markers in the development of targeted treatments for antiestrogen-resistant ER-positive breast cancers as well as in improving current methods of drug response prediction.

METHOD OF DIAGNOSING POOR SURVIVAL PROGNOSIS COLON CANCER USING miR-203

The present invention provides novel methods and compositions for the diagnosis and treatment of colon cancers. In particular, the present invention provides diagnostics and prognostics for colon (including colon adenocarcinoma) cancer patients, wherein the methods related to measuring miR levels can predict poor survival. The invention also provides methods of identifying inhibitors of tumorigenesis.

Progesterone receptor membrane component 1 (PGRMC1) as an indicator of fertility in animals

Methods of evaluating fertility of an animal based on determination of a PGRMC1 characteristic that correlates with animal fertility. In one embodiment, a sample is obtained from an animal, a PGRMC1 characteristic is determined and compared to a baseline PGRMC1 characteristic, wherein a variation between the determined PGRMC1 characteristic and the baseline characteristic indicates a level of fertility of the animal. A PGRMC1 characteristic can be one or more of PGRMC1 expression, transcription, translation, amino acid sequence, nucleic acid sequence, post-translational modification, cell localization or tissue localization. A sample can be a cell sample, a tissue sample, a blood sample, a lymphocyte sample, an oocyte sample, or a sperm sample. The animal can be male or female. In one embodiment, a variation of PGRMC1 nucleic acid sequence indicates reduced fertility of the animal.

Methods of Diagnosing Hypophosphatemic Disorders

The present invention relates to methods of diagnosing hypophosphatemic disorders.

Methods and kits for diagnosing osteoarthritis and predicting progression

This disclosure relates to methods and kits for diagnosing osteoarthritis and for determining the progression of osteoarthritis in a subject.

Predicting risk of major adverse cardiac events

Measurement of circulating ST2 and natriuretic peptide (e.g., NT-proBNP) concentrations is useful for the prognostic evaluation of subjects, in particular for the prediction of adverse clinical outcomes, e.g., mortality, transplantation, and heart failure.

Test agent for visceral obesity and use thereof

Disclosed are: a method for detecting (diagnosing) visceral obesity in a subject; a test agent useful for the method; a method for searching for a substance that can be used as an active ingredient for ameliorating visceral obesity; and an ameliorating agent for visceral obesity or a medicinal agent for preventing a metabolic disease developed as a result of the progression of visceral obesity. As the test agent, a polynucleotide which comprises at least 15 nucleotides and can hybridize with a nucleotide sequence for coiled-coil domain containing protein 3 (CCDC3) gene or a nucleotide sequence complementary to the nucleotide sequence under stringent conditions or an antibody capable of recognizing CCDC3 protein is used.

Biomarkers for differentiating melanoma from benign nevus in the skin

Disclosed is a method for diagnosing melanoma in a human subject, as well as a method for providing a prognosis to a human subject who is at risk of developing melanoma recurrence, and a method for determining the stage of melanoma in a human subject, comprising the step of determining the level of expression of phosphatase and actin regulator 1 (PHACTR1) gene, or fragments thereof, either alone or in combination with the level of expression of secreted integrin-binding phosphoprotein (SPP1), preferentially expressed antigen in melanoma (PRAME), growth differentiation factor 15 (GDF 15), and chemokine C-X-C motif ligand 10 (CXCL10) genes. Further, the invention relates to a diagnostic kit, comprising at least one substance for detection of the expression of PHACTR1, or fragments thereof, either alone or in combination with the detection of SPP1, PRAME, GDF15, and CXCL10, for the diagnosis or prognosis of melanoma.

Prognostic and predictive gene signature for non-small cell lung cancer and adjuvant chemotherapy

The application provides methods of prognosing and classifying lung cancer patients into poor survival groups or good survival groups and for determining the benefit of adjuvant chemotherapy by way of a multigene signature. The application also includes kits and computer products for use in the methods of the application.

Expression Levels of COL4A1 and other Markers Correlating with Progression or Non-Progression of Bladder Cancer

Disclosed is determining expression levels protective or harmful markers for bladder cancer prognosis; particularly, determining the expression levels of COL4A3BP alone or in combination with the expression levels of MBNL2, FABP4, and NEK1 or other markers where increased expression levels of these protective markers relative to a control correlates with lack of bladder cancer progression and decreased expression levels correlates with bladder cancer progression or death. Also disclosed is determining the expression levels of COL4A1 alone or in any combination with the expression levels of UBE2C, BIRC5, COL18A1, KPNA2, MSN, ACTA2, and CDC25B or other markers where increased expression levels of these harmful markers relative to a control correlates with bladder cancer progression or death and decreased expression levels correlates with lack of bladder cancer progression Also disclosed are signatures of protective and harmful markers to predict likelihood of bladder cancer progression or non-progression.

miRNAS AS THERAPEUTIC TARGETS IN CANCER

Methods for modulating expression of a component of a cell, comprising contacting the cell with a nucleic acid comprising an miR-140 nucleic acid sequence in an amount sufficient to modulate the cellular component are provided. Overexpression of miR-140 inhibits cell proliferation in both U-2 OS (wt-p53) and HCT 116 (wt-p53) cell lines. Cells transfected with miR-140 are more resistant to chemotherapeutic agent methotrexate, mi-140 expression is related to HDAC4 protein expression. The claimed methods reduce the protein expression level of HDAC4 without degrading the target mRNA.

Methods and compositions for assessing patients with reproductive failure using immune cell-derived microrna

The invention is directed to methods and compositions for collecting immune cells, preferably peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), before or after an intervention, extracting microRNA-comprising RNA from said cells, quantifying microRNAs within the extracted RNA, determining one or more microRNAs that display a bimodal response amongst a statistically sufficient number of patient samples. Patients are then preferably segregated into groups according to their response.

ZNF217 A New Prognostic And Predictive Biomarker Of Recurrent Invasive And Metastatic Phenotypes In Breast Cancer

The present invention relates to methods for determining the prognosis of a cancer. The methods involve determining the level of expression of the ZNF217 gene in a cancer cell sample or in a tumor sample wherein over-expression of ZNF217 is correlated with likelihood of metastasis and with likelihood of relapse/recurrence of the cancer.

Compositions and methods for classifying thyroid nodule disease

A system for classifying thyroid nodule tissue as malignant or benign is provided that is based on the identification of sets of gene transcripts, which are characterized in that changes in expression of each gene transcript within a set of gene transcripts can be correlated to with either malignant or benign thyroid nodule disease. The thyroid classification system provides for sets of “thyroid classifying” target sequences and further provides for combinations of polynucleotide probes and primers derived there from. These combinations of polynucleotide probes can be provided in solution or as an array. The combination of probes and the arrays can be used for diagnosis. The invention further provides further methods of classifying thyroid nodule tissue.

Method for determining predisposition to pulmonary infection

Provided herein are methods and materials for diagnosing a subject's predisposition for pulmonary infection in a CF subject by detecting a pulmonary infection genetic marker. Pulmonary infection markers have been identified in the IL-1 gene cluster and may be useful in predicting CF disease progression and assessing a CF subject's response to therapy.

Real time cleavage assay

A cleavage-based real-time PCR assay method is provided. In general terms, the assay method includes subjecting a reaction mixture comprising a) PCR reagents for amplifying a nucleic acid target, and b) flap cleavage reagents for performing a flap cleavage assay on the amplified nucleic acid target to two sets of thermocycling conditions. No additional reagents are added to the reaction between said first and second sets of cycles and, in each cycle of the second set of cycles, cleavage of a flap probe is measured.

Markers for endometrial cancer

The invention relates to the surprising finding that biomarkers corresponding to ACAA1, AP1M2, CGN, DDR1, EPS8L2, FASTKD1, GMIP, IKBKE, P2RX4, P4HB, PHKG2, PPFIBP2, PPP1 R16A, RASSF7, RNF183, SIRT6, TJP3, EFEMP2, S0CS2, and DCN are differentially expressed in control samples as compared to samples from patients having endometrial cancer and are therefore useful for detecting endometrial cancer. In particular these biomarkers having excellent sensitivity, specificity, and/or the ability to separate affected from non affected individuals. Furthermore, the inventors found that the differential expression of these biomarkers in primary endometrial cancer tumor tissue is correlated to their expression level in uterine fluid samples as compared to control values. Thus these biomarkers are robust in that they are found to be differentially expressed in several different types of samples from affected individuals.

Methods for assessing responsiveness of b-cell lymphoma to treatment with anti-cd40 antibodies

The invention provides methods and kits useful for predicting or assessing responsiveness of a patient having B-cell lymphoma to treatment with anti-CD40 antibodies.

Truncated cd20 protein, deltacd20

The present invention relates in particular to a protein from an alternative splicing of the gene encoding CD20, the nucleic acid sequences encoding the protein according to the invention, a mutated form of the CD20 gene as well as drugs, diagnostic tools, diagnostic methods and treatment methods using the protein and the nucleic acid sequences according to the invention.

Method for renal disease diagnosis and prognosis using annexin a1 and rab23 as markers

Use of Annexin A1 or Rab23 as a biomarker for diagnosing kidney disease or assessing efficacy of kidney disease treatment.

Cytokines as prognostic markers of respiratory-tract infection following major surgery

The invention relates to the use of a certain subset of cytokine markers as prognostic variables of infection status in an individual, and especially as prognostic markers of a patients developing severe infection such as pneumonia, and respiratory tract infection following surgery. The subset of cytokine markers consists of the interleukin cytokines IL-2, IL-7, IL-23, IL-27, and IL-IO, and Interferon-γ (INFγ) and Tissue Necrosis Factor-α (TNFα). The markers may be employed as individual prognostic variables of infection status, or they may be used in pairs or other combinations. Generally, the abundance of the markers is correlated with infection status by means of an absolute pre-operative value of biomarker abundance, ratio's of pre-operative to post-operative biomarker abundance, or ratio values for pairs of certain biomarkers within the subset. Typically, cytokine abundance is expressed in terms of mRNA copy number wherein the copy numbers are ideally normalised to a house keeping gene and quantification of mRNA copy number is determined by RT-PCR containing reference serial dilutions of cytokine specific cDNA.

Scn5a splicing factors and splice variants for use in diagnostic and prognostic methods

Provided herein are methods of identifying a subject at risk for arrhythmias, heart failure or sudden cardiac death. In exemplary aspects, the method comprises the step of determining a level of splicing factor hLuc7a, splicing factor RBM25 and/or PERK in a biological sample obtained from the subject, wherein an increased level, compared to a control level, indicates a risk for arrhythmia or heart failure. The invention also provides methods of diagnosing hypertrophic cardiomyopathy (HCM), or a risk therefor, in a subject. The method comprises the step of determining a level of E28D, RBM25, PRPF40A, or LUC7L3, or a combination thereof, in a biological sample obtained from the subject, wherein an increased level is indicative of the subject having HCM or a risk therefor. Diagnostic kits comprising binding agents for the markers are furthermore provided.

Marker and reagent for detection of human il-17-producing helper t cells, and method for detection of human il-17-producing helper t cells

The present invention relates to a marker allowing specific detection of human IL-17-producing helper T-cells (human Th17 cells), a method for specifically detecting human Th17 cells and a reagent for detecting human Th17 cells.

Tomato hybrid ps 01565172

The invention provides seed and plants of tomato hybrid PS 01565172 and the parent lines thereof. The invention thus relates to the plants, seeds and tissue cultures of tomato hybrid PS 01565172 and the parent lines thereof, and to methods for producing a tomato plant produced by crossing such plants with themselves or with another tomato plant, such as a plant of another genotype. The invention further relates to seeds and plants produced by such crossing. The invention further relates to parts of such plants, including the fruit and gametes of such plants.

Use of pkc isozymes for diagnosis and treatment of neuroblastoma

The present invention pertains to the use of PKC-epsilon (PKC-ε), PKC-delta (PKC-δ), PKC-eta, and/or PKC-theta as biomarker(s) for prediction and/or detection of neuroblastoma, as well as therapeutic targets for treatment of neuroblastoma.

Diagnostic transcriptomic biomarkers in inflammatory cardiomyopathies

Molecular signatures that function as very sensitive diagnostic biomarker for myocarditis, heart disease and disorders thereof, are identified.

Caspase-8 and skin disease

The invention relates to the treatment or prevention of an inflammatory skin disease, disorder or condition, by modulating a protein that is normally regulated by caspase-8 in the skin or by increasing caspase-8 activity or level in the skin. Another aspect of the invention relates to methods for diagnosing an inflammatory skin disease, disorder or condition or a predisposition to develop said disease disorder or condition in an individual. Further aspects of the invention relate to methods for identifying target proteins involved in the course or pathology of an inflammatory skin disease, disorder or condition and to methods of screening a candidate compound for treating said disease, disorder or condition. In particular, the invention relates to inflammatory skin diseases such as atopic dermatitis and psoriasis.

Genetic Variants in the TCF7L2 Gene as Diagnostic Markers for Risk of Type 2 Diabetes Mellitus

Polymorphisms in the gene TCF7L2 are shown by association analysis to be a susceptibility gene for type II diabetes. Methods of diagnosis of susceptibility to diabetes, of decreased susceptibility to diabetes and protection against diabetes, are described, as are methods of treatment for type II diabetes.

Composition for diagnosis of liver metastasis of colorectal cancer and the use thereof

The present invention relates to a composition for diagnosis of liver metastasis of colorectal cancer and the use thereof, and more particularly to a composition for diagnosis of liver metastasis of colorectal cancer, which comprises either a substance for measuring the mRNA level of CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) gene or a substance for measuring the level of a protein which is encoded by the gene. According to the present invention, whether liver metastasis of colorectal cancer occurred can be diagnosed by measuring the mRNA expression level of the CCL7 gene or the expression level of the CCL7 protein, and the use of the composition comprising an inhibitor of CCL7 gene allows the treatment of colorectal cancer or the liver metastasis of colorectal cancer.

miRNA FINGERPRINT IN THE DIAGNOSIS OF MULTIPLE SCLEROSIS

The present invention provides novel methods for diagnosing diseases based on the determination of specific miR-NAs that have altered expression levels in disease states compared to healthy controls.

Identification of Inhibitors of a Bacterial Stress Response

A system, a composition, a method and a kit for identifying anti-bacterial agents are provided. The invention described herein is useful in identifying inhibitors of any bacterial stress response. Moreover, the invention can be applied to any sRNA and its target, any transcription factor and its target, and any transcription factor/sRNA pair (i.e., a transcription factor that regulates a sRNA). In particular, the present invention provides a system, a composition, a method and a kit for the identification of cyclic peptides that block the σ E pathway in Escherichia coli.

Extracellular vesicles derived from gram-positive bacteria, and use thereof

The present application relates to extracellular vesicles (EVs) derived from gram-positive bacteria. In detail, the present application provides animal models of disease using extracellular vesicles derived from gram-positive bacteria, provides a method for screening an active candidate substance which is capable of preventing or treating diseases through the animal models of disease, provides vaccines for preventing or treating diseases caused by extracellular vesicles derived from gram-positive bacteria, and provides a method for diagnosing the causative factors of diseases caused by gram-positive bacteria using extracellular vesicles.

Further use of protein kinase n beta

The present invention is related to use of protein kinase N beta or a fragment or derivative thereof as a downstream target of the PI 3-kinase pathway, preferably as a downstream drug target of the PI 3-kinase pathway.

Biomarkers and uses thereof in prognosis and treatment strategies for right-side colon cancer disease and left-side colon cancer disease

Genetic biomarkers for left side colon cancer (LCC) (such as expression levels of an RNA transcript or expression product of NOX4, MMP3, or a combination) and right side colon cancer (RCC) (such as expression levels of an RNA transcript or expression product of CDCX2, FAM69A, or a combination), are disclosed. Methods for using the biomarkers in providing a prognosis of relapse-free survival probability in patients having LCC or RCC are also presented. Prognostic panels using gene expression values of the biomarkers are also presented. Computer implemented methods employing the biomarkers, and as well as for determining relapse-free survival probability in a patient having RCC or LCC are provided. A genetic method for classifying a colon cancer tissue as a RCC or as a LCC is also disclosed.

Pnmt as a novel marker for progenitor cells

In certain aspects, the present invention provides methods and compositions relating to a Pnmt-positive progenitor cell. In certain aspects, the present invention relates to methods for isolating and transplanting the subject progenitor cells, and methods for treating diseases such as myocardiac injuries and neurodegenerative disorders.

Determination of fetal aneuploidy by quantification of genomic dna from mixed samples

The present invention provides systems, apparatuses, and methods to detect the presence of fetal cells when mixed with a population of maternal cells in a sample and to test fetal abnormalities, i.e. aneuploidy. In addition, the present invention provides methods to determine when there are insufficient fetal cells for a determination and report a non-informative case. The present invention involves quantifying regions of genomic DNA from a mixed sample. More particularly the invention involves quantifying DNA polymorphisms from the mixed sample.

Methods and compositions for determining severity of heart failure in a subject

The application provides a method of determining a severity of heart failure in a human test subject, by determining a level of RNA encoded by one or more heart failure marker genes in blood of the test subject compared to controls.

Nucleic acid and corresponding protein entitled 193p1e1b useful in treatment and detection of cancer

A novel gene 0193P1E1B (also designated 193P1E1B) and its encoded protein, and variants thereof, are described wherein 193P1E1B exhibits tissue specific expression in normal adult tissue, and is aberrantly expressed in the cancers listed in Table I. Consequently, 193P1E1B provides a diagnostic, prognostic, prophylactic and/or therapeutic target for cancer. The 193P1E1B gene or fragment thereof, or its encoded protein, or variants thereof, or a fragment thereof, can be used to elicit a humoral or cellular immune response; antibodies or T cells reactive with 193P1E1B can be used in active or passive immunization.

Drg11-responsive (dragon) gene family

This invention features methods and compositions useful for treating and diagnosing diseases of the nervous system, retina, skin, muscle, joint, and cartilage using a Dragon family protein. Protein and nucleic acid sequences of human, murine, zebrafish, and C. elegans Dragon family members are also disclosed.

Diagnostic and Therapeutic Uses for B Cell Maturation Antigen

Biomarkers and therapies against autoimmune diseases, including systemic lupus erythematosus (SLE) are described herein. The present invention is based on the discovery of B cell maturation antigen (BCMA) and BCMA variant expression on SLE monocytes that can be directly associated with disease activity. The findings of the present invention enable the design of monoclonal antibodies or recombinant proteins that can block BCMA and BCMA variants as well as BCMA-bound APRIL.

Methods for Diagnosing Colon Cancer Using MicroRNAs

The present invention provides novel methods and compositions for the diagnosis and treatment of solid cancers. The invention also provides methods of identifying inhibitors of tumorigenesis.

Application of quantum dots for nuclear staining

Embodiments of a system, method, and kit for visualizing a nucleus are disclosed. A tissue sample is pretreated with a protease to permeabilize the nucleus, and then incubated with a nanoparticle/DNA-binding moiety conjugate. The DNA-binding moiety includes at least one DNA-binding molecule. The conjugate binds to DNA within the nucleus, and the nanoparticle is visualized, thereby visualizing the nucleus. Computer and image analysis techniques are used to evaluate nuclear features such as chromosomal distribution, ploidy, shape, size, texture features, and/or contextual features. The method may be used in combination with other multiplexed tests on the tissue sample, including fluorescence in situ hybridization. Kits for performing the method include a protease enzyme composition, a nanoparticle/DNA-binding moiety conjugate, and a reaction buffer.

Methods for treating cancer in patients having igf-1r inhibitor resistance

A method for treating cancer comprising identifying a mammal that overexpresses breast cancer resistance protein; and administering to said mammal a pharmaceutical composition comprising a therapeutically effective amount of ixabepilone. In one aspect, the mammal is not administered an agent that is susceptible to breast cancer resistance protein overexpression resistance. In another aspect, the cancer is a solid tumor.

Methods for identifying, diagnosing, and predicting survival of lymphomas

Gene expression data provides a basis for more accurate identification and diagnosis of lymphoproliferative disorders. In addition, gene expression data can be used to develop more accurate predictors of survival. The present invention discloses methods for identifying, diagnosing, and predicting survival in a lymphoma or lymphoproliferative disorder on the basis of gene expression patterns. The invention discloses a novel microarray, the Lymph Dx microarray, for obtaining gene expression data from a lymphoma sample. The invention also discloses a variety of methods for utilizing lymphoma gene expression data to determine the identity of a particular lymphoma and to predict survival in a subject diagnosed with a particular lymphoma. This information will be useful in developing the therapeutic approach to be used with a particular subject.

Marker associated with non-alcoholic steatohepatitis

Disclosed is a novel NASH marker for use in a method for detecting NASH or evaluating the severity of NASH, which utilizes at least one factor selected from the group consisting of an IL-1 receptor antagonist, sCD40, HMGB1, sPLA2 group IIA and an sPLA2 activity as the marker. Also disclosed is a method for detecting NASH or evaluating the severity of NASH in a subject, which utilizes the marker.

Compositions and methods for prognosis and treatment of prostate cancer

Described herein are compositions and methods for prognosis and treatment of prostate cancer patients. Specifically the invention relates to microRNA molecules associated with the prognosis of prostate cancer, as well as various nucleic acid molecules relating thereto or derived therefrom.

Novel tumor marker determination

A method of determining gynaecologic tumor disease in a subject by providing a sample of peripheral blood of the subject, measuring the PPIC expression of cells in the sample, and comparing this to a reference value, the PPIC overexpression being indicative of a gynecologic tumor disease and/or disease progression, including metastatic potential in a gynecologic cancer patient.

SPLICE VARIANTS OF HUMAN IL-23 RECEPTOR (IL-23R) mRNA AND USE OF A DELTA9 ISOFORM IN PREDICTING INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

There is disclosed the cloning and identification of human IL-23R splice variants caused by alternative splicing of the IL-23R mRNA in human. Alternative mRNA forms occur through skipping one, multiple full exons or partial exons, within the IL-23R gene. A total of twenty-five (25) different IL-23R transcripts were identified. A novel exon deletion (exon 9) isoform in the interleukin 23 receptor is disclosed, denoted as Δ9. The present application also describes a quantitative assay to measure different IL-23R isoform. Detection of Δ9 isoform of IL-23R is predominantly present in colon and cervical tissues. A decrease in Δ9 is observed in inflamed colon tissues in Crohn's patients. There is disclosed a method of predicting Crohn's disease by measuring Δ9 isoform of IL-23R.

Methods and compositions relating to neuronal cell and tissue differentiation

The invention relates to methods for isolating and purifying specific types of neurons, such as cortical or other projection neurons including corticospinal motor neurons, subcerebral projection neurons, and callosal projection neurons. The invention also relates to genes that are specific for particular neuronal subtypes, and the use of such genes in genetic/molecular control of cell development. The isolated cells and subtype-specific genes also have uses in diagnostics, therapeutics, and screening assays for pharmaceutical molecules.

Methods and compositions for determining the responsiveness of cancer therapeutics

The present invention relates to methods for predicting the responsiveness of a patient to a breast cancer treatment regimen by assaying a biological sample to determine the level of expression of the long-chain fatty acyl-CoA synthetase 4 (ACSL4) in the biological sample. The present invention also provides ACSL4 inhibitors and uses of ACSL4 inhibitors as adjuvant therapies in breast cancer treatment regimens.

Method of therapy and diagnosis of atherosclerosis

There is provided a method of therapy of atherosclerosis, by providing microRNA let-7g, an analogue thereof or modified let-7g to organisms to inhibit the expression of lectin-like oxidized low density lipoprotein receptor-1 (LOX-1), and the binding of LOX-1 and oxidized low-density lipoprotein (oxLDL), so as to block the pathogenesis of atherosclerosis. Also, a method of diagnosis of atherosclerosis comprises determining the levels of microRNA let-7g in serum or plasma samples of organisms, in which the levels of microRNA let-7g is estimated in individuals with atherosclerosis as compared to individuals without atherosclerosis.

Treatment of cancer and compositions

The invention discloses a method of identifying a gene associated with stage III primary cancer or lymph node metastasis. The genes so identified include CAV1, CST3, LIMK1, MMP2, MMP15, VEGF, ETV4, MMP9, PIK3C2B, and SERPIN1. Also disclosed are methods for diagnosis, prognosis, and treatment of cancer. The invention further discloses compositions for preventing and treating diseases.

Method for characterizing host immune funtion by ex vivo induction of offensive and defensive immune markers

A host's immune function can be characterized by quantifying changes in offensive and defensive immune function associated markers. Certain methods can be used to identify a potentially efficacious therapy for a subject based on the induction of expression of offensive and defensive immune function-associated markers. Additionally, some methods can be used to identify drugs that allow the stimulation of either the offensive or defensive immune response while inhibiting the other of offensive or defensive immune response.

Treatment and Prevention of Dengue Virus Infections

Methods and pharmaceutical compositions for treating viral infections, by administering certain 2 -aryl-benzothiazole or 2 -heteroaryl-benzothiazole derivative compounds in therapeutically effective amounts are disclosed. Methods of using the compounds and pharmaceutical compositions thereof are also disclosed. In particular, the treatment and prophylaxis of viral infections such as caused by flavivirus is disclosed, i.e., including but not limited to, Dengue virus, West Nile virus, yellow fever virus, Japanese encephalitis virus, and tick-borne encephalitis virus.

Method to identify a novel class of immunologic adjuvants

Methods of identifying an adjuvant capable of activating dendritic cells including measuring expression level genes in skin of an animal prior to exposure to a test compound, wherein the genes are known to be upregulated or downregulated in the skin of the animal in response to topical application of dibutyl phthalate (DBP) to skin of said animal; exposing skin of an animal of the same species to the test compound; measuring expression level of the genes in the skin of the animal after exposure to the test compound; and comparing expression level of the genes measured before and after exposure to the test compound, wherein an increase or decrease in expression level of the genes following exposure to the test compound indicates that the test compound is capable of activating dendritic cells. Also included are compositions that induce dendritic cell migration and modulate expression level of genes in skin cells.

Human papilloma virus probes for the diagnosis of cancer

In one embodiment, the invention relates to a method of detecting cervical cancer, and other types of cancer, using a combination of at least three genomic clones, or fragments thereof, of high risk Human Papilloma Virus. For example, the invention relates to a composition comprising at least three full length genomic clones, or fragments thereof, of high risk Human Papilloma Viruses.

Simultaneous detection of mutational status and gene copy number

The present invention provides compositions and methods for simultaneously detecting mutational status and gene copy number. In particular, the present invention provides simultaneous measurement of gene copy number and detection of the L858R and Exon 19 del mutations in a tissue sample.

Methods for treating depression using ncam peptide mimetics

The present application relates to the treatment and diagnosis of mood disorders, including bipolar disorder, major depression disorder and schizophrenia. The invention provides novel diagnostic markers and assays, as well as research tools for the development and discovery of agents and compounds which are useful for treating patients who suffer from mental illness.

Method for screening induced pluripotent stem cells

The present invention relates to miRNA or genes expressed in induced pluripotent stem cells, and a method for screening for induced pluripotent stem cells having functions equivalent to those of embryonic stem cells by confirming methylation of specific gene regions of induced pluripotent stem cells.

Methods for measuring enhancement in the quality of life of an animal

A method to measure enhancement in the quality of life of an animal fed a super senior pet food composition comprising quantitating the gene expression levels of one or more genes in said animal and comparing said levels in the animal to levels in the animal prior to administration of said super senior pet food composition. A method to enhance the quality of life of an animal by modulating the expression level of one or more genes in said animal in order to mimic the pattern of expression seen in vivo after administration of a super senior pet food composition.

Diagnosis of breast cancer based on expression level of thioredoxin-1

The present disclosure relates to a diagnostic marker for breast cancer, having thioredoxin-1 as an active ingredient, and to a diagnostic kit for breast cancer using the same. The thioredoxin-1 is overexpressed in human breast cancer tissue so as to enable the early diagnosis of breast cancer or the early prediction prognosis of breast cancer, and therefore has a valuable use as a diagnostic marker for breast cancer. The present disclosure further relates to a method for the diagnosis of breast cancer comprising measuring serum thioredoxin 1 level. In addition, the method is useful in the early diagnosis of breast cancer thanks to its high diagnostic sensitivity and selectivity.

Weight management genetic test systems and methods

Disclosed herein is a nutritional genomic weight management algorithm running on a computer system, and more specifically, a nutritional genomic weight management algorithm where an analysis of a customer's unique DNA results in individualized diet and exercise plans, in accordance with the present invention. Methods of weight management, weight management business methods, and panels of alleles for nutritional genomics are also disclosed.

Detecting DNA Mismatch Repair-Deficient Colorectal Cancers

Use of a CAT25 mononucleotide marker in a novel tetraplex PCR for the detection of MSH6-defective colorectal cancers (CRCs) is described herein. The tetraplex PCR of the present invention offers a facile, robust, less expensive (compared to the original pentaplex assay), highly sensitive, and specific assay for the identification of microsatellite instability (MSI) in CRCs.

Novel use of ca-125

Provided is novel use of CA-125. As it is discovered that CA-125 level are positively associated with bone mineral density, thereby CA-125 can be used in biomarker to diagnose osteoporosis or osteopenia, or extent of growth plate development.

Method for screening ameliorants of dry skin caused by atopic dermatitis using bleomycin hydrolase activity as indicator

The present invention provides a method for screening and evaluating ameliorants of dry skin caused by atopic dermatitis, comprising: evaluating a candidate drug as being an ameliorant of dry skin caused by atopic dermatitis in the case the candidate drug significantly increases expression and/or activity of bleomycin hydrolase in comparison with a control drug.

Oligonucleotide sequence formula for labeling oligonucleotide probes and proteins for in-situ analysis

The present invention provides oligonucleotide probes and oligonucleotide probe collections for detecting or localizing a plurality nucleic acid target genes within a cell or tissue sample. Specifically, the invention provides collections of oligonucleotide probes for use in in situ hybridization analyses in which each probe has a label-domain with the sequence formulas of (CTATTTT) n CT, (AAAATAG) n or (TTTTATC) n or (GATAAAA) n in which all cases “n” would equal 1 or greater. The present invention also provides collections or “cocktails” of oligonucleotide probes for detecting or localizing specific nucleic acid target genes within a cell or tissue sample.

Development of Novel Detergents for Use in PCR Systems

This disclosure relates to novel detergents for use in various procedures including, for example, nucleic acid amplification reactions such as polymerase chain reaction (PCR). Methods for preparing the modified detergents are also described.

Predicting benefit of anti-cancer therapy via array comparative genomic hybridization

Array comparative genomic hybridization classifiers, arrays comprising the classifiers, and related methods of using the same for predicting the therapeutic efficacy of anti-cancer therapy by detecting phenotypic genetic traits using comparative genomic hybridization are disclosed.

Methods and compositions for modulating the activity of the interleukin-35 receptor complex

The receptor for Interleukin 35 (IL-35) is provided. The Interleukin 35 Receptor (IL-35R) comprises a heterodimeric complex of the Interluekin12Rβ2 receptor and the gp130 receptor. Various compositions comprising the IL-35R complex, along with polynucleotides encoding the same and kits and methods for the detection of the same the same are provided. Methods of modulating the activity of IL-35R or modulating effector T cell functions are also provided. Such methods employ various IL-35R antagonists and agonists that modulate the activity of the IL-35R complex and, in some embodiments, modulate effector T cell function. Further provided are methods for screening for IL-35R binding agents and for IL-35R modulating agents. Various methods of treatment are further provided.

Methods and compositions for predicting cancer therapy response

The invention generally relates to molecular diagnostics, and particularly to molecular markers for cancer therapy response and methods of use thereof.

Novel Biomarker Indicative of Ischemic Brain Injury and Its Use

The present invention relates to a method for detecting neuronal injury in a mammalian subject. The biomarker of this invention specifically increases in serum of the mammalian that has neuronal injuries. In addition, the biomarker of this invention permits to identify and predict neuronal injuries.

Diagnostic and Prognostic Markers for Cancer

Compositions and methods useful for diagnosis and prognosis of cancer are provided.

Methods and materials for detecting colorectal cancer and adenoma

The present invention provides methods and materials related to the detection of colorectal neoplasm-specific markers (e.g., markers associated with colorectal cancer, markers associated with adenoma) in or associated with a subject's stool sample. In particular, the present invention provides methods and materials for identifying mammals (e.g., humans) having a colorectal neoplasm by detecting the presence and level of indicators of colorectal neoplasia such as, for example, long DNA (e.g., quantified by Alu PCR) and the presence and level of tumor-associated gene alterations (e.g., mutations in KRAS, APC, melanoma antigen gene, p53, BRAF, BAT26, PIK3CA) or epigenetic alterations (e.g., DNA methylation) (e.g., CpG methylation) (e.g., CpG methylation in coding or regulatory regions of bmp-3, bmp-4, SFRP2, vimentin, septin9, ALX4, EYA4, TFPI2, NDRG4, FOXE1) in DNA from a stool sample obtained from the mammal.

Marker for diagnosis of breast cancer, test method, and test kit

An embodiment of the present invention provides a marker, a test method, and a test kit which can detect the onset of breast cancer that cannot be detected by palpation or mammography examination or breast cancer in an early stage (clinical stage 0), which are simple, and which have high reliability. A marker associated with breast cancer of an embodiment of the present invention is characterized by being a micro-RNA that is found in serum or plasma. More specifically, the marker contains at least a micro-RNA that is present in the serum or the plasma at a significantly reduced level after the onset of breast cancer, or during or after an early stage (during or after clinical stage 0) of breast cancer compared with that before the onset of breast cancer or before the early stage (before clinical stage 0) of breast cancer.

Methods of diagnosing endometriosis

The present invention provides biomarkers for the diagnosis and prognosis of endometriosis. Generally, the methods of this invention find use in diagnosing or for providing a prognosis for endometriosis by detecting the expression levels of biomarkers, which are differentially expressed (up- or down-regulated) in endometrial cells from a patient with endometriosis. Similarly, these markers can be used to diagnose reduced fertility in a patient with endometriosis or to provide a prognosis for a fertility trial in a patient suffering from endometriosis. The present invention also provides methods of identifying a compound for treating or preventing endometriosis. Finally, the present invention provides kits for the diagnosis or prognosis of endometriosis.

Methods of Assessing Chromosomal Instabilities

Method of assessing or quantifying chromosomal instability in a subject, wherein the sample is obtained from an effluent, lavage, or organ wash. Methods of obtaining a whole genome sequence from an effluent, lavage, or organ wash.

Identification of Tumors

The invention provides methods for the use of gene expression measurements to classify or identify tumors in samples obtained from a subject in a clinical setting, such as in cases of formalin fixed, paraffin embedded (FFPE) samples.

Markers and assays for detection of neurotoxicity

A process and assay for diagnosing neurotoxicity in a subject is provided. The extent of a neurotoxic insult to a subject is assessed through the measurement of one or more biomarkers in a biological fluid, such as CSF or serum. Other uses and advantages afforded include pre-market drug discovery, monitoring, drug neurotoxicity screening and post market assessment of safety and monitoring for drug of known potential neurotoxicity.

Nucleotide sequences and corresponding polypeptides conferring modulated plant characteristics

The present invention relates to isolated nucleic acid molecules and their corresponding encoded polypeptides. The present invention further relates to the uses of these nucleic acid molecules and polypeptides. For example, the nucleic acid molecules and polypeptides could be used in making enzymes or used to make plants, plant cells, plant materials or seeds of a plant having such modulated growth or phenotype characteristics that are altered with respect to wild type plants grown under similar conditions.

Means and methods for diagnosing pancreatic cancer

The present invention pertains to the field of cancer diagnosis. Specifically, it relates to a method for diagnosing pancreas cancer in a subject comprising the steps of determining in a sample of a subject suspected to suffer from pancreas cancer the amount of at least one biomarker selected from the biomarkers shown in Table 1 and comparing the said amount of the at least one biomarker with a reference, whereby pancreas cancer is to be diagnosed. The present invention also contemplates a method for identifying whether a subject is in need of a pancreas cancer therapy comprising the steps of the aforementioned methods and the further step of identifying a subject in need of a pancreas cancer therapy if said subject is to be diagnosed to suffer from pancreas cancer. Contemplated are, furthermore, diagnostic devices and kits for carrying out said methods.

Genes differentially expressed by cumulus cells and assays using same to identify pregnancy competent oocytes

A genetic means of identifying “pregnancy competent” oocytes is provided. The means comprises detecting the level of expression of one or more genes that are expressed at characteristic levels (upregulated or downregulated) in cumulus cells derived from pregnancy competent oocytes. This characteristic gene expression level, or pattern referred to herein as the “pregnancy signature”, also can be used to identify subjects with under-lying conditions that impair or prevent the development of a viable pregnancy, e.g., pre-menopausal condition, other hormonal dysfunction, ovarian dysfunction, ovarian cyst, cancer or other cell proliferation disorder, autoimmune disease and the like. In preferred embodiments the pregnancy signature will comprise one or more of AB-CA6, NCAM1, OLFML3, PTPRA, SDF4, GPR137B, DDIT4, DUSP1, GPR137B, IDUA, KCTD5, NDNL2, SLC26A3, and TERF2IP.

Mirna fingerprint in the diagnosis of prostate cancer

MicroRNAs (miRNA) are a recently discovered class of small non-coding RNAs (17-14 nucleotides). Due to their function as regulators of gene expression they play a critical role both in physiological and in pathological processes, such as cancer. The present invention provides novel methods for diagnosing a state of health based on the determination of specific miRNAs that have altered expression levels in different conditions, e.g. disease states compared to healthy controls.